有人说研究创新很难,但是从基金的角度来说,用上点“高级”词汇还是不难的。今天我们就说一下“
重编程
”。
重编程英文是
Reprogramming
,所以也叫重排(
Rewiring
),我们比较熟悉的有三个:
代谢重编程(
Metabolism Reprogramming
)、表观重编程(
Epigenetic Reprogramming
)和转录重编程(
Transcriptional Reprogramming
)。
总的来说,
重编程比较适合的研究模式是从
A
状态到
B
状态的转换
,比如
经典的巨噬细胞
M1
向
M2
转换、上皮
-
间质转分化(
EMT
)等过程中的代谢、表观和转录重编程。
当然,除了这三个过程的重编程,是否可以做用在其它的过程上呢?下面我们举两个例子:
比如
翻译重编程(
translational reprogramming
)
:
研究主要关注
苏氨酸如何通过
YRDC
介导的翻译重编程促进胶质母细胞瘤的生长
,研究发现
YRDC
是胶质母细胞瘤干细胞中关键的
tRNA
修饰酶,通过形成
t6A
修饰促进肿瘤生长
。具体机制为
苏氨酸作为
YRDC
的底物,通过
YRDC
促进
t6A
形成,从而支持含
ANN
密码子偏向性的有丝分裂相关基因的蛋白表达。
研究主要关注
mTORC1
如何通过
4EBP1/2
控制细胞在葡萄糖饥饿条件下的存活
,研究发现
4EBP1/2
通过翻译抑制
ACC1
来维持
NADPH
稳态,减轻氧化应激,具体机制为
4EBP1/2
促进
NADPH
的稳态,进而减轻氧化应激
。
研究主要关注
翻译重编程如何导致利什曼原虫对锑类药物产生耐药性
,研究发现
耐药株和敏感株在
mRNA
翻译上存在显著差异,表明利什曼原虫通过复杂的适应性变化来补偿因暴露于锑而失去的生物适应性
。具体机制为
耐药寄生虫在暴露于锑时激活了高度选择性的
mRNA
翻译,与表面蛋白重排、能量代谢优化、阿马斯汀上调和抗氧化反应改善相关。
再比如
衰老重编程(
Senescence Reprogramming
)
:
TIMP1
缺乏通过衰老重编程促进前列腺癌转移。
研究主要关注
TIMP1
如何通过改变衰老细胞的分泌表型影响前列腺癌的转移
,研究发现
TIMP1
缺失使衰老细胞促进癌症转移,而消除这些细胞可以抑制转移。具体机制为
TIMP1
的缺失通过激活基质金属蛋白酶
(MMPs)
重编程衰老相关分泌表型
(SASP)
。
化疗诱导的衰老重编程通过
circRNA