单细胞实战分享概述
今年生信技能树在视频号新开了两个系列直播,
周四下午的转录组和单细胞上游基于linux的数据分析,以及周五下午的单细胞下游分析基于R语言的
小谢主要是在周二阅读整理文献笔记,周四整理数据分析内容推文,以及每周五直播分享当周学习的单细胞文献及数据分析内容:
单细胞文献阅读笔记合集——
#单细胞实战100次
单细胞数据分析系列推文——
#单细胞实战
在上一期
GSE183904_胃癌的单细胞图谱研究
分享胃癌单细胞图谱数据集的时候,提到了明年的一个直播分享计划,应该还是每周五下午直播分享
今年会回顾总结一下今年的学习所得,然后想看看大家主要感兴趣的内容,还是争取在每次直播中多分享一点知识。所以我们组建了一个交流群——
承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群
,方便分享24年的直播代码资料,以及讨论2025年的交流文献
直播互动交流计划
在
承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群
推文里面也对交流群进行了简介,hhh小谢这边就赘述一下叭
那一起来看看交流群主要有啥功能叭!
1. 视频号分享总结
24年是每周五在生信技能树视频号给大家直播分享单细胞数据集,
主要是数据整理读取以及第一层次的降维聚类分群内容
,每个数据的整理其实还是各有特点,
所以会整理汇总数据集整理及降维聚类分群的代码分享到群里
对应的推文合集是——
#单细胞实战
2. 分享文献讨论
在单细胞数据分析系列推文——
#单细胞实战
目前已经整理了七八十篇单细胞文献,从不同的文献中可以了解到对应的数据及分析结果的解析,可谓是受益良多!
如果有可以下载到的数据集,也会下载下来进行分析,看看不同数据集整理和命名的不同
大家也可以在群里提出来自己感兴趣的数据集及文献,会优先考虑整理分享大家感兴趣的文献内容!
3. 文献中个性化图表学习
24年的分享主要聚焦在单细胞数据集的整理,及第一层次的降维聚类分群。也把学到的一些知识点加了进来,比如——
GSE224528—T细胞亚群细分
、
基于文章metadata信息注释亚群
、
单细胞亚群注释三种方法汇总
在整理文献的过程中,也发现了很多文献有各自好看的图,比如——