专栏名称: 弗雷赛斯
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国自然放这张预实验图,中标概率大增!

弗雷赛斯  · 公众号  · 科研  · 2025-03-06 21:52

正文


2025年国自然即将提交,在 研究基础 部分加入一些高级的图片,会让评审专家眼前一亮,好感大增,比如 分子对接

什么是分子对接?
其实凡是你的研究结果里涉及到 小分子和靶蛋白结合,蛋白和蛋白相互作用 的,都可以增加分子对接的数据,相当于增加了原子水平的的结合证据,研究基础就更加扎实。
比如下图的研究基础,abcd图是不是都很平庸,但e图是不是就让人瞬间眼前一亮呢。

再比如我们平常生信分析里经常会分析到蛋白相互作用,针对某个靶蛋白筛选出一些小分子呀,都可以加上了。实验的时候发现上下游蛋白直接作用.....
分子对接(Molecular docking)就是从 原子水平 ,通过计算机模拟技术,研究分子之间的相互作用过程。

有人会问,这么高端的技术,不会怎么办。

其实可以使用 国内知名科研工具箱平台—— 科研者之家( www.home-for-researchers.com )官网首页上的 这个 零基础 分子对接平台——Dockeasy。

科研者之家官网工具位置(还贴心放了视频教程

这个工具支持 零基础,零代码 ,基于靶蛋白的小分子、多肽、蛋白对接分析,高清结果图可在论文中直接使用。
比如可以做文献中类似这样的图:

比如

再比如

使用方法小白化。

第一步: 登录工具,页面简洁无比,顶部支持小分子,多肽,蛋白质和蛋白质的对接分析,分子哪个选哪个。

左边可见只需三步完成:第一步是从PDB数据库选择蛋白的三维结构(PDB是目前收录蛋白三位结果的数据库,基本上你想研究的蛋白都能找到。),可以直接搜 关键词 或者输入PDB编号。

第二步 系统自动会选择使用原对接口袋(位置)还是全蛋白对接范围。

第三步: 选择小分子,是从PubChem数据库(也是一个收录小分子化合物的权威数据库,基本都能找到), 也可以直接搜 关键词 或者输入CID编号。

第四步:点击 开始对接

出图!

左边按 结合能 排序,越低越好(好理解,需要结合的能量越低,就越说明能结合)

可以 导出对接结果 的原始文件,投稿不用怕了。

直接点击 下载 按钮,设置超高清分辨率,获得高清图片。







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