专栏名称: 生信人
共同学习生物信息学知识,共同探究生物奥秘。
目录
相关文章推荐
BioArt  ·  Nature|TAGLN2介导的脂代谢促进T ... ·  昨天  
BioArt  ·  JEM | ... ·  5 天前  
生物学霸  ·  这所大学明年 9 月招生,投资 42 ... ·  6 天前  
BioArt  ·  Cell Metab | ... ·  1 周前  
51好读  ›  专栏  ›  生信人

2017年上半年已公布微生物基因组汇总(截止到7月份)

生信人  · 公众号  · 生物  · 2017-06-16 07:20

正文

小编汇总了17年公布的基因组,大家可以在下面网站输入对应物种拉丁文查阅更详细信息。

网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/?term=


注:组装水平S代表Scaffold, C代表Contig,F代表complete genome,Chr代表Chromosme


拉丁文中文更新时间组装水平
[Candida] aaseri (ascomycetes)[念珠菌] (子囊菌纲)03/22/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
[Candida] boidinii  (ascomycetes)[念珠菌](子囊菌纲)02/28/2017S
Absidia repens (fungi)梨头霉属(真菌)04/20/2017C
Achlya hypogyna (oomycetes)(卵菌类)04/06/2017S
Acytostelium ellipticum  (cellular slime molds)(细胞状黏菌)01/02/2017S
Acytostelium leptosomum  (cellular slime molds)(细胞状黏菌)01/02/2017S
Amanita bisporigera  (destroying angel)伞形毒菌02/02/2017S
Anaeromyces robustus (fungi)厌氧鞭菌属(真菌)04/20/2017C
Aspergillus carbonarius ITEM  5010 (ascomycetes)曲霉菌ITEM 5010(子囊菌纲)02/15/2017S
Aspergillus niger  (ascomycetes)黑曲霉(子囊菌)01/04/2017S
Aspergillus oryzae  (ascomycetes)米曲霉(子囊菌)02/28/2017C
Aspergillus terreus  (ascomycetes)土曲霉菌(子囊菌)01/04/2017S
Aureobasidium melanogenum  (ascomycetes)短梗霉(子囊菌纲)05/22/2017S
Aureobasidium pullulans  (ascomycetes)出芽短梗霉菌(子囊菌)01/04/2017C
Basidiobolus meristosporus CBS  931.73 (fungi)蛙粪霉属(真菌)04/20/2017C
Batrachochytrium  salamandrivorans (chytrids)蛙壶菌02/24/2017S
Beauveria bassiana  (ascomycetes)白僵菌(子囊菌)01/04/2017S
Beauveria bassiana  (ascomycetes)白僵菌(子囊菌)02/15/2017S
Catenaria anguillulae PL171  (blastocladiomycetes)线虫链枝菌(芽枝霉纲)04/20/2017C
Ceratocystis fagacearum  (ascomycetes)枯萎病菌(子囊菌)03/03/2017S
Ceratocystis harringtonii  (ascomycetes)龙胆藻(子囊菌纲)03/03/2017S
Cercospora sojina  (ascomycetes)长喙壳属(子囊菌纲)05/19/2017S
Cercospora sojina S9  (ascomycetes)尾孢菌属(子囊菌纲)04/10/2017C
Cladosporium cladosporioides  (ascomycetes)枝孢子菌(子囊菌纲)01/04/2017S
Cladosporium cladosporioides  (ascomycetes)枝孢子菌(子囊菌纲)02/15/2017S
Cladosporium sphaerospermum  (ascomycetes)枝状芽孢杆菌(子囊菌纲)01/04/2017S
Cladosporium sphaerospermum  (ascomycetes)枝状芽孢杆菌(子囊菌纲)02/15/2017S
Clohesyomyces aquaticus  (ascomycetes)水生梭菌(子囊菌纲)04/20/2017C
Colletotrichum chlorophyti  (ascomycetes)绿脓杆菌(子囊菌)01/05/2017S
Colletotrichum graminicola  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/13/2017C
Colletotrichum lindemuthianum  (ascomycetes)炭疽菌(子囊菌)02/04/2017S
Colletotrichum lindemuthianum  (ascomycetes)炭疽菌(子囊菌)02/04/2017S
Colletotrichum sublineola  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/13/2017S
Coprinopsis strossmayeri  (basidiomycetes)鬼伞属(担子菌纲)05/26/2017S
