课题组介绍
陈放课题组(Chen Lab)依托于同济大学医学院/同济大学附属东方医院心脏病全国重点实验室,通过统计遗传学方法开发,大规模基因组学,单细胞基因组学和多组学数据分析,对复杂疾病(如肺纤维化,心血管疾病,药物成瘾等)的分子遗传机制进行探索,从而揭示疾病发生、发展过程,识别关键生物学标志物,发掘潜在药物干预靶点,为治疗复杂疾病提供新的策略和方向。课题组所在重点实验室设备齐全,经费充足;课题组目前已有科研副教授一名,专职科研行政秘书一名,能够为科研人员提供一个优异的科研环境和良好的职业发展支撑。
实验室将聚焦于统计遗传学新方法开发,机器学习和大数据技术在复杂疾病遗传分析的应用等前沿领域;结合单细胞测序技术,前沿大数据和多组学技术,开发新算法和工具,深入开展复杂疾病的关键基因鉴定和遗传结构解析,推进临床转化应用研究。
具体三个方向的研究内容包括:
深入东亚人群复杂疾病(如肺纤维化,心血管疾病等)的研究,筛选东亚人群中相关疾病的特异位点;通过单细胞分析和机器学习方法,构建复杂疾病单细胞图谱,优化心血管疾病预防模型,推动精准医学和公共卫生预防研究的转化应用开发。
推进新药靶点验证和药物重定位临床转化,通过机器学习方法开发,干湿结合验证,进行药物靶点发掘和鉴定;
开展复杂疾病方向大数据分析和统计遗传新算法、新工具的开发,保持前沿领域国际合作。
招聘岗位:博士后(计算或实验方向,2-3名,详见岗位说明)
岗位基本职责:
1、与导师合作,提出科学问题、开展课题研究;
2、有扎实的相关专业基础和优良的科学逻辑思维,具备独立的实验方案设计,和实施相关科研工作的能力;
3、具有熟练的中英文阅读理解及书写能力;具备科研论文和基金的撰写能力,能够积极依托课题组申请博士后科学基金、国家自然科学基金委青年项目及自身课题相关基金;
4、具备良好的沟通能力及团队合作精神。
岗位1:博士后(生物信息,单细胞及多组学计算方向)
1、具有计算机、生物信息学、流行病与卫生统计学、统计(遗传)学等计算背景,获得相关专业博士学位,或近期将取得博士学位;
2、熟悉常用的统计和机器学习方法,熟悉至少一门编程语言(PythonR等),熟悉Linux操作系统;
3、近3年在功能基因组学、单细胞测序领域有相关研究经验者(熟悉RNA-seq,ATAC-seq,eQTL analysis,scRNA-seq等)优先;
4、博士期间受过良好的科研训练,在国际期刊上以第一作者发表过研究论文(1-2篇);
5、入选者将从事复杂疾病单细胞分析、功能基因组学或人工智能在新药研发中应用等相关领域的前沿研究工作。
岗位2:博士后(基因组学,单细胞及多组学实验方向)
1、具有生物学、基础医学或药学等相关专业博士学位,或近期将取得博士学位;
2、开展分子遗传学、功能基因组学等相关研究,采用细胞/动物模型、单细胞多组学、空间组学、iPSC、MPRA、CRISPR等技术,探究疾病遗传调控机制。
3、近3年在单细胞测序、功能基因组学和转化医学领域有相关研究经验者优先;
4、博士期间受过良好的科研训练,在国际期刊上以第一作者发表过研究论文(1-2篇);
5、入选者将从事复杂疾病单细胞分析、功能基因组学等相关领域的前沿研究工作。
6、对于感兴趣的研究人员,课题组将为其提供计算方向(生物信息学相关)基本科研培训。
岗位待遇:
所有入选人员自动入选同济大学附属东方医院双聘体系,额外获得东方医院考核绩效和科研考核奖励;
基本薪资构成:同济大学基础年薪和附属东方医院考核津贴。基础年薪30万元/年;东方医院考核津贴6-9万元/年(良好6万,优秀9万)。
额外科研奖励:论文和基金项目等科研奖励另计,由东方医院参照标准发放。课题组另提供1-3万匹配奖励(出站后政策仍然延续)。
人才项目激励:入选上海市超级博士后,基础年薪提升至36万元;入选国家博新计划者基础年薪提升至42万元。资助期内另外享受附属东方医院奖励6万元/年和课题组奖励。
享受同济大学职工福利待遇及职工同等的医疗保障待遇;
课题组全力协助申报博士后相关项目,根据入选者研究兴趣,共同协商规划职业发展规划。聘期结束后,根据科研成果进行评定,优秀博士后可优先留任,聘为副研究员及以上职位。
应聘程序:
请申请人提供个人简历和不超过2页的申请信(即cover letter,包括研究兴趣、拟入职时间等信息),博士后岗位请提供2-3位推荐人的信息和联系方式。请将应聘材料发送至[email protected] (烦请抄送:[email protected] ),邮件标题请注明"应聘-岗位(如1/2)-姓名"。应聘材料将予以严格保密,课题组将会尽快对符合要求申请者安排面试。
其他说明1)本招聘长期有效,直至招满相应岗位为止。2)所有邮件将会收到人工回复,所发邮件若一周内未回复,烦请再次提醒。3)课题组每年均有一定数量博士生和硕士生名额,欢迎对课题组研究方向感兴趣的同学联系,交流。4)如果对课题组研究方向感兴趣,但未达到博士后要求人员,课题也设有科研助理职位,欢迎联系咨询。
课题组PI简介:
陈放博士,毕业于上海复旦大学遗传所遗传工程国家重点实验室,博士期间从事医学分子遗传学相关研究。博士后期间在宾州州立大学医学院从事复杂性状/疾病基因组学,统计遗传学和人工智能与精准医学前沿领域研究,运用大数据方法深度解析了烟酒成瘾的遗传图谱和遗传多样性;针对复杂性状/疾病中关键基因的鉴定和功能分析,开发了众多面向实际需求的新算法和开源工具。于2024年加入同济大学医学院,任研究员、博士生导师;同时担任同济大学附属东方医院特聘教授/研究员,心脏病全国重点实验室PI。获国家高层次青年人才计划、上海市海外高层次人才引进项目、美国人类遗传学会研究奖(Charles J. Epstein Trainee Research Award - semifinalist)等。陈放博士的相关科研成果包括Nature Genetics (第一作者), Nature(第一作者),Nature Communications,Genome Research 和 Molecular Psychiatry 等国际期刊 10 余篇;单篇论文引用率>1200次。并多次在行业内顶级学术会议:美国人类遗传学年会(ASHG)发表大会主题演讲;开发了可应用于超过3百万人大样本的遗传分析新方法和工具;将机器学习方法运用于疾病靶点鉴定和药物开发。