这是生信书房专栏的第57本推荐。距离2021年7月的第一篇《单细胞测序方法和应用》已经过去三年多。说是生信书房,其实也关注到了生物学的新进展。既有R、Python、Perl的介绍,也是有生物信息学教材,更有《进化》、《尼安德特人》、《细胞简史》这样的科普读物。
这一期和大家介绍的是《细胞传》。这是普利策奖得主悉达多·穆克吉继《癌症传》《基因传》之后的新作。书的腰封上写着:
从基因世纪到细胞世纪
探索医学和新人类的无限可能
尽管在细胞生物学历史故事梗概的选取上和《细胞简史》有些许重叠,但是叙事风格还是有很大的不同。《细胞传》不仅是细胞生物学的编年史,更是一位医生和学者对细胞,或者说对现代医学和新人类的思考。
像《癌症传》、《基因传》的叙事风格一样,作者在每一章的开头都引用一段引人入胜的题记,其中一个是
细胞是……一个枢纽:是连接不同学科、方法、技术、概念、结构与过程的关键。之所以它对生命、生命科学和其他领域如此重要,是因为它作为一种枢纽具有无与伦比的地位,以及细胞在这种联系中明显拥有无穷的潜力。——微生物学哲学家莫琳·安妮·奥马利与科学史学家斯塔凡·米勒-维勒
这一描述同样适用于细胞生物学领域正在发生的变化,就是单细胞测序技术为之带来的新视角、新境界、新理解。我常常在想:为什么单细胞测序技术能如此广泛地被生命科学家关注到?原来不仅是测序技术带来的多组学应用的广泛性,更有细胞这个枢纽,是它这个生命的基本结构和功能单位,把不同学科、方法、技术、概念、结构与过程桥接在一起的。
我们知道作者悉达多·穆克吉是一个把生活经验与宏大的历史叙事结合在一起的高手,这拉了读者与作者与遥远历史事件距离。加上生动的场景构建,也把读者带到历史关键事件的现场,这让我们对细胞生物学的历史有着更加深刻的理解。
读《细胞传》,不像是在读历史,因为在阅读过程中,我们一刻也没离开对现实的思考:我们对细胞的理解,如何有益于人类健康。从中世纪的血液回输,到现在的细胞治疗,我们对细胞的认识每进一步,对人类自身健康和疾病的认识就更近一步。随之而来的细胞生物学的技术,也就能更加有益于人类健康。
关于测序技术在细胞生物学领域的广泛应用,书中这样评论道:
测序是一种诱惑。它提供数据,而不是知识。那么“真正对临床有用的信息”在哪里呢?我相信,它位于癌细胞携带的突变与细胞本身身份之间的某个交汇点。以下是背景信息。它的细胞类型(肺?肝?胰腺?),它生活与生长的地方,它的胚胎起源及其发育路径,赋予细胞独特身份的特殊因素,维持其生存所需的营养物质,以及它所依赖的邻近细胞。
除了近距离思考细胞生物学技术如何有益于人类健康,另一个贯穿本书的中心思想(暗线)是:细胞如何构成更好版本的自我。我们是由细胞构成的,而每一个细胞都是一个生命,它们聚集在一起,协同工作,有条不紊地让“我”这个大机器高速运转几十年。这想想都让人疯狂,四十万亿个细胞,它们如何找好自己的定位的?
我们对细胞的理解会不会构造一个更好版本的“自我”呢?我不知道,但是清楚的一点是:对细胞的理解,对基本的生命粒子的理解,将让我们在更加微观和生态的视角下审视自己的一生。
就像相对论提出来之后,不仅革新了物理学家对宇宙的理解一样,更促进了人类对自身所处空间的思考一样。随着我们对生命基本粒子的理解,我们的人生观也将得到一次新的升华。
序言 “生物体的基本粒子”
引言 “我们终将回到细胞”
第一部分 发现
第一章 原始的细胞:隐形的世界
第二章 可见的细胞:“关于小动物的虚构故事”
第三章 万能的细胞:“这个小世界中最小的粒子”
第四章 致病的细胞:微生物、感染与抗生素革命
第二部分 一与多
第五章 有序的细胞:细胞的内部结构
第六章 分裂的细胞:细胞繁殖与体外受精诞生
第七章 干预的细胞:露露、娜娜与背信弃义
第八章 发育的细胞:细胞成为生物体
第三部分 血液
第九章 躁动的细胞:血液循环过程
第十章 治愈的细胞:血小板、血栓与“现代流行病”
第十一章 守护的细胞:中性粒细胞及其对抗病原体的战斗
第十二章 防御的细胞:当人们彼此相遇
第十三章 识别的细胞:T细胞的微妙智慧
第十四章 耐受的细胞:自我、恐怖自体中毒与免疫疗法
第四部分 知识
第十五章 大流行
第五部分 器官
第十六章 协作的细胞:归属的优势
第十七章 沉思的细胞:多能的神经元
第十八章 调控的细胞:稳态、恒定与平衡
第六部分 重生
第十九章 再生的细胞:干细胞与移植的诞生
第二十章 修复的细胞:损伤、衰退与恒定
第二十一章 自私的细胞:生态方程与癌症
第二十二章 细胞之歌
后记 “更好版本的自我”
致谢
译者注记
尾注参考文献