主要观点总结
本文报道了中国疾病预防控制中心联合华大生命科学研究院等单位在非洲塞拉利昂开展疟疾监测和培训任务的情况。通过使用CycloneSEQ平台、DNBSEQ-G50平台和疟疾生信分析一体机，完成了对疟原虫基因组序列的长短读长测序分析，提升了非洲地区疟疾分子监测能力。
关键观点总结
关键观点1: 合作单位与地点
中国疾病预防控制中心联合华大生命科学研究院等单位在非洲塞拉利昂-中国友好生物安全实验室进行疟疾监测和培训。
关键观点2: 技术应用与成果
成功应用CycloneSEQ平台、DNBSEQ-G50平台和疟疾生信分析一体机，完成疟原虫基因组序列的长短读长测序分析，提升了非洲地区疟疾分子监测能力。
关键观点3: 培训任务与合作
华大生命科学研究院承接了疟疾生信分析一体机的开发部署和培训任务，与当地员工紧密合作，完成建库实验培训、全流程实验与生信培训。
关键观点4: 挑战与对策
针对当地网络不稳和断电频繁等限制因素，实验团队设计了“长短结合”的方案进行测序分析，通过CycloneSEQ-WT02纳米孔测序仪快速鉴定疟原虫抗性基因突变。
关键观点5: 专家评价与期望
中国疾病预防控制中心全球公共卫生中心主任戚晓鹏表示，该项目不仅提升了塞拉利昂在疟疾分子监测领域的技术能力，也为其他疟疾高流行国家提供了可借鉴的模式。华大生命科学研究院病原中心负责人王达希表示，希望将中国的高通量测序技术平台带到更多需要病原监测的国家，为全球传染病防控工作贡献力量。
正文
2024年11月20日至12月19日，中国疾病预防控制中心联合华大生命科学研究院等单位在非洲塞拉利昂-中国友好生物安全实验室开展疟疾监测和培训任务，成功应用CycloneSEQ平台、DNBSEQ-G50（国内产品名为MGISEQ-200）平台和疟疾生信分析一体机，完成了对疟原虫基因组序列的长短读长测序分析，提升了非洲地区疟疾分子监测能力。
疟疾监测团队合影2020年以来，在比尔和梅琳达·盖茨基金会支持下，中国疾病预防控制中心联合国内和塞拉利昂公共卫生机构开展疟疾分子监测能力建设。在该项目中，华大生命科学研究院承接疟疾生信分析一体机的开发部署和培训任务。对塞拉利昂员工开展建库实验培训
华大员工前往塞拉利昂-中国友好生物安全实验室，与当地员工紧密合作，针对疟疾监测，完成了从核酸提取、文库构建、短读长和长读长测序的全流程实验与生信培训。在塞拉利昂通过CycloneSEQ-WT02 进行测序针对当地网络不稳和断电频繁等限制因素，实验团队设计了“长短结合”的方案进行测序分析。通过CycloneSEQ-WT02纳米孔测序仪在6小时内完成了建库到测序上机的流程，实现了对疟原虫抗性基因突变的快速鉴定。再应用DNBSEQ-G50测序仪进行短读长测序，进一步扩大监测规模和测序深度。部署在塞拉利昂的MegaBOLT 疟疾生信分析一体机本次任务所使用的生物信息分析流程由华大生命科学研究院开发，通过华大智造的MegaBOLT生信加速技术部署到生信分析一体机。通过可视化界面与集成化分析，该设备大幅降低了疟疾测序数据的分析管理门槛，可独立实现疟原虫全基因组变异检测注释、微生物鉴定等多种分析，提升实验室的整体分析能力与效率。中国疾病预防控制中心全球公共卫生中心戚晓鹏主任表示，本项目不仅提升了塞拉利昂在疟疾分子监测领域的技术能力，也为其他疟疾高流行国家提供了可借鉴的模式。华大生命科学研究院病原中心负责人王达希表示，该项目展示了华大在全球公共卫生能力建设方面的积极作为。我们希望将中国的高通量测序技术平台带到更多亟待病原监测的国家，为全球传染病防控工作贡献力量。
