诺禾致源玉米NGP-ZM50K泛性状芯片产品发布（内含免费送样检测活动）

植物科学最前沿 · 公众号 · · 2024-06-06 17:13

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诺禾致源玉米NGP-ZM50K泛性状芯片产品发布（内含免费送样检测活动）

玉米是全球种植范围最广、产量最大的谷类作物，居三大粮食(玉米、小麦、大米)之首。我国是玉米生产和消费大国，播种面积、总产量、消费量仅次于美国，均居世界第二位。 然而据国家统计局公布的数据显示，2021年中国玉米平均亩产量为419公斤左右，而美国的玉米亩产量高达735公斤，是中国的1.75倍。 据美国农业部公布数据显示，2022年美国玉米产量是中国的1.7倍。同时目前国内玉米缺口仍然较大，对国际市场依赖度相对较高。增加玉米产量，是确保我国玉米产业持续稳定发展的关键。通过分子育种等前沿技术应用，着力培育抗逆、高产、优质、适于密植和机械化作业等具有重大应用价值和自主知识产权的突破性新品种是解决这一问题的关键。

面对玉米国内单产量低、供需两旺、缺口较大、易受国际环境影响的现状，诺禾致源致力于与国内育种家一同寻求解决方案来缓解国内玉米育种的迫切需求，同时基于诺禾致源多年的多组学分子育种经验和积累，推出 NGP-ZM50K （Novogene breeding 50K Germplasm resource screening panel）玉米泛性状检测液相芯片，为玉米育种家提供玉米芯片检测服务，助力国家玉米种业振兴。

产品优势及特点

1. 基因组覆盖度高

图1：50K位点在基因组上的分布

2. 覆盖国内外千份栽培种、地方种种质，遗传背景丰富，标记位点真实可靠。

数据集：诺禾积累的重测序数据

1）对来自国内外的1,210份种质数据进行了群体结构分析和主成分分析，最终这些种质被分为两个遗传组：一组由722个改良种质组成;二组由488份地方品种玉米、未驯化种质组成。

图2：1210份种质数据群体结构分析和主成分分析

2）50K目标位点包括1210份种质数据中的核心SNP标记位点， 覆盖了玉米基因组上22194个功能基因 ，其中包括已发表的 玉米功能基因位点标记（抗旱、抗倒伏）、部分稀有位点（玉米果糖含量位点）以及玉米固相芯片位点（约5％）。

图3：芯片覆盖的部分功能基因

3. 设计流程严谨，数据稳定可靠

诺禾致源基于自主研发的液相芯片探针设计技术，NGP 液相芯片基于热力学稳定性原理进行探针设计，综合考虑目标物种基因组复杂程度，目标位点位置，目标位点附近 GC 含量等因素，保证常规区域的100％捕获。针对高难度的复杂区域，NGP液相芯片通过调整探针位置，多层“叠瓦”型探针放置的方案，提高高难度区域的有效覆盖度，保证探针性能稳定，提高数据利用率，常规商业化芯片捕获效率可达70％。

高通量： 液相芯片采用液相杂交捕获技术，大大提高检测通量。

精准度： 突变一致率高达99％，确保检测结果的准确性和可重复性。

灵活性： 液相芯片位点可调节，根据检测需求进行自定义提取位点，满足个性化需求。