专栏名称: 深圳国家基因库

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甜咸党都看过来，粽子基因组“露馅儿”啦

深圳国家基因库 · 公众号 · 深圳 · 2017-05-30 06:33

正文

活色生香中国粽，各地风情大不同：花椒遇到辣椒，枣子亲吻糯米，猪肉和卤锅相敬如宾。美食在激烈地碰撞，粽子里藏着花样的惊喜。

随着基因测序技术的不断发展，粽子基因组也“露馅儿”啦。

粽子的灵魂——糯米

水稻的基因组大小：约466MB。

糯米由糯稻而来，是水稻的一种。水稻是最重要的粮食作物之一，全世界一半以上的人口以水稻为主食。“我吃的盐比你吃的米还多”，父母挂在嘴边的谚语，都侧面反映出水稻在老百姓心中的地位。

由华大基因发起，中科院遗传所和国家杂交水稻工程技术研究中心等合作参加的“中国超级杂交水稻基因组计划”于2000年4月26日正式启动。2001年10月12日，中国科学家向全世界宣布，中国率先完成水稻（籼稻）基因组工作框架图的绘制，并免费公布全部序列数据。2002年4月，国际权威杂志《科学》以14页的篇幅发表《水稻（籼稻）基因组的工作框架序列图》，并以青山衬托下的一片金灿灿的云南哈尼梯田作为该期的封面。这次科研成果，让人类第一次对养活世界一半人口的水稻有了全基因组层次的了解，同时《科学》杂志还配以大量评论文章，高度评价这一工作是“具有最重要意义的里程碑性工作”，对“新世纪人类的健康与生存具有全球性的影响”，“永远改变了我们对植物学的研究”，并祝贺论文作者“对世界科学乃至全人类里程碑式的贡献。

是不是似曾相识？

国家基因库建筑的创意灵感来自于哈尼梯田

记忆里的——枣粽

枣（鼠李科、枣属）基因组大小约为444MB。

枣果——传统的滋补佳品，竟还是世界上已知Vc含量最为丰富的果品之一，更PK掉柑橘和猕猴桃。

2014年，河北农业大学及华大基因研究人员在《自然•通讯》杂志上（Nature Communications）发表了枣基因组测序重大研究成果（The complex jujube genome provides insights into fruit tree biology）。这标志着我国在枣基因组学研究方面达到了国际领先水平，在世界上率先完成了枣树的高质量全基因组测序，并使枣树成为世界鼠李科植物和我国干果树种中第一个完成基因组测序的物种。此外，该研究团队还通过比较基因组研究，结合果实发育期转录组测序和Vc代谢的深入分析，首次发现枣果同时具有柑橘和猕猴桃两种积累Vc的分子机制，揭秘了枣果大量积累Vc的内在机制。

风味十足——辣粽

辣椒（辣椒属）基因组大小约为3.35 Gb, 3.48 Gb。

自从1492年哥伦布从美洲返回及随后的航海探索，辣椒即可传遍到世界各地。这是由于辣椒能够适应于不同的农业气候，并被具有不同文化背景的人们快速接受。

深圳华大基因研究院联合多家单位，共同完成了野生辣椒与栽培辣椒的基因组测序工作，揭示了辣椒的进化与驯化规律。这项科研成果对研究辣椒及茄科基因组的进化提供了非常有价值的遗传信息，并且将有助于建立更加有效的辣椒育种改良方法。相关研究成果已于2014年1月19日，发表在美国《国家科学院院刊》（PNAS）杂志上。

无肉不欢——肉粽

家猪基因组大小约为2.6Gb。

家猪作为人类最早驯化的动物之一，是全球最大的肉类食品来源之一。

2012年11月，由华大基因参与完成的关于家猪全基因组测序的文章在《自然》（Nature）杂志上发表。国际家猪基因组测序协作组（SGSC）主要选取作为重要肉类来源的家猪品系——杜洛克猪（Duroc breed）进行了全基因组测序，另外还对亚洲野猪、亚洲家猪和欧洲品系等进行了重测序研究。家猪基因组测序协作组完成的基因组和基因注释在ENSEMBL下载使用：http://asia.ensembl.org/Sus_scrofa/Info/Index

端午佳节

怀念先人

血脉相承传千年文化

基因测序

解读自然

存读写万物精华

我国地广物博，所以包粽子，咱们可以任性，花样百出。国家基因库生物活体库致力于打造成为中国诺亚方舟，保护和保存世界约三十万种植物、百万种动物、近千万种微生物活体资源，建设应用、健康、全球生物多样性示范基地和活体示范库。

目前生物活体库已开展全球第一个环境生态系统全面数字化和深入组学研究瑞丽植物园数字化项目，建设广东河源活体库、西藏高原库、青海高原活体示范库等等，存储健康大人群的全生命周期细胞资源，并与数字化平台、合成与编辑平台等联动，促进资源数字化和多组学研究，推动重要种质资源数字化和全球共享，带动微生物生产、能源利用产业、动植物繁殖和培育产业、精准营养、精准医学、健康管理产业等的发展，实践创新性应用。

拓展阅读🙋

1、Jun Yu, Songnian Hu, Jun Wang,et al. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. indica). Science, 2002 Apr 5; 296(5565):79-92.

（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11935017）

2、The Rice 3000 Genomes Project Data

（http://dx.doi.org/10.5524/200001）

3、tMeng-Jun Liu,Jin Zhao,Qing-Le Cai, et al. The complex jujube genome provides insights into fruit tree biology Nat Commun. 2014 Oct 28;5:5315. doi: 10.1038/ncomms6315.

（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25350882）

4、辣椒数据库网站

（http://peppersequence.genomics.cn）

5、Cheng Qin, Changshui Yu, Yaou Shen, et al.

Whole-genome sequencing of cultivated and wild peppers provides insights into Capsicum domestication and specialization Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Apr 8;111(14):5135-40. doi: 10.1073/pnas.1400975111.

(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24591624)

6、家猪基因组测序协作组完成的基因组和基因注释（http://asia.ensembl.org/Sus_scrofa/Info/Index）

快到碗里来