昨晚有个粉丝找我抱怨,他老板最近刚拿到了一个新的项目,钱虽然不多但 35 万是有的,导师让他省着点花,让他毕业时发 2 篇至少 5 分的文章,这里面还包括劳务费、差旅费等杂费,满打满算剩个 30 万算是好的了。
30 万发两篇 5 分的?作为初级实验室小白、不太懂行情的他,来问 X 师兄这么点钱到底够不够花。相比之下,师兄顿时觉得自己的导师是一个大好人,至少给的经费没这么紧巴。
那么当老板给你的经费不充裕,要你积极发挥主观能动性的时候,如何优雅从容地发SCI呢?
首先做到心中有数,完成一篇 SCI 文章的工作需要哪些步骤?以临床样本出发的 SCI 文章有没有通用的模板呢?小张团队总结了一下,大家来看看对不对:
(图片来自于讲座《以lncRNA为例设计发表SCI》,请关注)
其中目标分子临床意义的确定是最基础也最重要,而分子机制是最烧钱和最烧脑同时也是风险最大的部分,因为很容易「人还在呢钱却没了」。
1~2 分的文章是最简单的了,嗖嗖嗖地做个芯片,啾啾啾地做个 RNA-seq,分析、验证之后,就可以写文章了,这个档次文章的工作量如下:
临床部分:★★☆☆☆
细胞功能:★★★☆☆
动物实验:☆☆☆☆☆
分子机制:☆☆☆☆☆
【文章举例】Long non-coding RNA expression profiles ingallbladder carcinoma(膀胱癌) identified using microarray analysis.Oncol Lett. 2017 May. IF=1.4
【方案设计】3对3芯片检测→聚类热图→lncRNA、mRNA的表达差异→qPCR验证→GO注释和pathway功能富集→共表达网络图(cytoscape)→部分细胞表型(增殖、转移)
【成本估算】6~10万
【类似文章】
A genome-wide association scanof biological processes involved in oral lichen planus and oral squamous cellcarcinoma.Medicine. 2017 Jun
Heart failure: Pilottranscriptomic analysis of cardiac tissue by RNA-sequencing.Cardiol J. 2017 May12.
Expression Profile of LongNoncoding RNAs in Human Earlobe Keloids: A Microarray Analysis.Biomed Res Int.2016
临床部分:★★★★★
细胞功能:★★★★★
动物实验:☆☆☆☆☆
分子机制:☆☆☆☆☆
【文章举例】Overexpression of long noncoding RNA H19 indicates a poor prognosisfor cholangiocarcinoma(胆管癌) and promotes cell migration and invasion by affectingepithelial-mesenchymal transition. Biomed Pharmacother.2017 May. IF=2.8
【方案设计】读文献确定研究H19→qPCR验证(细胞株、临床样本)→预后、病例参数相关性→完整细胞功能实验(表型变化、分子表达)
【成本估算】8~20万
【类似文章】
Upregulation of the longnon-coding RNA SPRY4-IT1 indicates a poor prognosis and promotes tumorigenesisin ovarian cancer.Biomed Pharmacother. 2017 Apr
A long noncoding RNA UCA1promotes proliferation and predicts poor prognosis in glioma.Clin Transl Oncol.2017 Jun
Long non-coding RNA ZFAS1 is anunfavourable prognostic factor and promotes glioma cell progression.Biomed Pharmacother. 2017 Mar
临床部分:★★★★★
细胞功能:★★★★★
动物实验:★★★★★
分子机制:★☆☆☆☆
【文章举例】Upregulation of the long non-coding RNA FALEC promotes proliferationand migration of prostate cancer(前列腺癌) cell lines and predicts prognosis of PCa patients.Prostate. 2017 Jun 6. IF=3.8
【方案设计】读文献确定FALEC→qPCR验证(细胞株、临床样本)→预后、病例参数相关性→细胞功能 (表型变化、分子表达)→动物体内肿瘤模型(表型变化、分子表达)
【成本估算】15~25万
【类似文章】
Prognostic implication andfunctional role of long noncoding RNA IGF2AS in human non-small cell lung cancer.J Cell Biochem. 2017 May 4
Long noncoding RNA SchLAHsuppresses metastasis of hepatocellular carcinoma through interacting withfused in sarcoma.Cancer Sci. 2017 Apr
Long noncoding RNA ATB promotesosteosarcoma cell proliferation, migration and invasion by suppressing miR-200s.AmJ Cancer Res. 2017 Apr 1
临床部分:★★★★★
细胞功能:★★★★★
动物实验:★★★★★
分子机制:★★★★☆
【文章举例】Long non-coding RNA HOXA-AS2 promotes proliferationand invasion of breast cancer(乳腺癌)by acting as a miR-520c-3p sponge. Oncotarget. 2017May 2.IF=5.2
【方案设计】读文献确定研究HOXA-AS2→qPCR验证(细胞株、临床样本)→预后、病例参数相关性→细胞功能 (表型变化、分子表达)→动物疾病模型→ceRNA机制研究
【成本估算】18~30万
【类似文章】
Long Non-Coding RNA MALAT1Decreases the Sensitivity of Resistant Glioblastoma Cell Lines to Temozolomide.Cell PhysiolBiochem. 2017 Jul
Long non-coding RNA UBE2CP3promotes tumor metastasis by inducing epithelial-mesenchymal transition inhepatocellular carcinoma.Oncotarget. 2017 Jun 16
Long Non-Coding RNA XLOC_008466Functions as an Oncogene in Human Non-Small Cell Lung Cancer by TargetingmiR-874.CellPhysiol Biochem.2017
PS:文中文章举例仅供参考,还有其他很多模式可选。
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① 临床样本出发的研究
② 细胞功能为主的研究
③ 动物模型出发的研究
④ 基于高通量组学数据的研究
每个套路课程分别通过以下 7 个章节来展开:
① 套路介绍
② 文章案例解读(3 个案例)
③ 常用的数据库操作演示
④ 实例展示如何分析和作图
⑤ 从结果到成文
⑥ 杂志选择
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