Corynespora cassiicola  (ascomycetes)棒孢菌(子囊菌纲)05/26/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Cryptococcus neoformans var.  grubii (basidiomycetes)新生隐球菌变种(担子菌)04/19/2017S
Curvularia sp. IFB-Z10  (ascomycetes)弯孢属(子囊菌)05/30/2017S
Cyberlindnera fabianii  (ascomycetes)(子囊菌纲)02/02/2017C
Daldinia eschscholzii IFB-TL01  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/12/2017S
Daldinia sp. EC12  (ascomycetes)轮层菌属(子囊菌)05/11/2017S
Dictyostelium deminutivum  (cellular slime molds)(细胞状黏菌)01/02/2017S
Dictyostelium polycarpum  (cellular slime molds)(细胞状黏菌)01/02/2017S
Dictyostelium polycephalum  (cellular slime molds)(细胞状黏菌)01/02/2017S
Diplodia seriata (ascomycetes)(子囊菌)01/31/2017S
Dothistroma pini CBS 116487  (ascomycetes)松座囊菌(子囊菌纲)05/01/2017S
Emergomyces orientalis  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/25/2017C
Entodinium caudatum (ciliates)恩托氏菌(纤毛虫)04/12/2017S
Epichloe festucae  (ascomycetes)香柱菌属(子囊菌纲)06/01/2017S
Epicoccum nigrum (ascomycetes)黑附球菌(子囊菌纲)05/01/2017S
Fomitopsis palustris  (basidiomycetes)拟层孔菌(担子菌)01/06/2017C
Fomitopsis pinicola  (basidiomycetes)松生拟层孔菌(担子菌)01/04/2017S
fungal sp. No.14919 (fungi)真菌No.14919(真菌)02/04/2017S
Fusarium pininemorale  (ascomycetes)镰刀菌06/02/2017S
Fusarium praegraminearum  (ascomycetes)镰刀菌(子囊菌)04/14/2017S
Fusarium solani (ascomycetes)镰刀菌(子囊菌)01/04/2017S
Fusarium solani (ascomycetes)镰刀菌(子囊菌)02/15/2017S
Geosmithia morbida  (ascomycetes)(子囊菌纲)05/26/2017S
Grammothele lineata  (basidiomycetes)(担子菌)05/19/2017S
Grosmannia penicillata  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/06/2017S
Hanseniaspora vineae  (ascomycetes)酵母菌属(子囊菌纲)05/16/2017C
Hesseltinella vesiculosa  (fungi)黑丝酵母(真菌)04/20/2017C
Hortaea werneckii EXF-2000  (ascomycetes)威尼克外瓶霉(子囊菌纲)05/11/2017C
Huntiella bhutanensis  (ascomycetes)(子囊菌纲)03/03/2017S
Hypoxylon sp. CI-4A  (ascomycetes)香灰菌(子囊菌纲)05/11/2017S
Hypoxylon sp. CO27-5  (ascomycetes)香灰菌(子囊菌纲)05/11/2017S
Hypoxylon sp. EC38  (ascomycetes)香灰菌(子囊菌纲)05/11/2017S
Irpex lacteus (basidiomycetes)(担子菌)02/06/2017C
Kazachstania saulgeensis  (ascomycetes)(子囊菌纲)05/26/2017S
Kluyveromyces lactis  (ascomycetes)乳酸克鲁维酵母(子囊菌)05/19/2017F
Kockovaella imperatae  (basidiomycetes)(担子菌)04/20/2017C
Kretzschmaria deusta  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/07/2017C
Lasiodiplodia theobromae  (ascomycetes)可可毛色二孢菌(子囊菌纲)04/26/2017S
Lecanicillium fungicola 150-1  (ascomycetes)烟粉虱150-1(子囊菌)03/12/2017S
Lecanosticta acicola CBS  871.95 (brown spot needle blight)松针褐斑病菌04/24/2017S
Leucosporidium creatinivorum  (basidiomycetes)(担子菌)04/20/2017C
Linderina pennispora (fungi)球梳霉属(真菌)04/20/2017C
Lobosporangium transversale  (fungi)(真菌)04/20/2017C
Magnaporthe oryzae (rice blast  fungus)稻瘟病菌(稻瘟病菌)01/05/2017C
Magnaporthe oryzae (rice blast  fungus)稻瘟病菌(稻瘟病菌)01/05/2017C
