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海南省人民医院发Cell子刊文章:老药发现了新功能,挖掘出了新机制,评审专家很难不感兴趣呀!

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2024-09-25 20:00

正文


作为一种老药,是否具有基础研究价值呢?是不是除了多中心临床研究外,很难发到高分杂志呢?来自海南省人民医院、武汉大学人民医院、首都医科大学宣武医院等团队的学者对于这一问题给出了答案:老药同样具有很高的基础研究价值特别是当老药发现新功能,并挖掘出新机制的时候,一切都将变得有趣起来

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本期就让我们一起由这篇发表在Cell Reports Medicine杂志上的文章:The SGLT2 inhibitor dapagliflozin ameliorates renal fibrosis in hyperuricemic nephropathy一起看看,如何能把老药做新,我们又是否可以模仿


主要研究内容


本文研究了SGLT2抑制剂达格列净主角药物通过靶向ERRα调节OAT1信号轴增强尿酸排泄,从而改善高尿酸血症肾病(HN)中的肾纤维化和肾功能临床问题,突出了ERRα-OAT1轴在治疗HN中的潜在价值。


科学问题


1、为何关注SGLT2抑制剂达格列净HN中的肾纤维化?本文的临床意义是什么?


  • 临床的困境:HN是一种与尿酸代谢紊乱相关的肾脏疾病,其特征是肾小管间质纤维化和肾功能减退。肾纤维化是慢性肾病进展的关键病理过程,减缓肾纤维化对于阻止或逆转肾功能衰竭至关重要


  • 全新靶点与老药新用:虽然达格列净最初是作为糖尿病治疗药物开发的,但这项研究扩展了其非糖尿病肾病,特别是HN中的潜在应用,为临床医生提供了更多的治疗选项。全新的治疗作用,意味着全新的机制,研究成功证实了ERRα-OAT1轴在HN发病机制中的作用,为未来的药物开发和治疗提供了新的分子靶点。


2为何选择SGLT2抑制剂达格列净作为主角药物进行研究,依据是什么?如何进行证实


  • 在临床上,糖尿病肾病患者使用达格列净后,蛋白尿显著降低,并缓解肾功能的减退,且有研究表明达格列净能够降低血清尿酸(UA)水平,这也是本文的研究基础。


  • 因此,本文的第一步首先是重复之前文章报道的关于达格列净能够降低UA的这一现象。


文章发现达格列净治疗的患者肾脏组织学检查显示肾小管损伤减轻,同时血清肌酐和血尿素氮水平下降,免疫荧光染色观察到治疗组能够降低肾纤维化标志物,如aSMAFN1。同样的,研究者在动物模型中也得到了一致结果。



3、文章进一步拔高的关键在于机制,其中通路的首个分子ERRα,是如何发现的


为了探索机制,研究者对HN患者和动物模型的肾脏组织进行Bulk RNA-seq发现ERRα是一个在HN中表达下调的转录因子。研究者通过文献调研也发现ERRα在代谢过程中发挥作用,且与肾脏疾病有关ps测序+文献调研关键分子是很多article研究机制的套路)。


下一步最关键的就是:关键分子ERRα的正反验证。研究者发现在ERRα被敲除的细胞系中,达格列净的使用也无法阻止纤维化标志物的持续上调、ROS的过度产生、线粒体的碎片化,以及OCRATP的减少。ERRα过表达的HN小鼠在尿酸、肾功能、纤维化指标上,却表现的很好。


 

4、既然起始分子找到了,那么又是如何找到ERRα的下游靶点的呢


事实上,这一部分的内容,先行军就是生信分析,研究者通过富集分析探索了ERRα可能调控的生物学过程和通路,又使用了JASPAR数据库预测ERRα的结合基序,并在OAT1基因的启动子区域寻找这些基序


 

但是光光生信的分析结果又不solid验证方面研究者怎么做呢?


  • 通过ChIP-seq检测了ERRα蛋白在OAT1基因上的结合情况验证了OAT1ERRα的直接靶点。


  • 双荧光素酶报告基因分析:构建含有OAT1基因启动子区域的野生型(WT)和突变型(MUT)报告基因载体,通过双荧光素酶报告基因分析,研究者评估了ERRαOAT1启动子活性的影响。


  • 分子对接模拟:使用分子对接软件,如AutoDock Vina,研究者模拟了ERRα蛋白与OAT1基因启动子区域的结合模式,进一步证实了它们之间的相互作用。


  • 体内外实验验证:在体内(如ERRαptKI小鼠模型)和体外(如HK-2细胞)实验中,研究者验证了ERRα过表达或敲除对OAT1表达和功能的影响。


分子对接层面,到细胞、动物分子互相影响的层面,逐一验证,这类验证思路也值得大家好好学习。而本文从临床现象,到机制的挖掘也是一气呵成,看的小编也是酣畅淋漓,不得不感慨高分文章其故事讲的圆满,引人入胜。


关键实验技术


本文在机制这一块,所用的关键技术较为密集:


  • 染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq确定ERRα转录因子在基因组上的结合位点


  • 采用双荧光素酶报告基因分析探究ERRαOAT1基因启动子活性的影响


  • 细胞热位移分析(CETSA评估药物对细胞活性和蛋白质稳定性的影响


  • 分子对接模拟、表面等离子共振(SPR)和微量热泳动(MST)分析来预测和测量药物与靶蛋白之间的相互作用


研究亮点


老药新用,深挖机制:传统上,达格列净被用于治疗2型糖尿病,主要通过抑制肾脏中的SGLT2来减少葡萄糖的重吸收。然而,本文揭示了达格列净通过靶向转录因子ERRα,进而调节尿酸转运蛋白OAT1的活性这一机制在HN的治疗中具有潜在的应用价值


ERRα-OAT1轴的调控关系本文通过ChIP-seq分析,确定了ERRα在OAT1基因启动子上的结合位点;并通过双荧光素酶报告基因分析等验证了ERRα对OAT1启动子活性的正向调控作用。一系列实验验证使得这一条机制通路的证据十分solid


思路拓展


事实上,这一研究思路并非本文独有,不妨让我们来看下面这篇文章:SGLT2 inhibitor dapagliflozin reduces endothelial dysfunction and microvascular damage during cardiac ischemia/reperfusion injury through normalizing the XO-SERCA2-CaMKII-coffilin pathways.


 

这篇文章同样是达格列净这一药物,而研究者想解决的问题:该药是否有保护心脏微血管内皮细胞免受缺血/再灌注损伤(IRI)的作用全新功能的探索)?并探讨其分子机制


两篇文章思路上可以类比达格列净作为一种SGLT2抑制剂,在糖尿病治疗中显示出心血管保护作用,此文中研究的问题就是:格列净可能通过影响特定的信号通路,对心脏微血管具有保护作用


进一步,研究者利用小鼠IRI模型(类比HN小鼠模型),评估DAPA对心脏微血管结构和功能的影响。同时利用人冠状动脉内皮细胞(HCAECs)的缺氧/再灌注(H/R)模型(类似HN患者),研究DAPA对内皮细胞功能的影响


文章的最终结论同样地类似:达格列净同一种药物通过抑制XO-SERCA2-CaMKII-cofilin信号通路机制通路有效减少心脏微血管损伤和内皮细胞功能障碍细胞靶点为心脏IRI临床问题提供了新的治疗策略