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单细胞实战100次视频号交流分享

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-12-31 17:22

正文

单细胞实战分享概述

今年生信技能树在视频号新开了两个系列直播, 周四下午的转录组和单细胞上游基于linux的数据分析,以及周五下午的单细胞下游分析基于R语言的

小谢主要是在周二阅读整理文献笔记,周四整理数据分析内容推文,以及每周五直播分享当周学习的单细胞文献及数据分析内容:

单细胞文献阅读笔记合集—— #单细胞实战100次

单细胞数据分析系列推文—— #单细胞实战

在上一期 GSE183904_胃癌的单细胞图谱研究 分享胃癌单细胞图谱数据集的时候,提到了明年的一个直播分享计划,应该还是每周五下午直播分享

今年会回顾总结一下今年的学习所得,然后想看看大家主要感兴趣的内容,还是争取在每次直播中多分享一点知识。所以我们组建了一个交流群—— 承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群 ,方便分享24年的直播代码资料,以及讨论2025年的交流文献

直播互动交流计划

承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群 推文里面也对交流群进行了简介,hhh小谢这边就赘述一下叭

那一起来看看交流群主要有啥功能叭!

1. 视频号分享总结

24年是每周五在生信技能树视频号给大家直播分享单细胞数据集, 主要是数据整理读取以及第一层次的降维聚类分群内容 ,每个数据的整理其实还是各有特点, 所以会整理汇总数据集整理及降维聚类分群的代码分享到群里

对应的推文合集是—— #单细胞实战

2. 分享文献讨论

在单细胞数据分析系列推文—— #单细胞实战 目前已经整理了七八十篇单细胞文献,从不同的文献中可以了解到对应的数据及分析结果的解析,可谓是受益良多!

如果有可以下载到的数据集,也会下载下来进行分析,看看不同数据集整理和命名的不同

大家也可以在群里提出来自己感兴趣的数据集及文献,会优先考虑整理分享大家感兴趣的文献内容!

3. 文献中个性化图表学习

24年的分享主要聚焦在单细胞数据集的整理,及第一层次的降维聚类分群。也把学到的一些知识点加了进来,比如—— GSE224528—T细胞亚群细分 基于文章metadata信息注释亚群 单细胞亚群注释三种方法汇总

在整理文献的过程中,也发现了很多文献有各自好看的图,比如——







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