Magnaporthe oryzae (rice blast  fungus)稻瘟病菌(稻瘟病菌)01/05/2017C
Magnaporthe oryzae (rice blast  fungus)稻瘟病菌(稻瘟病菌)04/21/2017S
Magnaporthe oryzae Mo-nwi-55  (rice blast fungus)稻米淀粉Mo-nwi-55(稻瘟病菌)03/06/2017C
Magnaporthe sp. MG03  (ascomycetes)稻瘟病菌MG03(子囊菌)01/05/2017C
Magnaporthe sp. MG05  (ascomycetes)稻瘟病菌MG05(子囊菌)01/05/2017C
Magnaporthe sp. MG07  (ascomycetes)稻瘟病菌MG07(子囊菌)01/05/2017C
Magnaporthe sp. MG08  (ascomycetes)稻瘟病菌MG08(子囊菌)01/05/2017C
Magnaporthe sp. MG12  (ascomycetes)稻瘟病菌MG12(子囊菌)01/05/2017C
Malassezia sympodialis  (basidiomycetes)马拉色菌(担子菌)01/09/2017F
Malassezia sympodialis  (basidiomycetes)马拉色菌(担子菌)01/09/2017F
Malassezia sympodialis  (basidiomycetes)马拉色菌(担子菌)01/09/2017F
Malassezia sympodialis  (basidiomycetes)马拉色菌(担子菌)01/09/2017F
Malassezia sympodialis ATCC  42132 (basidiomycetes)马拉色氏菌ATCC 42132(担子菌纲)01/09/2017F
Melampsora abietis-canadensis  (basidiomycetes)栅锈菌属(担子菌纲)05/24/2017S
Melampsora aecidioides  (basidiomycetes)栅锈菌属(担子菌纲)05/24/2017S
Melampsora allii-populina  (basidiomycetes)栅锈菌属(担子菌纲)05/24/2017S
Melampsora medusae f. sp.  deltoidis (basidiomycetes)栅锈菌属(担子菌纲)05/24/2017S
Melampsora occidentalis  (basidiomycetes)栅锈菌属(担子菌纲)05/24/2017S
Metschnikowia australis  (ascomycetes)(子囊菌)03/29/2017C
Monilinia aucupariae  (ascomycetes)链核盘菌属(子囊菌纲)05/31/2017S
Monilinia fructicola  (ascomycetes)桃褐腐病菌(子囊菌纲)05/31/2017S
Mycosphaerella laricina CBS  326.52 (ascomycetes)球腔菌属(子囊菌)04/24/2017S
Mycosphaerella populi pn0402  (ascomycetes)球腔菌属(子囊菌纲)05/19/2017S
Mycosphaerella sp. PB-2012b  Mex 2-1-2 (ascomycetes)球腔菌属(子囊菌纲)05/01/2017S
Mycosphaerella sp. Ston1  (ascomycetes)球腔菌属(子囊菌)04/24/2017S
Myriosclerotinia curreyana  (ascomycetes)(子囊菌纲)05/31/2017S
Myriosclerotinia duriaeana  (ascomycetes)(子囊菌纲)05/31/2017S
Myriosclerotinia scirpicola  (ascomycetes)丝状核菌(子囊菌纲)05/31/2017S
Naematelia encephala  (basidiomycetes)(担子菌)04/20/2017C
Neocallimastix californiae  (fungi)新美鞭菌属(真菌)04/20/2017C
Neolecta irregularis DAH-3  (ascomycetes)Neolecta不规则DAH-3(子囊菌纲)01/04/2017S
Ophiocordyceps sinensis  (ascomycetes)冬虫夏草(子囊菌纲)04/03/2017S
Penicillium antarcticum  (ascomycetes)青青霉(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium brasilianum  (ascomycetes)巴西青霉菌(子囊菌)03/03/2017S
Penicillium chrysogenum  (ascomycetes)产黄青霉(子囊菌)04/06/2017S
Penicillium coprophilum  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌纲)03/24/2017S
Penicillium decumbens  (ascomycetes)青霉青霉(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium expansum YT02  (ascomycetes)青霉菌YT02(子囊菌纲)03/24/2017S
Penicillium flavigenum  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌纲)03/24/2017S
Penicillium italicum  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌)05/01/2017S
