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两项新研究发现,五分之一貌似健康的人携带着会导致基因疾病风险增加的DNA突变。
很多医生希望通过简单的DNA筛查来诊断疾病,至少是能够预测疾病风险。但是另一些人则认为不值得为这种方法浪费金钱和情感代价,但是该方法或将很快成为预防医学的基础。现在,两项新研究又使这个问题成为了讨论焦点,其中一项研究是历史上首次对健康人全基因组测序进行评估的随机临床试验。这两项研究都认为,对健康成年人进行基因测序的结果表明,大约有五分之一的人携带患罕见疾病的风险标记,或者与癌症相关的基因突变。
这个研究结果对于那些考虑基因筛查人群和医疗系统意味着什么尚不明确,但是一些关注该研究的人还是对这个结果很感兴趣。
马里兰州国家人类基因组研究所的社会和行为研究人员Barbara Biesecker说:“我们正在研究这种新技术的实施,而不是因为没有证据而担忧,这太好了。”
第一项基因筛查研究有100名健康成年人参与,他们曾经向自己的初级护理医师报告过家族病史。之后随机分配一半的人进行额外的全基因组检查,每人花费大约5000美元,对在4600个基因中的500万个微小的DNA序列变化(单核苷酸变体)进行了检查,这远远超过了美国医学遗传学与基因组学会(ACMG)的推荐数量,ACMG只推荐对59种已知可能导致疾病的基因进行检查。
在这50名接受基因测试的受测者中,有11人携带至少一种会引起罕见疾病的DNA中发生变化,该研究结果发表在《内科医学年鉴》上。但是只有两人表现出明显的症状,其中一人对阳光极度敏感。他们的基因表明了一种名为“卟啉病”的皮肤疾病,也叫血紫质病。波士顿医疗保健系统的一名初级护理医师Jason Vassy说:“现在患者知道他们很容易被太阳灼伤或者引起皮疹,他们就应该避免阳光和服用特定的药物免受伤害。”
研究团队还发现,所有接受基因测序的受测者都携带至少一种导致疾病的隐性突变,如果只有一个突变基因则不会导致疾病,如果同时出现两个突变基因则会导致疾病。这个知识可以被用于进行生育决策,另一方可以接受基因测序确定是否有匹配的突变,家庭成员也应该进行基因配对确定是否是携带者。研究团队还对受测者们患8种多基因疾病的可能性进行了测试,这些疾病很少是由单一基因突变引起的。他们对多种基因的集体效应进行了测试(对于II型糖尿病测试70个基因,对于冠心病测试60个基因),以预测受测者的患病风险。
对于只报告了家庭病史的受测者,只有16%的人咨询了遗传咨询师或者接受了后来的实验室测试。而在全基因测序组中,这个数字是34%。
一些研究人员担忧,这种全基因组筛查会大大增加医疗花费,并引起过度的心理伤害。除了测序花费之外(由研究项目负担),接受基因筛查的受测者们在接下来的6个月中平均花费了额外的350美元医疗保健费用。但是,无论是测序组还是对照组在研究之后的6个月后都没有表现出焦虑或者抑郁方面的变化。
Vassy强调说,该研究规模很小,还需要后续研究,但是该研究还是令格伊辛格卫生系统的基因学家Christa Martin印象深刻。Martin负责ACMG的基因测序推荐。她说:“我觉得研究人员们低估了自己了成果。参加研究的很多患者都做了健康行为的改变,所以说,他们以一种非常积极的方式利用这些信息。”
医学教授Barbara Koenig说:“该研究设计得非常好,执行得也非常好。”但是她仍然质疑这样一种观点,即很多医生、伦理学家和患者们所认为的,信息越多越有益。她说:“对于我们不完善的医疗系统来说,很难知道如何将这些信息放在一起。”
于上周发表在bioRxiv上的另一篇论文也得到类似的结果。通过全外显子组测序(只关注基因中蛋白质编码区域),斯坦福大学基因组学和个性化医学中心负责人Michael Snyder发现,有17%(70人中的12人)的健康成年人有至少一种会导致遗传疾病风险增加的DNA突变,而这些遗传疾病是有治疗和预防措施的。
这些研究都表明,只关注ACMG推荐的59种基因显然是不够的。Snyder认为,全基因组测序应该“自动地”被加入到初级医疗中。虽然这可能令人非常担忧,但是这些信息对于医生来会非常有用。然而Vassy认为,还没有足够证据来确保保险公司会支付健康人的全基因组测序费用。
Koenig说:“人们总是喜欢速战速决,而且现在基因已成为一个重要的文化符号,所以我们可能过高估计了它的作用。但是距离这些技术应用于临床仍然还有很长的时间。”
原文检索:
1、The Impact of Whole-Genome Sequencing on the Primary Care and Outcomes of Healthy Adult Patients: A Pilot Randomized Trial
DOI:10.7326 / m17 - 0188
2、High Frequency Actionable Pathogenic Exome Mutations in an Average-Risk Cohort
DOI:10.1101/151225
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