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来源:梅斯医学
近些年来,随着科学家们研究的深入,他们可以实现了在单细胞层面进行多个领域的研究,本文中,小编就整理了近期科学家们在单细胞方面的关键研究,分享给大家!
Sci Rep:利用单细胞RNA测序技术阐明机体多种类型味觉细胞的工作机制
日前,一项刊登在国际杂志Scientific Reports上的研究报告中,来自美国滨州莫奈尔中心(Monell Center)的研究人员通过研究开发出了一种新技术能够鉴别出了任何味觉受体细胞的一整套基因,相关研究或能帮助研究人员阐明味觉感受器细胞发挥特殊功能的分子机制。
研究者Sunil Sukumaran博士表示,在很多方面味觉系统都是机体营养的守门人,我们的研究阐明了味觉细胞的工作机制,或能帮助我们设计多种方法来操控味觉并且促进机体健康饮食。味蕾中含有50至100个紧密压缩的细胞,而且其具有多样化的特性,每一个洋葱状的感觉结构都包含有多种不同亚型的味觉受体细胞;如今研究人员所熟知的II型味觉细胞能够对甜味或可口的化合物产生反应,类似地,III类味觉细胞则会对含盐或酸的化合物产生反应。
目前研究人员还需要深入研究阐明不同类型的味觉细胞如何传递给定味道分子的信息,并且激活神经将相关的信息传送至大脑;通过鉴别给定味觉细胞的基因,研究人员就能够鉴别出味觉细胞发挥特殊功能所需的特殊分子组分。本文研究中,研究人员首次鉴别出了II型甜/鲜感受细胞以及III型盐/酸感受细胞,随后研究者利用诸如RNA测序等遗传学攻击鉴别出了每一种味觉细胞类型中所表达的所有基因。
Nat Methods:新型基因组工具CITE-seq或能实现单细胞大规模多维度分析
近日,一项刊登在国际杂志Nature Methods上的研究报告中,来自纽约基因组研究中心(NYGC)的研究人员通过研究开发了一种新技术,或能帮助推动单细胞RNA测序的进程,单细胞RNA测序是基因组研究的重要领域,其能够帮助研究人员深入解读单细胞的特性,同时还能够帮助有效区分不同的细胞类型,以及在单细胞水平下研究多种人类疾病的发病机制。
这种名为CITE-seq(Cellular Indexing of Transcriptomes and Epitopes by sequencing,通过测序来进行转录组和表位的细胞索引技术)的新型测序技术能够对数千个单细胞的表面蛋白标记物进行测定,同时还能够对相同单细胞中的信使RNA进行测序。如今研究人员正在对该技术进行概念验证研究,他们结合转录组学技术,对8000个单细胞表面的10种表面蛋白进行了监测,截至目前为止,这项研究是对单细胞进行的最大规模且多维度的分析。
2018年9月15日由生物谷主办的2018单细胞组学技术与应用研讨会将邀请单细胞组学行业内多位专家围绕单细胞测序、单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞质谱分析技术、基于微流控芯片的单细胞分析技术以及单细胞转化医学进行深入探讨。
单细胞生物学研究一直是当今的热门话题,而且最前沿的领域就是单细胞RNA测序了(scRNA-seq)。常规RNA测序方法一次性能够对成千上万个细胞进行加工测序,并给出平均差异,但并没有两个细胞是完全一样的,而新型的scRNA-seq方法就能够揭示出制造每一种特异性的微小改变,甚至这种技术还能够阐明完整的新的细胞类型。
比如,当来自博德研究所的研究人员Aviv Regev等人利用scRNA-seq对2400个免疫系统细胞进行探查时,他们无意中发现了一些具有潜在T细胞激活活性的树突状细胞,Regev表示,一种刺激这些细胞的疫苗或能够潜在增强机体免疫系统并且保护机体抵御癌症。当然了,这些发现都是来之不易的,相比大量细胞而言,研究人员很难对单个细胞进行操作,因为每一种细胞仅会产生少量的RNA,对于研究者而言没有犯错的余地;另外一个问题就是如何对大量的数据进行分析,最重要的是,研究者使用的工具可能是并不直观的。
一般而言,RNA测序数据能够被以指令的形式输入到Unix操作系统中进行分析,数据文件会从一个软件包传输到另外一个,在这个过程中,每个工具都要对每一个步骤进行处理,比如基因组比对、质量控制、识别突变体等等。这个过程是非常复杂的,但对于大量的RNA-seq而言,研究人员可以利用算法对每一个步骤进行处理,而且他们也非常清楚每个过程的运行状况。
Nature:科学家深度解析单细胞生物学的研究进展
细胞学说是生物学研究的基石,细胞学说也就是将细胞作为生命基本单位的一种概念,但尽管在生物学家的显微镜下经历了将近180年的历史,科学家们对细胞的研究仍然具有一定的神秘色彩,如今研究者们正在尽力通过对单个细胞进行研究来阐明细胞的天性,比如到底有多少不同种类的细胞存在?其能发挥怎样的角色?这些细胞又是如何随着时间延续而不断发生改变的呢?