Penicillium nalgiovense  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium polonicum  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium roqueforti  (ascomycetes)青霉(子囊菌)01/09/2017C
Penicillium solitum  (ascomycetes)青霉(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium sp. HKF2  (ascomycetes)青霉属HKF2(子囊菌)02/15/2017S
Penicillium steckii  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌)03/24/2017S
Penicillium vulpinum  (ascomycetes)青霉菌(子囊菌)03/24/2017S
Peronospora tabacina  (oomycetes)霜霉菌(卵菌纲)04/18/2017S
Phaeocryptopus gaeumannii CBS  267.37 (ascomycetes)小黑座菌属(子囊菌纲)05/01/2017S
Phialophora verrucosa  (ascomycetes)疣状瓶霉(子囊菌纲)04/18/2017C
Phytophthora fragariae  (oomycetes)烟粉虱(卵菌)03/14/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/04/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/18/2017S
Phytophthora ramorum (Sudden  oak death agent)疫霉01/18/2017S
Phytophthora rubi (oomycetes)疫霉(卵菌)03/14/2017S
Pichia kudriavzevii  (ascomycetes)毕赤酵母(子囊菌)02/02/2017S
Piromyces finnis (fungi)梨囊鞭菌属(真菌)04/20/2017C
Piromyces sp. E2 (fungi)梨囊鞭菌属(真菌)05/26/2017S
Plasmodiophora brassicae  (cercozoans)根肿病菌04/14/2017S
Plasmopara viticola  (oomycetes)霜霉病菌01/30/2017S
Postia placenta MAD-698-R-SB12  (basidiomycetes)褐腐菌(担子菌)05/03/2017S
Protomyces lactucaedebilis  (ascomycetes)乳酸乳球菌(子囊菌纲)04/20/2017C
Pseudocercospora  pini-densiflorae CBS 125139 (ascomycetes)假尾孢菌属(子囊菌纲)04/24/2017S
Pseudomassariella vexata  (ascomycetes)假单胞菌(子囊菌纲)04/20/2017C
Puccinia striiformis  (basidiomycetes)条锈菌(担子菌纲)03/01/2017C
Puccinia striiformis  (basidiomycetes)条锈菌(担子菌纲)03/01/2017C
Puccinia striiformis  (basidiomycetes)条锈菌(担子菌纲)03/01/2017C
Puccinia striiformis f. sp.  tritici (wheat yellow rust)条锈菌03/14/2017S
Pycnoporus coccineus BRFM310  (basidiomycetes)血红孔菌(担子菌)04/24/2017S
Pythium oligandrum (oomycetes)腐霉(卵菌)03/28/2017S
Rachicladosporium antarcticum  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/03/2017S
Rachicladosporium sp. CCFEE  5018 (ascomycetes)(子囊菌)04/03/2017S
Ramalina peruviana  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/18/2017S
Ramularia endophylla CBS  113265 (ascomycetes)柱隔孢属(子囊菌纲)05/01/2017S
Rhizoclosmatium globosum  (chytrids)球状球菌(壶菌类)04/20/2017C
Rhizopus microsporus (fungi)根霉(真菌)04/12/2017S
Rhizopus microsporus var.  microsporus (fungi)定为小孢根霉(真菌)04/12/2017S
Rosellinia necatrix  (ascomycetes)白纹羽菌02/01/2017C
Rosellinia necatrix  (ascomycetes)白纹羽菌(子囊菌)05/26/2017S
Saccharomyces cerevisiae  (baker's yeast)酿酒酵母(面包酵母)01/05/2017S
Saccharomyces cerevisiae  (baker's yeast)酿酒酵母(面包酵母)01/05/2017S
Saccharomyces cerevisiae  (baker's yeast)酿酒酵母(面包酵母)02/02/2017C
Saccharomyces paradoxus  (ascomycetes)粟酒酵母(子囊菌)03/21/2017Chr
Saccharomyces paradoxus  (ascomycetes)粟酒酵母(子囊菌)03/21/2017Chr
