R语言生信数据分析及可视化作图班【9月10-11日】

医药加学习班 · 公众号 · · 2022-09-08 11:07

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R语言生信数据分析及可视化作图

（理论+实践课）

（两天网络授课，具体安排：9月10-11日）

课程可免费回放，专家微信群指导，确保你能学会！

学习班简介

众所周知，R软件是用来做统计分析和作图的软件。本次学习通过手把手教学让学员掌握R软件下载安装、Rstudio用法、常用医学统计学算法模型R实现、R语言常用作图、R语言数据处理方法与编程技术、掌握R语言自主学习实践的方法与技巧，现场解答学员在实际工作中遇到的有关技术问题，让学员更好地掌握相关技术的应用。另外，课后学员有感兴趣的图片，老师也可以提供相应的R代码。

总体思路是根据生信相关的SCI文章为主题，完成里面所有的分析内容。该培训适用于对生信分析或者医学统计学分析感兴趣，编程零基础及以上的学员参加。

讲师简介

宋伟博士，中国精准医疗学会委员

成果：参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请；肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建；完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

研究方向：有近十年的生信分析经验，擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等，精通perl、R等编程语言。

培训经历：在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有：医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向：《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等

培训目的

通过2天的培训（半天理论课程+1天半实践操作），可以学会R语言基础（输入文件格式、输出文件格式、操作代码的参数调整）、统计学上各种算法的实现、SCI常用图片生成。

往期学员评价

课程安排

R语言生信数据分析及可视化作图日程
课程		主要内容
第一天上午	R语言——编程环境、数据结构、语法和练习	R软件的历史、简介、优缺点
		R 编程形式与资源
		R软件的安装
		Rstudio 使用技巧及安装
		R 语言的数据结构（元素、向量、矩阵）
		R 语言的编程方法
		一起练 —— R 语言的编程练习
第一天下午	生信参考文献解读	生信文献的流程解读
		常用的生信分析流程
		流程模块使用的 R包及函数简介
		案例展示
	常用 R函数	统计编程思想与流程
		数据描述性分析 R 实现
		统计分析 R实现
		实战操作演练 ——卡方检验、回归分析、方差分析、Fisher精确检验、相关性分析等
第一天晚上	常用 R包（1）转录组、蛋白组、表观组、代谢组等不同组学数据差异基因筛选及可视化	R包的介绍—— r-project 来源及 Bioconductor 来源
		R包的安装——在线安装及本地安装方法
		芯片数据预处理 ——标准化，归一化
		差异分析 ——差异基因筛选，火山图
		无监督聚类分析 —— PCA 分析，聚类热图分析
第二天上午	常用 R 包（ 2 ）基因、蛋白相关分析	R语言功能富集分析，包括K EGG pathway，以及G O BP, CC, MF 分析，功能条形图，功能气泡图可视化
		共表达分析 ——pearson法，相关性散点图
		生存预后分析 —— KM 曲线图，添加 p值，H R 值
		样本相关性及相关性热图分析
		实操
第二天下午	常用 R包（3）常见思路	单细胞测序相关分析
		RNA甲基化相关分析
		时间序列分析 ——多组连续样本的基因表达聚类
		实操
	R语言学习的方法与技巧	算法思想、 R 包及函数用法、参数说明、范例程序
		如何找到有用的 R 资源
		R 语言学习小窍门
		互动环节与答疑

R语言生信数据分析及可视化作图班【9月10-11日】

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