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博士就发了14.5分的Cell大子刊,这厦门大学的文章,做的类似于用臭鸡蛋来刺激铁死亡,挺有意思……

实验万事屋  · 公众号  · 科研  · 2024-11-11 08:20

正文

今天讲的这篇铁死亡的文章有点意思,差不多就是用臭鸡蛋来刺激铁死亡(铁死亡想必大家都特别熟悉了,也就是通过铁离子产生的芬顿反应,导致脂质ROS增多,而胱氨酸通过合成GSH,可以抑制铁死亡,不熟悉的话,可以回去翻翻《信号通路是什么鬼?》系列)。这篇文章是厦门大学的博士,发表在14.5分的Cell子刊Mol Cell上的文章。这篇文章的机制其实并不复杂,但推理的过程倒是挺有意思,他们发现H2S(硫化氢)可以通过抑制Hcy(同型半胱氨酸)代谢,提高肿瘤细胞在缺乏胱氨酸的条件下,铁死亡的敏感性:



这里他们肯定不能直接在培养基里加臭鸡蛋,而是使用了H2S的供体GYY4137,他们在肿瘤细胞培养的过程中,使用了两种培养基,一种是完全培养基,另一种是胱氨酸缺陷培养基。他们发现在这两种培养基中,加入GYY4137后,完全培养基并没有产生什么变化,而胱氨酸缺陷的培养基中脂质ROS导致的细胞死亡增多。为此他们也分析了脂质过氧化的积累和蛋白质标志物的变化,这里他们做了HO-1、ACSL4、COX2和GPX4(这几个是铁死亡相关的蛋白标志,这个看过《信号通路是什么鬼?》系列熟悉铁死亡的同学,应该都清楚,但4-HNE则是脂质ROS的代谢标志,这个在《信号通路是什么鬼?》系列中铁死亡的检测方法中也讲过)。结果发现H2S的确促进了NSCLC(非小细胞肺癌)细胞的铁死亡:



那么H2S是如何造成细胞铁死亡敏感的呢?于是他们进行了代谢组学的分析(其实这里他们就已经进行了假设的迭代,不能一直纠结在铁死亡的途径上,肯定是由于存在H2S影响的某种途径,导致了铁死亡产生了变化,而H2S作为一个化合物,能影响的代谢途径的概率更高,于是假设就迭代成了H2S对代谢途径的影响,不清楚假设迭代的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》和《列文虎克读文献》),结果发现加入GYY4137与对照组之间差异的代谢产物,主要富集在与铁死亡相关的半胱氨酸和Met代谢途径上。GYY4137处理,会显着降低GSH(谷胱甘肽)和半胱氨酸的水平。为了确定H2S在转硫途径上,具体是什么位置影响了GSH的含量,他们又分别分析了几个关键节点的代谢产物, Met(甲硫氨酸)、SAM(S-腺苷甲硫氨酸) 、SAH(S-腺苷同型半胱氨酸)和Hcy的水平。结果发现H2S主要抑制调控的,是转硫途径介导的Hcy合成:



那么H2S既然能影响Hcy的合成,那应该会通过Hcy合成途径上的蛋白来实现。而H2S又可以通过S-sulfhydration(过硫化)来调节蛋白质的活性。于是他们就又进一步假设迭代成了,假设H2S可以通过过硫化某个Hcy合成过程中的关键蛋白,来影响Hcy的合成。于是他们使用了HPDP(吡啶基二硫醇)-生物素开关法,来亲和结合带有过硫化修饰的蛋白,然后分析蛋白序列,结果发现SAHH很可能是H2S的靶标。SAHH是合成Hcy的关键基因,但在这里他们在证明的过程中,直接敲减了SAHH,以此证明SAHH对于铁死亡敏感的意义:



既然H2S能对SAHH进行过硫化修饰,那么具体的过硫化修饰的位点就比较的关键了。通过质谱,他们发现SAHH的第195位半胱氨酸,就是H2S对SAHH过硫化的位点。然后通过对SAHH的195位半胱氨酸突变,他们分析了H2S对细胞活性的影响(之前直接敲减SAHH,并没有将H2S的功能归因,也就是说之前的证明并不能说明是H2S通过SAHH诱发的铁死亡,会存在肯定后件的逻辑谬误,不清楚肯定后件的话,可以去看看《科研的推理和逻辑:从实验台到咖啡桌》、《列文虎克读文献》和《信号通路是什么鬼?》系列;但这里他们分析了H2S对于SAHH的过硫化位点,并进行了突变,而突变后对于细胞的死亡表型进行了分析,这里就是比较严谨的论证了):



接着,他们又进行了H2S通过诱导铁死亡敏感,进行了体内的抗肿瘤研究:



最后,他们分析了SAHH对于肿瘤预后的影响。这里大家应该能理解,H2S是通过对SAHH的过硫化,抑制SAHH的酶活性,降低了Hcy的合成,从而促进了肿瘤细胞的铁死亡。而SAHH的活性如果增强,则Hcy的含量增加,对于肿瘤细胞的铁死亡则又产生了抵抗的能力。所以他们要分析SAHH对于肿瘤预后的影响,结果发现SAHH的高表达,与LUAD(肺腺癌)的不良结局相关:



然后,他们形成了这样的示意图,H2S可以通过对SAHH的195位半胱氨酸过硫化,降低SAHH的酶活,抑制Hcy合成。在这个基础上,降低培养基中胱氨酸的含量,可以使得细胞内胱氨酸/半胱氨酸含量降低,抑制GSH产生,直接导致肿瘤细胞的铁死亡敏感(图上直接使用了Erastin,抑制SLC7A11向细胞内泵入胱氨酸,这个是铁死亡经典的激活剂了,在《信号通路是什么鬼?》系列铁死亡那几章中也介绍过):



这篇文章,思路十分清晰,研究的推进也很能体现科研活动中假设迭代和推理的过程,这已经比很多同类型的文章要优秀了。好了,今天就先策到这里吧,有兴趣的话可以看看原文,祝你们心明眼亮。

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