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不愧是高分SCI收割机!仅4张图拿下一区12分+!孟德尔随机化结合数据库分析思路拆解,看完整个人都要爆了!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2024-09-10 19:00

正文

孟德尔随机化的高分研究越来越多了,怎么才能持续创新,做出特色?是一个重要问题。馆长看到这篇文章后恍然大悟,这不就是我们想要的思路嘛,这就赶快分享给大家了,简单易复现,思路还创新~~希望能为你的第一篇SCI锦上添花!这篇文章研究他汀类药物与乳腺癌关系,使用MR及大数据关联分析,结果表明他汀使用降低乳腺癌风险,且洛伐他汀与紫杉醇联用增强CD8+T细胞活性,揭示他汀在乳腺癌治疗中的潜在作用,快跟馆长一起来看吧~

1.大量公开数据库支持: 研究数据来自UK Biobank、FinnGen数据库及乳腺癌协会联盟(BCAC)等,大样本量数据增大了研究结果的可靠性和普适性。

2.孟德尔随机化结合数据分析: 采用大数据的孟德尔随机化方法,利用遗传变异作为工具变量来评估 他汀类药物使用与如乳腺癌风险之间的因果关系 ,减少了混杂因素和反向因果关系的干扰,提高了因果推断的准确性。

3.实际实验验证: 在进行孟德尔随机化及数据关联分析后,结合体内外实验模型研究了他汀类药物(特别是洛伐他汀)在 乳腺癌治疗中的作用机制 ,包括免疫检查点蛋白PD-L1的表达调控及与化疗药物的协同作用。 (PS:孟德尔随机化现在已经卷出多种方法整合了!想利用生信方法发表高分文章的小伙伴们,但苦于缺乏新的方法思路?方案设计困难?快来扫码联系馆长吧!馆长这里还有生信学习交流群,想入的扫我吧~)

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题目: 他汀类药物抑制紫杉醇诱导的PD-L1表达,增加CD8+T细胞毒性,改善乳腺癌预后

杂志: International Journal of Surgery

影响因子:IF=12.5

发表时间:2024年8月

Ps:馆长已经把原文信息放在末尾啦~~~小伙伴们自己去拿哦

研究背景

近年来,降脂药物尤其是他汀类药物的广泛使用引起了人们的关注,而他汀类药物的使用可能与降低乳腺癌风险有关,探讨他汀类药物使用与癌症风险的关系对他汀类药物在乳腺癌辅助治疗中的作用有重要意义。

数据来源

乳腺癌风险的遗传关联数据来自 乳腺癌协会联盟(BCAC) ,涉及 122,977例和105,974例对照 。对于脑胶质母细胞瘤(91例,218701例对照)和肾恶性肿瘤 (971例,217821例对照) ,FinnGen研究获得了遗传关联。癌症的其他数据来自UK Biobank,包括2006年至2010年在英国 22个评估中心招募的502,507名参与者。

研究思路

本研究的孟德尔随机化部分数据来自 英国生物银行和FinnGen 研究中常见癌症的全基因组关联研究以及全球脂质遗传学联盟的低密度脂蛋白(LDL)。通过体外和体内模型研究了他汀类药物和化疗药物对乳腺癌的影响,特别关注免疫检查点 蛋白PD-L1 的表达水平及其抑制肿瘤生长的潜力

研究结果

1.降脂药物与13种癌症风险的磁共振分析

首先使用孟德尔随机化(MR)研究 降脂药物 在癌症下的潜在治疗意义(图1A),结果发现基因替代的 HMGCR抑制与乳腺癌风险降低相关 ,并且HMGCR与前列腺癌、NPC1L1与乳腺癌、肾恶性肿瘤、PCSK9与乳腺癌存在弱相关性(图1B)。为确保MR分析的可靠性,进行了补充阳性对照分析。利用冠状动脉相关疾病作为阳性对照基准,研究证明 三种与降脂药物相关的遗传因子确实与冠状动脉相关疾病的风险降低有关 (图1C),结果验证了MR分析的准确性。

