单细胞实战100次视频号交流分享

单细胞实战分享概述

今年生信技能树在视频号新开了两个系列直播，周四下午的转录组和单细胞上游基于linux的数据分析，以及周五下午的单细胞下游分析基于R语言的

小谢主要是在周二阅读整理文献笔记，周四整理数据分析内容推文，以及每周五直播分享当周学习的单细胞文献及数据分析内容：

单细胞文献阅读笔记合集——#单细胞实战100次

单细胞数据分析系列推文——#单细胞实战

在上一期GSE183904_胃癌的单细胞图谱研究分享胃癌单细胞图谱数据集的时候，提到了明年的一个直播分享计划，应该还是每周五下午直播分享

今年会回顾总结一下今年的学习所得，然后想看看大家主要感兴趣的内容，还是争取在每次直播中多分享一点知识。所以我们组建了一个交流群——承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群，方便分享24年的直播代码资料，以及讨论2025年的交流文献

直播互动交流计划

在承包你2025全部的单细胞转录组降维聚类分群推文里面也对交流群进行了简介，hhh小谢这边就赘述一下叭

那一起来看看交流群主要有啥功能叭！

1. 视频号分享总结

24年是每周五在生信技能树视频号给大家直播分享单细胞数据集，主要是数据整理读取以及第一层次的降维聚类分群内容，每个数据的整理其实还是各有特点，所以会整理汇总数据集整理及降维聚类分群的代码分享到群里

对应的推文合集是——#单细胞实战

2. 分享文献讨论

在单细胞数据分析系列推文——#单细胞实战目前已经整理了七八十篇单细胞文献，从不同的文献中可以了解到对应的数据及分析结果的解析，可谓是受益良多！

如果有可以下载到的数据集，也会下载下来进行分析，看看不同数据集整理和命名的不同

大家也可以在群里提出来自己感兴趣的数据集及文献，会优先考虑整理分享大家感兴趣的文献内容！

3. 文献中个性化图表学习

24年的分享主要聚焦在单细胞数据集的整理，及第一层次的降维聚类分群。也把学到的一些知识点加了进来，比如——GSE224528—T细胞亚群细分、基于文章metadata信息注释亚群、单细胞亚群注释三种方法汇总

在整理文献的过程中，也发现了很多文献有各自好看的图，比如——GSE163558—细胞分群注释及可视化

以及在可视化marker基因的时候，有些文献别出心裁，让结果更加美观——热图联动点图展示Marker基因

接下来会争取复现分享更多的内容，大家也可以进群讨论交流你感兴趣的内容，一起探讨学习进步！

进群方式

进群请扫描二维码（先到先得）