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孟德尔随机化,真有你的!一张图拿下13分顶刊,大连医科大学双疾病MR给你一点小小的震撼!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-09-23 19:00

正文


哈喽,热爱生信的朋友们~馆长又来了,最近大家有没有坚持打卡学习呀?

孟德尔随机化(MR)是当下极为热门的技术,在多个方面都深受审稿人的青睐!知道MR好发文章,没想到这么好发,今天这篇可是让我大开眼界了! 仅仅凭借一张图拿下13分顶刊!

这是大连医科大学今年8月发表在Alzheimers Dement上的文章,作者对来自IEU Open GWAS和FinnGen等公共数据库的相关GWAS数据进行分析 来探究 阿尔茨海默症(AD)与非霍奇金淋巴瘤(NHL)风险之间的因果关系 。令馆长惊讶的是,作者仅仅 1张森林图 便清晰地阐明了二者之间的关系,并得出AD显著降低NHL风险的结论。废话不多说,接下来看看这篇文章怎么做到用一张图搞定13分文章的吧~

1. 孟德尔 随机化分析 :本研究 首次 采用MR探索AD与淋巴瘤之间的因果关系, 减少了传统观察性研究所可能受到的混杂因素的影响。

2. 多个队列研究 :该研究利用 三个不 同的 队列 来研究AD对NHL的影响,且结果均一致表明AD是一种保护因素,这为阐明AD与NHL之间的关系提供了更有力的证据

P s :双疾病孟德尔随机化,原来上分如此简单! 小伙伴们不要犹豫了~思路匮乏或者技术上难以复现的小伙伴们可以来找馆长呀, 方案设计和生信分析有我无忧!

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l 题目:阿尔茨海默病及其家族史降低非霍奇金淋巴瘤风险的孟德尔随机研究

l 期刊: Alzheimers Dement

l 影响因子:IF=13

l 发表日期:2024年8月27日

以往关于AD与淋巴瘤关系的研究较少且结果存在冲突,多采用队列研究。本研究采用MR方法,旨在更准确地探究AD与淋巴瘤的因果关系,这对阐明两者关联及病理生理通路具有重要意义,有助于为AD和NHL的防治开发新的优化方案。

研究 首先 从IEU Open GWAS和FinnGen等数据库获取相关GWAS数据,组建AD、家族史、NHL和HL的多个队列。运用MR - Egger、加权中位数、逆方差加权等五种方法进行分析,并以IVW方法为主要参考,最后对结果进行异质性、多效性和敏感性分析。

1、 AD与NHL的关系

通过对三个AD队列的分析,运用五种方法(MR - Egger、加权中位数、逆方差加权(IVW)、简单模式和加权模式),发现 AD显著降低NHL发病风险 ,IVW方法显示各队列结果具有显著性,其他四种方法也有一定显著性。此外,相关分析表明结论稳健可靠,AD对NHL有保护作用。

2、AD家族史与NHL的关系

研究表明AD家族史能显著降低NHL发病风险,IVW方法下ORIVW为0.777,PIVW为0.004。对 父母AD病史等的分析发现与NHL风险降低有关 ,但不同方法中关联程度 有别 ,如 父亲 AD病 IVW方法中ORIVW = 0.762(PIVW = 0.008), 母亲 为ORIVW = 0.785(PIVW = 0.006) 图1

1 森林图的MR分析结果采用五种方法







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