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通过液体活检(ctDNA)追踪癌症的演进过程!

恒瑞源正  · 公众号  · 医学  · 2017-06-27 10:23

正文

来源| 恒瑞源正

编译| Shaozu Yang

编辑| 飞过海


深刻理解肿瘤异质性和其发展进化过程,对于肿瘤的复发和有效的治疗是十分重要的,最近发表在Nature和NEJM上的两篇研究报道跟踪了早期NSCLC的发展变化过程,提供了与临床效果相关的肿瘤内异质性的特征。更重要的是,正如Nature提到的那样, 对术后ctDNA的检测是能够有效预测后期肿瘤的复发。


NSCLC是肺癌比较常见的类型,预后很差,生存率比较低,通常和肿瘤异质性密切相关,肿瘤异质性最终导致肿瘤的进展和耐药性出现。


Abbosh在UK资助的TRACERx的研究中,研究了100名NSCLC的患者,通过研究NSCLC患者从诊断到死亡的全过程中ctDNA的变化。


液体活检,通常采用非侵入性的方法,先前有研究过乳腺癌和结直肠癌中的肿瘤残留病灶。手术中获得的肺癌样本多区外显子测序用来研究肿瘤的异质性。从这些研究数据中得到的信息来分析患者特异性的单核苷酸的多态性(SNVs),从这些SNVs中设计PCR实验来追踪患者特异性的肿瘤克隆。手术前后收集的血液样本用来分析ctDNA,通过构建ctDNA的图谱,从而来重构手术后患者肿瘤特异性的演进过程。从转移组织获得的测序数据用来确证肿瘤系统进化树。


这种方法能够让研究者以非侵入性的方式跟踪癌症的发展演进过程

其次,研究者测试是否ctDNA分析能够监测或确证某个亚克隆是NSCLC复发的起源,在14例患者中,13例患者进行了ctDNA的盲测,确定了在临床复发时,ctDNA能够首先被检测到。


NEJM上的文章中,在同样的患者组中发现了肿瘤异质性的特征。在亚克隆中鉴定了约30%的体细胞突变和48%的拷贝数变化,尽管在不同的肿瘤患者内肿瘤异质性差异很大。在亚克隆中有较高的拷贝数变化和较高的疾病复发率或死亡率,这就表明这些患者亚群能够受益于早期的监测。在临床效果和亚克隆突变之间的关系没有发现。


肿瘤内的异质性通常和染色体的不稳定性紧密相连,很明显,超过75%的肿瘤携带有亚克隆驱动基因的突变,这些都表明在基因组成倍增加后,大量的亚克隆会发生变化。


Jamal-Hanjani等推断染色体的不稳定性可以作为肿瘤预后较差的一个标志,正如Abbosh的研究显示,如果拷贝数数目的改变检测的可靠性与SNVs相一致,那么液体活检可以用来服务于这个目的。考虑的靶向ctDNA分析可能也发挥一定作用,不管如何,这些工具对于开发和测试新的治疗策略都是很有帮助的,譬如,靶向新出现的亚克隆。

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