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细菌听了想打人:科学家用大肠杆菌的DNA存了一部小动画!

果壳  · 公众号  · 科学  · 2017-07-18 14:03

正文

作者:窗敲雨

编辑:洛绛


这是一段画质感人的小动画,它总共只有5帧,每一帧都是36 × 26的超粗糙黑白像素……

但它又十分特别:科学家们成功地 将这段小动画以DNA编码的形式,存入了一群活的大肠杆菌 当中 ,然后又用高通量测序的方法重新读取数据,还原出了图像。7月12日,哈佛医学院的研究者们在《自然》上发表了这项研究成果。

这里所使用的图像,是电影史上一个经典的开端:埃德沃德·迈布里奇所拍摄的奔跑的马。

核心技术CRISPR的解释:


CRISPR/Cas系统可以看成是细菌的一种免疫机制, 会把外来入侵的DNA片段放进细菌基因组的特定位置“存储”下来,这样就能对相应的病毒产生“记忆”。细菌用它来抵抗病毒感染。

当病毒再入侵时,通过“记忆”的片段,细菌可以产生对应的RNA,以此引导核酸酶去剪切入侵的病毒基因。这个酶就叫Cas。

生物学家们可以用这套系统做很多事情。它为研究者提供了一把有针对性的“基因剪刀”,可以在需要的地方“裁剪”DNA分子。而在这个研究里,利用的则是把外来DNA存储“记忆”的部分,这样就把编码好的信息带进了大肠杆菌的基因组。


研究者们把每一帧图像分解成一个个黑白像素点,然后用DNA编码每个像素点的灰度参数以及它们所处的位置。然后,研究者再用基因编辑技术CRISPR将每一帧的信息依次按顺序插入了细菌们的基因组。存入的信息大约共有2.6kB。

他们分别试验了静态的和动态的黑白像素图,结果, 从细菌当中还原出的画面可以达到90%的准确程度。

下面是静态图像的还原效果,一只像素化的人手:

左边是原始图像,右边是经过N代生长之后从细菌中还原出的图像

所以,人们可以开始往细菌里存小电影了吗? 其实并不能







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