细菌/病毒基因组马上上线！
福利公告
：
为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定
安排扩增子16S分析
、
宏基因组
、
转录组
的线上/
线下
同时开课。报名
参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课
。期待和大家的线上线下会晤。
目前可以通报的信息：
-
转录组线上/线下开课时间：
2024/09/20-2024/09/22
-
临床基因组学线上/线下开课时间：
2023/11/17-2023/11/19
-
宏基因组线上/线下开课时间
：
2024/5/17
-2024/5/19；2024年11月15-17
-
扩增子线上/线下开课时间：
2024/10/18-2024/10/20
-
报名链接：
http://www.ehbio.com/Training/
-
在广大粉丝的期待下，《生信宝典》联合《宏基因组》在
北京于
2024-10-18到 2024-10-20
推出《
扩增子
16S
分析
》专题培训第23期（
线上课和线下课程同步开通
）
，为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子分析实战学习和交流的机会、助力学员真正理解分析原理和完成实战分析，独创五段式教学(3天集中授课+自行练习2周+微信群问题答疑+上课视频回看反复练习+后续线上课免费参加)，
“教—练—答—用”四个环节统一协调，真正实现独立分析大数据
。
关于学习生物信息学分析的重要性，请阅读
《生物信息9天速成班—成为团队中不可或缺的人》
。
课程简介
宏基因组/微生物组是当今世界科研最热门的研究领域之一，为加强本领域的技术交流与传播，推动中国微生物组计划发展，中科院青年科研人员创立“宏基因组”公众号，目标为打造本领域纯干货技术及思想交流平台。成立两年，分享专业技术原创文章30
00+篇，关注人数
13万+
，累计阅读量31,000,000+。
请详细阅读课程简介，如果以下内容您全精通，不必参加此培训。
本课程一共3天，每天6节课，共18节课，全部课程均理论与实战结合(只要课上讲的内容，都是要带你亲自实现的分析)。从分析平台搭建、Linux和R基础、图表解读和绘图实战、扩增子分析标准流程、功能预测、差异统计分析以及各类高级分析(进化树、网络、环境因子、随机森林、Adaboost和来源追溯等)，和CNS级图片编辑和排版。3天时间，老司机带您完成自学需要3个月甚至是3年的崎岖之路，助力您真正玩转扩增子分析。
课程大纲
每节课1小时一个主题，理论结合实战，学懂原理，实战操作，全是老司机多年经验和代码的无私分享。下面是课程安排，如11代表第一天第一节课，26代表第二天第六节课，41为两周后的线上集中视频答疑。
教程内容简介如下：
一、生信基础知识和技巧
还在为没有Linux服务器而无法分析扩增子数据而苦恼吗？其实你的个人电脑就是扩增子分析的利器。易生信团队独创实现了跨平台的分析流程，在大家的Windows笔记本上可以轻松实现扩增子领域的绝大多数分析，第一节课带你轻松在自己的本本上搭建数据分析平台。
图1. 易生信首创基于Win10优化的扩增子分析流程，笔记本秒变大数据分析平台
推荐使用Windows10系统，8G及以上内存分析更流畅。
我们也会分享给大家在Linux上配置整个分析流程的代码 (Mac跟Linux类似，无须区别对待，但部分软件可能安装方式不同，未做深入测试，不建议参加培训时使用）。
同时讲解生物学家必要掌握的
Shell
和
R语言
基础知识，保证你高效、稳定的使用扩增子分析平台。
图2. Shell和R学习大纲，首创Rstuio中鼠标点击可完成Shell脚本和R语言分析，既打开生信的大门，又不会增加生物学家时间成本
二、图表解读和绘制
针对很多老师缺少系统的生信背景，看不懂分析文章图表，更对绘制各式图表手足无措。
我们推出过如下两个系列，共16篇原创文章，对8种图形进行讲解和R语言绘图。
但这些只是入门，在培训上，我们将结合发表高水平文章，进一步讲解16种常用分析图型结果的原理和使用范围，让您不仅读懂图，更知道如何应用于自己的研究，并亲自轻松完成绘图。
针对大家使用R语言绘图学习时间成本较高的问题，易生团队针对常用16种图开发了
免费绘图网站
，一键出图，更可鼠标点选参数修改图形的个性样式。
图3. 16种常用图形的绘制。可使用我们的在线绘图工具
实现。
为了让各种统计图片实现出版级的组图，特开设了一节
Adobe Illustrator修图排版
课，讲述基本使用技巧，轻松掌握精髓，让你文章图版档次向CNS看齐，轻松成为实验室的修图和拼图达人。
图4. AI排版本子图为CNS出版级组图示例
(Science, 2016封面文章)
三、扩增子基础和分析流程
图5. 典型的扩增子结构模型图
-
背景：国际微生物组(人类HMP、环境EMP)计划、中国微生物组计划
-
研究对象：人、动物、植物、环境
-
研究方法：培养组学、扩增子测序 (最常用)、宏基因组、宏转录组、宏蛋白组、宏代谢组、宏表观组等
-
宏基因组学的研究热点：微生物多样性、宏基因组、培养组、肠菌与疾病、MWAS
-
扩增子基本原理：细菌/古菌 16S、真菌18S/ITS结构、引物选择等
-
实验设计：样品制备和建库中的误区
-
文章套路：扩增子分析SCI文章的物种组成、功能预测常用套路
-
主流方法优缺点比较：QIIME、QIIME2、mothur、Usearch-unois3、dada2等方法
之前我们发布了基于QIIME(引用24000+)+USEARCH(引用14000+)组合的史上最详细中文扩增子分析流程，累计阅读10000+。
同时在2017年推出了2018年正式接档QIIME的最新流程QIIME2的官方中文帮助文档，累计阅读10万+。
想使用QIIME和QIIME2的小伙伴可直接点击上方链接学习。课上也会带大家用服务器操作，分享最新私人定制流程。
但上面两种分析流程仍有很多缺点，如需要Linux服务器，安装和操作复杂，学习时间成本过高等不足。
易生信团队组织宏基因组、生信宝典的一线生信专家，为广大生物学家，定制了一套安装部署简单、鼠标点击编程、支持主流操作系统、学习成本低、又灵活的扩增子分析流程，助力生物学家轻松分析数据，更专注生物学现象的挖掘。