近日,一项新闻特稿就阐明了对有机体的谱系追踪结果,研究者揭示了复杂有机体是如何又一个变成两个,随后再变成四个看似相同的胚胎的;细胞类性和活性的多样性要比常规研究所查明地多得多,这也就是为何科学家们要参与到大量的工作中来对人体多种类型的细胞进行分类的原因了。
诸如这样的研究工作具有重要的治疗意义,在异质性肿瘤中不断追踪细胞间的差异性或许能够有效指导科学家们对新型疗法的开发,或者科学家们希望能够改进方法来搜寻能够帮助机体又掉抵御感染或炎症的免疫细胞。
Cell:中国学者张泽民、彭吉润、欧阳文君团队首次发布大规模肿瘤单细胞水平免疫图谱
2017年6月15日,北京大学生命科学学院 BIOPIC 中心、北京未来基因诊断高精尖创新中心、北大 - 清华生命科学联合中心张泽民研究组,首都医科大学附属北京世纪坛医院暨北京大学第九临床医学院肝胆胰外科彭吉润研究组,及美国 AMGEN 公司的欧阳文君研究组在《Cell》杂志发表了题为“Landscape of infiltrating T cells in liver cancer revealed by single-cell sequencing” 的研究论文,首次在单细胞水平上描绘了肝癌微环境中的免疫图谱。
癌症免疫疗法是近年新兴的极具潜力的治疗方法,尤其是免疫检查点抑制剂疗法,如 CTLA- 4 抗体 Ipilimumab 及 PD- 1 抗体 pembrolizumab 目前都取得了良好的疗效。虽然这种治疗方法可以达到显著的临床效果,但是在不同病人或者不同癌种之间的效果却很不均一。DNA 变异的数目、肿瘤浸润淋巴细胞的水平以及药物靶点的表达等因素都会影响到各类肿瘤免疫治疗的效果。由于参与肿瘤发生发展的免疫细胞类型多样且异质性很强,只有开展单细胞水平的研究才能真正获得系统详尽的肿瘤免疫图谱,从而助力于肿瘤免疫疗法的发展及有效的靶点和生物标志物的发现。
2018年9月15日,由生物谷主办的2018单细胞组学技术与应用研讨会将在美丽的南京召开。本次会议邀请了多位单细胞组学行业内专家,将围绕单细胞研究技术与单细胞转化医学进行深入探讨。
该会议同时聚焦单细胞组学的多个细分领域,如单细胞测序、单细胞基因组学、单细胞转录组学、单细胞质谱分析技术、基于微流控芯片的单细胞分析技术、单细胞水平研究胚胎发育、单细胞组学研究肿瘤异质性、单细胞水平研究大脑神经元、单细胞尺度的微生物群落调控、人类单细胞图谱和临床级单细胞组学技术的发展,为业内提供更灵活的交流机会,促进合作。
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