做植物研究，有哪些数据库可以用（上）？

今天为做植物研究的同学推荐一些常用的数据库，此为上篇。

1. 棉花——CottonFGD：https://cottonfgd.org/

这个数据库围绕棉花基因组和转录组的结果展开，包括了8个模块：

可以根据基因组位置和基因名检索，也可以进行blast，还可以分析多个基因表达和功能注释，绘制Venn图：

2. 水稻——Rice Expression Database (RED)： http://expression.ic4r.org/

水稻中基因表达的数据库，可浏览，比如根据热图浏览已经注释过的基因表达结果：

以及某个基因在各组织的表达情况：

基因的结构和序列：

可进行多个基因的检索：

我们可以看到每个基因和转录本的表达、功能等等，分别是表达的折线图和热图：

3. 拟南芥 ——HRGRN：http://plantgrn.noble.org/hrgrn/

搜索基因信息：

可以看到每个基因周围的基因，包括了蛋白、化合物、转录因子、小RNA等信息：

还可以看到基因之间的可能调控关系：