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数据分析|单基因meta分析服务

Freescience联盟  · 公众号  ·  · 2022-01-20 22:07

正文


还在为毕业和晋升发愁吗,如果我们帮你做好图表,一切就变得简单了!

如果您有数据,交给我们,我们提供以下分析服务(图表全部发表级)。

如果您只有基因,没有数据,需要我们帮忙提取数据,提取数据费用另算。



这项分析服务的模板文章为猴哥2019年发表的文章“Survival and Clinicopathological Significance of SIRT1 Expression inCancers: A Meta-Analysis.” 影响因子:3.636


您只需提取数据。

后续的数据分析+图表制作都由我们来。心动不心动!那我们先来一起解读一下文章吧!


Step1. 确定题目、定制研究计划


目标分子:SIRT1

SIRT1是一种进化上具有保守性的NAD+依赖的脱乙酰化酶,参与多种细胞过程。长期以来的研究认为SIRT1同时具有促进和抑制肿瘤的作用。它在癌症中的预后作用仍然存在争议。

Step2. 数据收集


通过检索PubMed,EMBASE和Cochrane Library数据库,确定对63个研究中的13138名受试者进行后续的Meta分析。


流程图:


Step3. 资料分析,结果可视化(分析服务将提供以下图表)


评估SIRT1在各种癌症中表达的与肿瘤生存率和临床病理特征的关系。


SIRT1表达与预后



SIRT1的表达升高意味着更差的总体生存期(OS)(HR = 1.566,95%CI:1.293-1.895,P<0.0001),无病生存期(DFS)(HR = 1.631,95%CI:1.250-2.130,P = 0.0003),无事件生存期(EFS)(HR = 2.534,95%CI:1.602-4.009,P = 0.0001)和无进展生存期(PFS)(HR = 3.325 95%CI:2.762-4.003,P <0.0001)。

SIRT1表达与与病理学特征

SIRT1水平升高与肿瘤分期 (RR=1.299,95%CI:1.114-1.514,P = 0.0008),淋巴结转移(RR = 1.172,95%CI:1.010-1.360,P = 0.0363) ,以及远处转移(RR = 1.562,95%CI:1.022-2.387,P = 0.0392)有关。


Meta回归和亚组分析

Meta回归和亚组分析显示 ,种族背景对SIRT1表达在预测癌症生存和临床病理特征中的作用具有影响。SIRT1的过表达预示着亚洲人群尤其是中国人群的OS恶化,TNM分期和淋巴转移更高。



(详见  DOI: 10.3389/fendo.2019.00121  )


通过Egger’s检验分析,发现OS,RFS和TNM分期存在"发表偏倚"。


Step4.结果解读


SIRT1的表达升高预示着更差的OS,DFS,EFS,PFS,但对RFS和CCS无影响。SIRT1过表达与更高的肿瘤分期,淋巴结转移和远处转移有关。SIRT1介导的分子事件和生物学过程可能是转移的潜在机制,而SIRT1是抑制转移的治疗靶点,因此预后良好。







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