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高效降解13种常见KRAS突变体,创新PROTAC分子登《科学》

药明康德  · 公众号  · 药品  · 2024-10-05 07:30

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▎药明康德内容团队编辑

KRAS基因突变是人类癌症中最常见的基因突变之一。然而KRAS蛋白也是著名的难于成药靶点,虽然近年来针对KRAS G12C突变体的共价抑制剂获得FDA的批准上市,打破了KRAS的不可成药性,然而仍然有多种其它类型的KRAS基因突变能够激活KRAS的活性,这给利用小分子药物抑制多种KRAS突变体的活性带来了挑战。近日,邓迪大学(University of Dundee)和勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim)公司的科学家合作,开发了一种能够降解多种KRAS突变体的广谱靶向蛋白降解疗法,为治疗多种难治性癌症提供了新选择。这项研究已经发表在顶尖科学期刊《科学》上。



在这项研究中,科学家们利用称为蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)的治疗模式来靶向多种不同的KRAS突变体。PROTAC是近年来小分子药物开发的热点领域之一,它是一种双功能分子,一端可以与靶点蛋白结合,另一端与E3泛素连接酶结合,促使泛素连接酶在靶点蛋白上添加泛素的“标签”。而被泛素装饰的蛋白会被送到细胞自身的蛋白酶体中降解,从而降低了靶点蛋白的水平。


这款名为ACBI3的PROTAC分子基于勃林格殷格翰公司已经开发的一款泛KRAS抑制剂BI-2865。它在临床前研究中已经表现出抑制多种KRAS突变体和野生型KRAS蛋白的活性。这款泛KRAS抑制剂的临床前研究已于去年发表在《自然》杂志上。



在这项发表在《科学》上的研究中,勃林格殷格翰公司和邓迪大学的科学家合作,将BI-2865与可以和E3泛素连接酶VHL结合的基团连接在一起,生成了可以将VHL招募到KRAS突变体附近的候选PROTAC化合物。研究团队然后解析了KRAS、VHL和候选PROTAC化合物构成的复合体的晶体结构,基于从中发现的洞见对候选化合物进行了一步步优化,最终生成了ACBI3。


在临床前研究中,这款PROTAC分子能够选择性、高效降解17种最常见KRAS突变体中的13种突变体。此外,在小鼠癌症模型中,ACBI3有效抑制了表达KRAS G12D和KRAS G12V突变体肿瘤的生长。


▲ACBI3在动物模型中展现降解KRAS G12D和KRAS G12V突变体的活性(图片来源:参考资料[3])


研究人员指出,KRAS突变在多种具有高度未满足医疗需求的癌症中出现,包括35%的肺癌,45%的结直肠癌和高达90%的胰腺癌。ACBI3广泛降解多种KRAS突变体的活性为治疗这些疾病,克服KRAS突变产生的耐药性提供了有力的工具。勃林格殷格翰公司同时表示,将通过其开源科学通道opnMe让全球的科学家都可免费获得ACBI3,从而加速针对KRAS的未来研究。


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参考资料:
[1] Degrader takes out many forms of KRas. Retrieved October 4, 2024, from https://cen.acs.org/pharmaceuticals/drug-discovery/Degrader-takes-forms-KRas/102/web/2024/09?sc=230901_cenrssfeed_eng_latestnewsrss_cen
[2] University of Dundee research shows potential breakthrough for hard to treat cancers. Retrieved October 4, 2024, from https://www.dundee.ac.uk/stories/university-dundee-research-shows-potential-breakthrough-hard-treat-cancers
[3] Popow et al., (2024). Targeting cancer with small-molecule pan-KRAS degraders. Science, DOI: 10.1126/science.adm8684

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