图1 降脂药物与13种癌症风险的磁共振分析

2.洛伐他汀显著抑制紫杉醇诱导的PD-L1表达,并协助其抑制肿瘤细胞生长

首先通过MR分析研究他汀类药物或影响乳腺癌预后,结果显示经过紫杉醇处理后, 乳腺癌细胞PD-L1 mRNA表达显著上升 (图2A、B),洛伐他汀可显著抑制乳腺癌细胞中PD-L1的表达(图2C、D)。PCR显示洛伐他汀对紫杉醇诱导的PD-L1 mRNA表达呈剂量依赖性抑制(图2E),洛伐他汀也显著抑制PD-L1蛋白水平(图2F)。 洛伐他汀与紫杉醇联合用药可显著抑制紫杉醇诱导的PD-L1表达 (图2G),紫杉醇和洛伐他汀对乳腺癌细胞活力的抑制作用表现出一种叠加性同时使用可获得更明显的影响(图2H)。

图2 洛伐他汀显著抑制紫杉醇诱导的PD-L1表达,并协助其抑制肿瘤细胞生长

3.洛伐他汀与紫杉醇联合治疗可增强CD8+T细胞的杀伤能力

通过分析洛伐他汀治疗对免疫细胞浸润的影响,结果显示 洛伐他汀显著增强了免疫细胞在肿瘤细胞中的浸润 ,尤其T细胞(图3A)。MDA-MB-231-和EMT6-荧光素酶细胞分别与从人PBMC和小鼠脾脏分离的CD8+T细胞共培养(图3B),用抗CD3和抗CD28激活T细胞后,接着用洛伐他汀和紫杉醇处理,结果表明与单独使用紫杉醇相比, 洛伐他汀和紫杉醇的组合增强了CD8+T细胞的细胞毒性作用 (图3C)。

图3 洛伐他汀与紫杉醇联合治疗可增强CD8+T细胞的杀伤能力

4.洛伐他汀与紫杉醇联合治疗可增强CD8+T细胞浸润,提高体内治疗效果

采用流式细胞术对携带EMT6小鼠的引流淋巴结(DLN)中的T淋巴细胞进行了分析,发现在洛伐他汀和紫杉醇联合治疗的小鼠中,CD8+T细胞群的比例显著增加(图4A)。首先用紫杉醇(诱导PD-L1)治疗小鼠,然后用洛伐他汀治疗小鼠(图4B),当乳腺肿瘤达到可触及和可测量的体积时,给予两种化合物。与对照组小鼠相比, 洛伐他汀联合紫杉醇治疗小鼠显著减少肿瘤体积和重量 (图4、D),比单独使用紫杉醇或洛伐他汀更有效。此外与洛伐他汀或紫杉醇单独治疗相比, 联合治疗的生存率更高 (图4E)。

图4 洛伐他汀与紫杉醇联合治疗可增强CD8+T细胞浸润,提高体内治疗效果

文章小结

本文通过MR及数据关联分析对他汀类药物与乳腺癌关系进行研究,发现他汀类药物的使用与乳腺癌患者预后的改善有关,并可能在促进从冷肿瘤到热肿瘤的转变中发挥作用,洛伐他汀和紫杉醇联合治疗可增强CD8+T细胞活性改善预后。利用公开数据库结合孟德尔随机化分析以及实验模型,清晰有条理,还不快学起来! PS:如果你也想让文章做的跟这篇一样逻辑清晰内容丰富拿下高分,那就快来找馆长吧~馆长既能为你定制实验方案,还能提供各种思路,为您答疑解惑哦~)

本文信息:

Statins inhibit paclitaxel-induced PD-L1 expression and increase CD8+ T cytotoxicity for better prognosis in breast cancer

http://dx.doi.org/10.1097/JS9.0000000000001582

后台回复“ 666 ”获取原文献,编号240910

馆长有话说







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