今天这篇文章，其实怎么说呢？并不是10+文章里比较好的，应该逻辑上还是比较散，存在着一定的逻辑缺陷。今天夏老师讲的是重庆医科大学硕士生和博士生合作的一篇，发表在10.7分的Redox Biol上的文章，讲的是磷酸戊糖途径中关键酶参与抗氧化防御的机制：
他们研究的是癫痫病，在癫痫病中ROS的产生有着比较至关重要的作用，而PPP（磷酸戊糖途径）是可以通过产生NADPH从而抑制ROS产生的。于是，他们就首先分析了癫痫病模型小鼠中，PPP途径相关的蛋白表达情况。他们发现在癫痫病小鼠模型中，糖酵解和磷酸戊糖途径中关键酶G6PD的转录水平和酶活性，均显著高于对照组（通过表达的相关性验证，他们将G6PD与癫痫病之间建立了联系，就着这一步的结果，则能提出进一步的假设迭代，不清楚的话，可以看看《列文虎克读文献》、《信号通路是什么鬼？》系列和《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》）：
那要进一步将G6PD与癫痫病进行绑定，也就是说G6PD应该会在与癫痫病相关的细胞中，表达增加（这个和柯霍氏法则其实是一致的，柯霍氏法则中病毒是与疾病株绑定的）。通过定位，他们发现G6PD与神经元共定位：
接着他们进一步提出一个假设，由于G6PD是PPP途径的关键酶，而PPP途径是抑制ROS的。于是他们提出了新的假设，也就是假设迭代成了G6PD可能是癫痫病发病后，机体本身的一个补偿保护机制（这个假设迭代还是有点意思的，为什么呢？一般在高表达的细胞中，大家都习惯于进行敲减，而这里G6PD如果是起到了一个反馈保护的作用，那这里就需要对G6PD进行过表达了。假设迭代就是要在实验结果的基础上，提出自己新的假设方向，不清楚的话，可以看看《信号通路是什么鬼？》系列和《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》）。于是他们通腺相关病毒过表达G6PD，结果发现G6PD的过表达，会导致海马兴奋性信号传导减少，负向调节癫痫发作：
那么G6PD影响的下游机制是什么呢？他们通过过表达G6PD后的二代测序进行分析，找到了一些差异表达的基因。他们发现G6PD过表达后，下游的STAT1表达会明显增加：
STAT1这个大家应该都熟悉了吧（这个是JAK-STAT信号通路中关键的转录因子，通过JAK激活STAT的磷酸化，使得STAT形成二聚体入核影响靶基因转录，不清楚的话，可以看看《信号通路是什么鬼？》系列复习下），而入核的核STAT1激活，则可以通过直接与NMDAR（N-甲基-d-天冬氨酸受体，GluN1、GluN2A和GluN2B）启动子结合来抑制其表达。NMDAR是神经系统最主要的兴奋性受体，在癫痫的发作过程中占据重要地位：
那么G6PD是如何影响STAT1表达的呢？他们提出了一个假设，假设是G6PD通过抑制ROS产生，从而激活了STAT1。而这里的验证就不太严谨了，这里他们分别通过G6PD的激动剂AG1，以及ROS的清除剂来进行分析，检测对于下游STAT1的表达影响（实际上，这样做很显然是犯了肯定后件的逻辑谬误，由于G6PD与ROS之间的关联性并不是明确的，那么这样的命题在论证的过程中，就会产生逻辑漏洞，要是还不清楚的话，可以去看看《列文虎克读文献》、《信号通路是什么鬼？》系列和《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》）。这样的验证，并不足以证明G6PD—∣ROS—∣STAT1这样的过程。
接着他们又分析了癫痫症模型中G6PD的上游调控，通过JASPER数据库分析，他们找到了两个G6PD的潜在转录因子。并进行了癫痫症模型中这两个转录因子的表达分析，以及对于G6PD的Luciferase分析。（实际上这样的验证其实意义也不是很大，如果要明确这两个转因子的作用，就需要对G6PD的启动子上转录因子结合位点进行突变，然后分析突变后癫痫症症状表型。这样就能避免验证过程中的逻辑漏洞，不清楚的话，可以去看看《科研的推理和逻辑：从实验台到咖啡桌》）：
既然G6PD会起到缓解癫痫症症状的作用，于是他们就使用了G6PD的激动剂AG1，对小鼠进行了体内的验证实验。结果发现，G6PD的激活剂AG1，的确能减轻癫痫发作易感性：
最后就形成了这样的示意图，也就是G6PD通过降低ROS产生，促进了STAT1的表达，从而抑制了NMDAR的表达，达到缓解癫痫症的症状：
实际上这篇文章整体来说，每个步骤都做了一点，包含了G6PD的上游调控和下游调控，但每个步骤都没有完全串联起来，故事讲得就很松散。其实只要在几个启动子结合的验证过程中，设计得更严谨一些，这应该还可以是一篇不错的文章。不知道大家读完这篇文章，是否也会有这样的感受呢？好了，今天就先策到这里吧，有兴趣的话，可以看看原文，祝你们心明眼亮。
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