Saccharomyces paradoxus  (ascomycetes)粟酒酵母(子囊菌)03/21/2017Chr
Saccharomyces paradoxus  (ascomycetes)粟酒酵母(子囊菌)03/21/2017Chr
Saccharomyces paradoxus  (ascomycetes)粟酒酵母(子囊菌)03/21/2017Chr
Saccharomycopsis fibuligera  (ascomycetes)酵母菌(子囊菌纲)01/05/2017Chr
Saccharomycopsis fibuligera  (ascomycetes)酵母菌(子囊菌纲)01/05/2017F
Saccharomycopsis fibuligera x  Saccharomycopsis cf. fibuligera (ascomycetes)酵母菌丝酵母菌(子囊菌)01/05/2017Chr
Salmacisia buchloeana  (basidiomycetes)(担子菌)02/07/2017C
Scedosporium apiospermum  (ascomycetes)尖端赛多孢子菌(子囊菌)05/26/2017S
Scheffersomyces shehatae  (ascomycetes)沙门氏菌(子囊菌纲)03/24/2017S
Scheffersomyces shehatae  (ascomycetes)沙门氏菌(子囊菌纲)03/24/2017S
Sclerospora graminicola  (oomycetes)禾生指梗霉(卵菌类)04/05/2017S
Sclerotinia glacialis  (ascomycetes)核盘菌属(子囊菌纲)05/31/2017S
Sclerotium cepivorum  (ascomycetes)小核菌属(子囊菌纲)05/31/2017S
Smittium culicis (fungi)(真菌)01/25/2017S
Smittium culicis (fungi)(真菌)01/25/2017S
Smittium mucronatum (fungi)粘虫(真菌)01/17/2017S
Spathaspora sp. UFMG-CM-Y306  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/17/2017C
Spathaspora xylofermentans  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/24/2017S
Starmerella bacillaris  (ascomycetes)(子囊菌纲)03/09/2017C
Starmerella bacillaris  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/17/2017C
Sugiyamaella xylanicola  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/06/2017C
Syncephalastrum racemosum  (fungi)沙门氏菌(真菌)04/20/2017C
Talaromyces wortmannii  (ascomycetes)邬氏黄丝曲霉(子囊菌纲)01/09/2017S
Taxomyces andreanae CBS 279.92  (ascomycetes)(子囊菌纲)01/23/2017C
Thraustochytrium sp. ATCC  26185 (slime nets)壶菌05/22/2017S
Thraustotheca clavata  (oomycetes)破囊霉属(卵菌类)04/06/2017S
Trametes hirsuta  (basidiomycetes)(担子菌)02/03/2017Chr
Trametes polyzona  (basidiomycetes)多孢菌属(担子菌纲)01/09/2017S
Trichoderma guizhouense  (ascomycetes)贵州木霉(子囊菌)03/07/2017S
Trichoderma harzianum  (ascomycetes)哈茨木霉(子囊菌)02/08/2017S
Trichoderma reesei  (ascomycetes)里氏木霉(子囊菌纲)02/13/2017S
Trichoderma reesei QM6a  (ascomycetes)(子囊菌纲)02/24/2017Chr
Trichoderma virens  (ascomycetes)木霉菌(子囊菌纲)01/04/2017S
Trichophyton interdigitale  (ascomycetes)毛癣菌(子囊菌纲)04/02/2017S
Umbilicaria pustulata  (ascomycetes)(子囊菌纲)04/14/2017S
Venturia carpophila  (ascomycetes)(子囊菌纲)02/09/2017S
Venturia inaequalis  (ascomycetes)黑星菌属(子囊菌纲)05/17/2017S
Venturia inaequalis  (ascomycetes)黑星菌属(子囊菌纲)05/17/2017S
Venturia inaequalis  (ascomycetes)黑星菌属(子囊菌纲)05/17/2017S
Yamadazyma sp. MH-2017a  (ascomycetes)(子囊菌)04/25/2017S
Zancudomyces culisetae (fungi)(真菌)01/25/2017S
Zygosaccharomyces parabailii  (ascomycetes)接枝酵母属(子囊菌纲)02/03/2017F
Zygosaccharomyces parabailii  (ascomycetes)接枝酵母属(子囊菌纲)03/16/2017F
Zygosaccharomyces rouxii  (ascomycetes)接合酵母属(子囊菌纲)01/05/2017S