“凋亡小体”加持的“细胞死亡”，发了Adv Sci！南京大学/中国药科大学/中科院合作的这个热点叠加思路，我觉得你需要看看！

换季的时候，温度忽冷忽热，but生信塔对大家的热情不减，创新思路持续不断更！各位家人们要根据温度调整穿衣的同时，记得每天来看看生信塔的分享哦！

今天生信塔要给大家分享一个之前从来没提过的热点—— 凋亡小体加持下的细胞死亡 ！这篇发表在 Advanced Science 上的文章，来自南京大学王守宇教授、孙倍成教授、中国药科大学莫然教授及中科院薛愿超教授的共同合作。本研究运用 RNA 筛选技术，精准鉴定出一种可与凋亡蛋白激活因子 1（APAF1）特异性结合的长链非编码 RNA（lncRNA）——ABL，并深入揭示了其在 胃癌（GC） 发生发展过程中的关键作用。研究发现，ABL 在胃癌细胞中异常活跃，通过阻断凋亡体的正常组装，抑制癌细胞凋亡，进而促进肿瘤生长，还会导致癌细胞对多种化疗药物产生耐药性。进一步探究其机制发现，IGF2BP1 能够识别并紧密结合由 METTL3 介导的 ABL 上的 m6A 修饰，以此维持 ABL 的稳定性，保障其持续发挥促癌作用。基于这些发现，为 GC 治疗开辟了新方向，有望成为攻克胃癌难题的潜在新策略。

非常经典的干湿结合思路，以转录组测序筛选靶标基因开始，到大队列数据和实验言验证，再到动物模型和类器官模型的验证，环环相扣，结果完整！难得的是结合了 “凋亡小体”和“细胞死亡” 两大热点，可以作为一篇高分国自然课题设计模范思路！

感兴趣的朋友速速来 @课题窗 让生信塔帮你设计思路、规划实验、定制生信分析吧！

标题：APAF1-Binding Long Noncoding RNA Promotes Tumor Growth and Multidrug Resistance in Gastric Cancer by Blocking Apoptosome Assembly

期刊 ：Advanced Science （ IF=14.3）

DOI: 10.1002/advs.202201889

首先为了找到可能与胃癌相关的关键分子 ，该研究对胃癌患者组织进行 RNA 测序，由此筛选出差异表达的 lncRNAs，ABL 和 LOC730102 被确定为重点研究对象。随后，通过多种实验方法进行验证，发现 ABL 在胃癌组织和细胞系中显著上调，而且高表达 ABL 的患者总生存期短，是独立预后因素，与 TNM 分期联合的预测价值更高，这充分表明 ABL 在胃癌研究中意义重大。

图1：ABL表达升高与胃癌患者的不良预后相关

那么 ABL 在细胞内是如何发挥作用的呢？ 带着这个疑问，该研究运用 RNA-FISH 技术确定 ABL 主要位于细胞质。为了明确其作用靶点，又通过 lncRNA pull-down 结合质谱、RNA pull-down、RIP 等实验，证实 ABL 与 APAF1 直接结合，结合区域在 ABL 的 481 - 540 nt 和 APAF1 的 WD1/WD2 结构域，同时发现 APAF1 可能是 RNA 结合蛋白，这初步揭示了 ABL 在细胞内的作用方式。