推广：8.21-25 | 您不可不来的“实用生物信息学研讨班”

生信人 · 公众号 · 生物 · 2017-07-29 07:50

正文

实用生物信息学研讨班

8.21-25

研讨班介绍

为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，北京市计算中心生物计算事业部与北京博奥晶典生物技术有限公司联合举办“实用生物信息学”研讨班。

课程时间

2017年8月21日-25日（报名中）

上午：9：30 - 12：00 下午：13：30 – 17：00

培训地点

北京海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼，北京市计算中心三层会议室

授课老师

一流的讲师团队，经验丰富！

授课教师来自北京市计算中心、军事医学科学院、北京博奥晶典生物技术有限公司，每个讲师都在生物信息学、基因组学领域有丰富的工作经验，名副其实的“大牛技术咖”！

讲实战：理论+上机！

理论课程+上机操作，结合具体案例讲解，基础和进阶需求均能满足。

零基础

非“生信”出身

没关系，专门为您定制的培训课程：

首先带您——快速入门分析：满足您对已有数据和结果的深入挖掘需求，满足个性调整及发文硬性的需求。

然后带您——实力稳步进阶：系统学习生信分析的操作和常用语言基础，深入学习测序、芯片的结果分析原理和标准流程，带你走进IT+BT的殿堂。

培训班日程

日期	上课时间	授课题目	授课内容
第一天	9：30-12：00	生物信息学导论与前沿	1、生物信息背景与研究进展； 2、新一代测序技术前沿介绍； 3、10X Genomics测序技术与平台介绍；（1h）
	9：30-12：00	生物信息学数据库及公共资源介绍	1、生物信息学数据库与公共生物信息资源与应用NCBI数据库介绍：PubMed、GenBank、Entrez等，数据查询检索；GEO、SRA数据库使用； KEGG数据库介绍；
	13：30-17：00	生物信息学基础（上机操作）	1、linux基础：掌握Linux系统下的常用命令掌握linux环境下软件的安装使用了解shell脚本的编写 2、perl基础：介绍Perl 的基本元素 Perl在生物信息中应用示例
第二天	9：30-12：00	二代测序技术原理及基因组拼接	1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理； 2、主要操作流程及特点； 3、序列拼接的技术方法； 4、常用软件及全基因组个性化组装的技巧；
第二天	13：30-17：00	基因组拼接组装（以细菌/病毒为例）（上机操作）	1、全基因组组装的流程介绍； 2、原始测序数据的预处理； 3、分别介绍Velvet和SOAPdenovo的使用，并以一株细菌的测序数据为例进行组装； 4、介绍Newbler的使用，并以噬菌体数据为例进行组装； 5、以细菌的数据为例，介绍填补gap的方法，包括延伸法，局部拼接法；
第三天	9：30-12：00	基因组重测序与数据分析	1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用； 2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识；
第三天	13：30-17：00	基因组重测序数据分析实例（上机操作）	1、对二代测序数据的解读； 2、数据质量控制及数据过滤； 3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化； 4、寻找SNP和Indel并进行注释； 5、寻找结构变异并对变异进行注释；
第四天	9：30-12：00	转录组测序与数据分析	1、转录组基本概况和研究前沿介绍：包含mRNA/miRNA/lncRNA/circRNA及全转录本和ceRNA的概念介绍； 2、转录组测序技术流程及技术细节； 3、转录组芯片主流产品介绍(1h)； 4、转录组应用案例；
第四天	13：30-17：00	转录组数据分析实例（上机操作）	1、转录组数据准备和软件介绍及安装； 2、转录组数据的比对； 3、表达量估计和分析； 4、后续功能分析简介；
第五天	9：30-17：00	测序和芯片数据二次分析与文章发表应用	1、利用DAVID免费在线分析工具进行基因功能分析，结果解读； 2、基于String、DIP等数据库的蛋白质相互作用分析与图形可视化； 3、利用Cytoscape 绘制生物分子交互作用复杂网络图、生物学通路的方法及技术应用； 4、利用ENCOLD、RegulomeDB对疾病突变位点进行功能性分析； 5、利用R的绘图命令绘制常见的图表（散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制）