清晰展示差异显著性的火山图，get！

以下文章来源于SCIPainter，作者小奥

火山图（Volcano plot）广泛应用于转录组、蛋白 组等组间差异分析结果的展示。

OmicShare云平台绘制火山图，通过 对差异显著、 非差 异显著的点赋予不同颜色，显示两组样品间的差异显著性。还可以单独标注关注的基因，看出感兴趣的基因为上调还是下调。

工具链接： h ttps://www.omicshare.com/tools/home/report/reportvolcano.html

绘制之前，我们先来了解常见问题，以便更好地使用工具。

常见 问题

Q： 绘制火山图需要什么数据？

A：工具的示例文 件为基迪奥结题报告中的数据，含有表达量值。

但火山 图及动态火山图工具一般只需 基因名称、差异倍数FC或log2(FC)、P值或FDR值 即可出图。

*注意：表格中需要加上列名（即第一行表头）

Q：为什么提示x轴y轴数据不能来自同一列？

A：在提交分析前， 需要选择log2(FC)、P值或FDR值所在列。没有填写所在列则会如上提示。

Q：为什么任务出错？

A：如果数据文件没有问题，可以检查是否 log2(FC)、P值或FDR值 所在列选错。

注意：“第_列作为x/y轴的值”这里需要填写阿拉伯数字！

例：

比如在我的数据中，log2 (FC)在2列，P value在3列，这里相应填上2、3就可以了，而切勿输入B列、C列！

Q：如何对火山图进行调整（文字/图形样式调整）？

A:使用动态火山图工具，在任务完成后，点击“跳转查看”小图标即可跳转界面修改。

进入动态交互界面后，即可进行文字、图形样式、配色等修改。除了平台提供的配色方案，还可以自定义颜色代码。

Q：如何在火山图中标注基因？

A:图中标注基因的功能需要使用 动态火山图 工具。

在动态调整窗口下拉，可以看到结果输入表，①选择需要搜索的列；②在筛选框中输入需要标注的基因名，即可将基因在火山图中标注显示。

Q： 如何在图中标注多个基因？

A:标注多个基因，只需要在搜索列中输入GENE ID，多个ID间使用英文逗号分隔；

也可以选择其他筛选列，填入相关数值，工具将自动标注出相关数值的数据。

Q：表格为什么无法勾选？

A:在筛选栏中有多个数据，勾选栏才会变成蓝色可选状态。此时，可以通过勾选或取消勾选，选择图中是否显示该基因。

不可勾选状态

筛选多个基因后 可勾选状态

Q：为什么图中没有显示我标注的数据？

A:如果筛选的数据不在区域内，则需要把“区域外散点”按钮打开，才能在图上显示。

具体操作：动态调整窗口——图形设置——图形参数——区域外散点