如何根据同行评议来修改文章

主要修正方面

要求

改变

作用

请更好地解释 PGE1 损害 CML LSCs 的分子机制。

给出解释为何 PGE1 对 LSC 的转录程序具有广泛的影响。

阐明了机制性途径，并确定了一组特异性靶基因 AP1 家族转录因子，这些因子受到 PGE1 抑制。

增加研究结果可能具有翻译相关性的证据。

将人的 CML LSC 移植到免疫受损小鼠中作为异种移植模型来扩展研究。

证明了在 CML 常规 LSC 抑制剂治疗中 PGE1 的协同作用。还建议 AP-1 因子可以作为新的治疗靶点和生物标志物来评估 CML 治疗效果和预后。

特定图片的变化

修改前

修改要求

作用

Figure 1: Analysis  of WT and Tcf1/Lef1-deficient HSCs for transcriptomic changes.

将图 1 中的分析扩展到 LSC (Rev1&2).

更新 Figure 1A, B, S2

WT 和 Tcf1 / Lef1 缺陷型 HSPC 以及 WT 和 Tcf1 /  Lef1 缺陷型 CML LSCs 的扩增分析。

Figure  1: Transcriptomic analysis suggested a link between  Tcf1/Lef1 and HSC stemness, cell cycle regulation and AP1 family  transcription factors.

建议更广泛的表征了 Tcf1 / Lef1 和 AP1 家族转录因子之间的联系 (Rev1,2&3).

更新 Figure 1C, S1

加强 Tcf1 / Lef1 与 AP1 因子之间的联系，特别是在 LSCs 中。

Figure S1A

确认了鼠模型里 AP1 表达比 WT  HSPCs 更高。

增加了 Figure 1D

进一步确认了，人类 CML LSCs 中， AP1 表达比 HSPC 更高。

Figure  2: Identification of PGE1 based on  Tcf1/Lef1-dependent genes using CMAP, and demonstration of its impact on  impairing LSCs in a murine model.

证明 PGE1 治疗与 Tcf1 /  Lef1 基因消融的相似性 (Rev3).

增加了 Figure 2G, H

表明 PGE1 治疗和 PGE1 /  Lef1 的遗传消融对 CML LSCs 有相似的影响， PGE1 治疗可以引起与 Tcf1 /  Lef1 基因缺失相似的表达变化。

Figure 3: Used  serial transplantation assays to characterize the impact of PGE1 treatment on  LSCs.

加上 LSC 限制稀释测定法以加强原始结论 (Rev3)

增加了 Figure 3D

添加 LSC 限制稀释测定法。 这些增强了 PGE1 对功能性 LSCs 的影响的证据。能更好的检测细胞表面用于识别 LSC 的生物标记物。

Figure  4: Used a selected gene analysis (including AP1 factors)  to show that PGE1 has a distinct effect from a highly related molecule PGE2  (differs in only one carbon-carbon double bond.)

增加了 LSC 对 PGE1 作用的转录组学分析，并与 PGE2 和 Tcf1 / Lef1 基因缺失相比较。 (Rev1&2).

更新 Figure 4A , B

包括对 PGE1 和 PGE2 对 LSCs 的不同影响的高通量转录组学分析，以及与图 1 所述的 Tcf1 / Lef1 基因缺失引起的变化做进一步比较。

Figure  4 second point

检查 AP1 因子的功能联系，并测试 AP1 是否是 PGE1 治疗的主要靶标 (Rev1,2&3).

增加了 Figure 4C-G

对 AP1 因子的功能联系分析表明， LSCs 强制表达 Fosb / Fos ，而不是 Egr1 （另一种 Tcf1 / Lef1 靶基因），从而增强 CML 的增殖，降低 PGE1 治疗的敏感性， AP1 因子是 PGE1 的主要靶点。

Figures  5 & 6: Used a selected gene approach  (including AP1 factors) to show that Misoprostol, but not other EP receptor  agonists, simulates the effect of PGE1, and deduced that EP4 receptor is the  major receptor that PGE1 acts on in LSCs. Also used in vitro selected gene approach  to show that EP4 deficiency abrogated the effect of PGE1 in LSCs.

进一步验证体内数据，表明 EP4 受体是 PGE1 在 LSCs 中起主要作用的受体， EP4 缺乏可降低 PGE1 在 LSCs 中的作用 (Rev1&2).

增加了 Figure 5C , D

添加体内数据以显示 EP4 缺乏症极大地降低了 LSC 对 PGE1 治疗的敏感性。

Figures  5 & 6 second point

通过检查