专栏名称: 智药邦
人工智能在药物研发领域的进展、探索与实践。
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诺奖级成果实操培训班!《AlphaFold3:从原理到安装和使用》即将上线!

智药邦  · 公众号  ·  · 2024-12-27 16:00

正文

2024年5月,DeepMind隆重推出新型蛋白质结构预测模型AlphaFold3 (AF3)。作为一个革命性的模型,AF3能够以前所未有的精度预测所有生命分子的结构和相互作用。半年后,DeepMind宣布AF3开源。

与AlphaFold系列模型最初聚焦于蛋白质结构预测不同,AF3如今已将应用范畴拓展至蛋白质与其他类型生物分子的协同建模。这一转变标志着生物学研究从单一蛋白质研究迈向复杂分子环境建模的新阶段,预示着生物学领域的又一场革命。

为此,智药邦将于2025年1月18日举办《AlphaFold3蛋白质结构预测:从原理到安装和使用》线上专题培训班,系统讲解和演示AF3的基本原理和安装使用方法,推广前沿技术,助力生命科学基础研究和药物发现。

欢迎参加AlphaFold3实战培训, 在研究生涯中领先一步


01

培训班信息

培训班名称

《AlphaFold3蛋白质结构预测:从原理到安装和使用》线上专题培训班

组织单位

智药邦

授课时间和内容

2025年1月18日

09:30-11:30 蛋白质结构预测原理

13:30-15:30 AlphaFold3安装和使用

15:30-16:00 在线答疑

授课形式

本培训班为线上直播。感兴趣的学员可以登录网站购买,按时观看和学习

访问途径

PC端访问: 搜索智药邦学院网站 www.edu.phaimus.com

移动端访问1: 微信关注"智药邦"公众号,点击底部菜单栏"学院"登陆网站界面

移动端访问2: 扫码直接进入培训班界面

扫描二维码加入培训班



02

授课导师简介

主讲导师现为985高校副研究员,主要研究方向为生物大分子的模拟,在蛋白质结构预测方面有丰富的实操经验。目前已发表论文60余篇,主持和参与多项国家级和省部级科研项目。



03

授课内容大纲

1 蛋白质序列和结构

1.1 蛋白质序列

1.2 蛋白质三维结构

1.3 结构的实验测定方法

1.4 蛋白质序列和结构数据库

2 传统蛋白质结构预测方法

2.1 蛋白质结构预测的意义和挑战

2.2 对预测结构进行评估的指标

2.3 4种传统结构预测方法

2.4 CASP比赛

3 基于深度学习的蛋白质结构预测方法

3.1 深度学习简介

3.2 AlphaFold1和trRosetta

3.3 AlphaFold2和RoseTTAFold

3.4 对AlphaFold2模型的拓展

3.5 AlphaFold3和RosettaFold-AllAtom

3.6 结构预测在研究中的应用案例

4 AlphaFold3安装和使用

4.1 系统要求和环境配置

4.2 Linux常用命令

4.3 Docker和非Docker安装

4.4 AlphaFold3预测输入文件格式

4.5 预测任务提交和输出结果分析

5 答疑



04

培训班亮点

系统学习蛋白质结构预测原理和主流技术方法

2024年诺贝尔化学奖被授予了蛋白质结构预测和计算蛋白质设计,是对AI在生命科学和基础研究领域价值的重要认可。

培训班将系统梳理蛋白质结构研究的背景知识,着重解读蛋白质结构预测的研究策略、关键挑战和主流技术方法,以及AF带来的实质性突破。

充分了解AF系列模型的技术背景和进化脉络

DeepMind在2018年的CASP13中推出了AF。与AF相比,AF2并非简单的升级,而是整体的重新构思和设计。此后推出的AF3又针对AF2存在的问题进行了大幅度改进。

培训班将为学员详细解读AlphaFold系列模型各自的整体架构、技术模块、评估指标和应用范围,剖析技术进化脉络。

详细学习AF的使用全流程操作,无需耗时费力的自学

对于需要实际使用AF3的科研人员来说,首先需要了解AF3的部署条件和流程,而在这一步骤经常遇到各种问题。

在直播中,授课导师将逐步详细演示AF3安装的系统要求、环境配置、安装步骤和注意事项,有助于学员在短时间内快速掌握全流程操作,无需耗时费力的自学。

从此掌握AF3的操作方法,将AI加入个人技能库!在研究生涯中领先一步!

生命科学的AI时代已无可回避。在可预见的将来,更多性能更好的AI工具将被迅速推广到生命科学和基础研究的方方面面。
无论是课题研究,还是科研项目申请,亦或是个人研究生涯规划,尽早将AI纳入技能库都是不错的选择。
欢迎来到AF3蛋白质结构预测世界!



05

适用人群

生命科学相关专业人员

高校和科研院所,生物信息学、计算生物学、结构生物学、合成生物学、分子生物学,蛋白质工程等专业

生物医药相关专业人员

高校和科研院所,药物设计学、CADD / AIDD、药物化学,抗体工程,制药工程等专业

生物医药公司研究人员

制药公司、生物技术公司、CRO,小分子 / 蛋白质 / 抗体药物研发人员、生物信息学、结构生物学、CADD / AIDD研究人员等



06

报名及咨询

培训班价格

500元/位

注:

2025年1月3日18点之前







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