作为一种老药,是否具有基础研究价值呢?是不是除了多中心临床研究外,很难发到高分杂志呢?来自海南省人民医院、武汉大学人民医院、首都医科大学宣武医院等团队的学者对于这一问题给出了答案:老药同样具有很高的基础研究价值,特别是当老药发现新功能,并挖掘出新机制的时候,一切都将变得有趣起来。如果大家有基金申请或者课题思路上的疑问,可以联系我们进行咨询:
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本期就让我们一起由这篇发表在Cell Reports Medicine杂志上的文章:The SGLT2 inhibitor dapagliflozin ameliorates renal fibrosis in hyperuricemic nephropathy. 一起看看,如何能把老药做新,我们又是否可以模仿?
本文研究了SGLT2抑制剂达格列净(主角药物)通过靶向ERRα调节OAT1轴(信号轴),增强尿酸排泄,从而改善高尿酸血症肾病(HN)中的肾纤维化和肾功能(临床问题),突出了ERRα-OAT1轴在治疗HN中的潜在价值。
1、为何关注SGLT2抑制剂达格列净与HN中的肾纤维化?本文的临床意义是什么?
临床的困境:HN是一种与尿酸代谢紊乱相关的肾脏疾病,其特征是肾小管间质纤维化和肾功能减退。肾纤维化是慢性肾病进展的关键病理过程,减缓肾纤维化对于阻止或逆转肾功能衰竭至关重要。
全新靶点与老药新用:虽然达格列净最初是作为糖尿病治疗药物开发的,但这项研究扩展了其在非糖尿病肾病,特别是HN中的潜在应用,为临床医生提供了更多的治疗选项。全新的治疗作用,意味着全新的机制,研究成功证实了ERRα-OAT1轴在HN发病机制中的作用,为未来的药物开发和治疗提供了新的分子靶点。
2、为何选择SGLT2抑制剂达格列净作为主角药物进行研究,依据是什么?如何进行证实?
文章发现达格列净治疗的患者肾脏组织学检查显示肾小管损伤减轻,同时血清肌酐和血尿素氮水平下降,免疫荧光染色观察到治疗组能够降低肾纤维化标志物,如aSMA和FN1。同样的,研究者在动物模型中也得到了一致结果。
3、文章进一步拔高的关键在于机制,其中通路的首个分子ERRα,是如何被发现的?
为了探索机制,研究者对HN患者和动物模型的肾脏组织进行Bulk RNA-seq,发现ERRα是一个在HN中表达下调的转录因子。研究者通过文献调研也发现ERRα在代谢过程中发挥作用,且与肾脏疾病有关(ps:测序+文献调研关键分子是很多article研究机制的套路)。
下一步最关键的就是:关键分子ERRα的正反验证。研究者发现在ERRα被敲除的细胞系中,达格列净的使用也无法阻止纤维化标志物的持续上调、ROS的过度产生、线粒体的碎片化,以及OCR和ATP的减少。而ERRα过表达的HN小鼠在尿酸、肾功能、纤维化指标上,却表现的很好。
4、既然起始分子找到了,那么又是如何找到ERRα的下游靶点的呢?
事实上,这一部分的内容,先行军就是生信分析,研究者通过富集分析探索了ERRα可能调控的生物学过程和通路,又使用了JASPAR数据库预测ERRα的结合基序,并在OAT1基因的启动子区域寻找这些基序。
但是光光生信的分析结果又不solid,验证方面研究者怎么做呢?
通过ChIP-seq检测了ERRα蛋白在OAT1基因上的结合情况,并验证了OAT1是ERRα的直接靶点。
双荧光素酶报告基因分析:构建含有OAT1基因启动子区域的野生型(WT)和突变型(MUT)报告基因载体,通过双荧光素酶报告基因分析,研究者评估了ERRα对OAT1启动子活性的影响。
分子对接模拟:使用分子对接软件,如AutoDock Vina,研究者模拟了ERRα蛋白与OAT1基因启动子区域的结合模式,进一步证实了它们之间的相互作用。
体内外实验验证:在体内(如ERRαptKI小鼠模型)和体外(如HK-2细胞)实验中,研究者验证了ERRα过表达或敲除对OAT1表达和功能的影响。
由分子对接层面,到细胞、动物分子互相影响的层面,逐一验证,这类验证思路也值得大家好好学习。而本文从临床现象,到机制的挖掘也是一气呵成,看的小编也是酣畅淋漓,不得不感慨高分文章其故事讲的圆满,引人入胜。
本文在机制这一块,所用的关键技术较为密集:
利用染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)确定ERRα转录因子在基因组上的结合位点
采用双荧光素酶报告基因分析探究ERRα对OAT1基因启动子活性的影响
细胞热位移分析(CETSA)来评估药物对细胞活性和蛋白质稳定性的影响
分子对接模拟、表面等离子共振(SPR)和微量热泳动(MST)分析来预测和测量药物与靶蛋白之间的相互作用
老药新用,深挖机制:传统上,达格列净被用于治疗2型糖尿病,主要通过抑制肾脏中的SGLT2来减少葡萄糖的重吸收。然而,本文揭示了达格列净通过靶向转录因子ERRα,进而调节尿酸转运蛋白OAT1的活性,这一机制在HN的治疗中具有潜在的应用价值。
ERRα-OAT1轴的调控关系:本文通过ChIP-seq分析,确定了ERRα在OAT1基因启动子上的结合位点;并通过双荧光素酶报告基因分析等验证了ERRα对OAT1启动子活性的正向调控作用。一系列实验验证使得这一条机制通路的证据十分solid。
事实上,这一研究思路并非本文独有,不妨让我们来看下面这篇文章:SGLT2 inhibitor dapagliflozin reduces endothelial dysfunction and microvascular damage during cardiac ischemia/reperfusion injury through normalizing the XO-SERCA2-CaMKII-coffilin pathways.
这篇文章同样是达格列净这一药物,而研究者想解决的问题:该药是否有保护心脏微血管内皮细胞免受缺血/再灌注损伤(IRI)的作用(全新功能的探索)?并探讨其分子机制。
两篇文章思路上可以类比,达格列净作为一种SGLT2抑制剂,在糖尿病治疗中显示出心血管保护作用,此文中研究的问题就是:格列净可能通过影响特定的信号通路,对心脏微血管具有保护作用。
进一步,研究者利用小鼠IRI模型(类比HN小鼠模型),评估DAPA对心脏微血管结构和功能的影响。同时利用人冠状动脉内皮细胞(HCAECs)的缺氧/再灌注(H/R)模型(类似HN患者),研究DAPA对内皮细胞功能的影响。
文章的最终结论同样地类似:达格列净(同一种药物)通过抑制XO-SERCA2-CaMKII-cofilin信号通路(机制通路),有效减少心脏微血管损伤和内皮细胞功能障碍(细胞靶点),为心脏IRI(临床问题)提供了新的治疗策略。