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表观遗传学方向看过来~

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2020-11-16 22:50

正文

本次发布招聘信息的是位于美国休斯顿的贝勒医学院Waterland实验室,他们长期从事营养不良在表观遗传学层面上对孕妇、婴儿和儿童的影响,招聘职位是表观遗传学数据科学方向的博士后~

说到BCM,不得不说起它所在的城市休斯顿,课题组在招聘启事中特地强调了他的包容性和低生活成本(才不是为了凑字数)

休斯顿是美国第四大城市,人口结构年轻,是美国最多样化的大都市区。休斯顿人中有近四分之一是外国出生的。根据2018年的人口普查,休斯敦人中亚裔占7.6%

在生命科学研究方面,休斯敦有190多家生命科学和生物技术公司及学术合作机构;超过100家先进的医院和保健诊所以及多家全国一流的研究机构。

休斯敦的德州医学中心是美国和世界上最大的医学中心之一。该中心占地2.84㎞²,由54个医疗机构组成,在癌症和心脏研究方面最为著名。

贝勒斯医学院就是德州医学中心的成员之一

图源百度

贝勒医学院(BCM)的Waterland实验室致力于在分子水平上记录发育过程中营养不良的长期不良后果。目前有多个NIH资助的职位,招聘对基因组和表观基因组数据科学感兴趣的研究者。

图源:课题组主页

“我们的总体假设是,过去几十年来不断变化的环境(在营养,孕产妇肥胖等方面)可能影响下丘脑发育,导致能量感应机制发生永久性改变,有利于实现积极的能量平衡。我们正在探索表观遗传机制,特别是DNA甲基化在这一过程中的作用。”

研究员将领导数据分析项目的设计和实施,旨在了解表观遗传的发展对疾病的风险的影响。具体而言,项目的重点是表观遗传失调在人类癌症和肥胖中的作用,以及与能量平衡和肥胖有关的大脑发育表观遗传学的小鼠模型。

在DNA序列如何编码随机表观遗传变异(易位表位等位基因)方向的研究世界领先。有关示例请参阅他们最近在Genome Biology和Nature Communications中发表的论文:

图源:Genome Biology

该论文发表在 Genome Biology 上:“开发了一种计算算法来确定在所有三个谱系中DNA甲基化的个体差异均一致的基因组区域。该方法可识别系统性个体差异(correlated regions of systemic interindividual variation ,CoRSIV)的9926个相关区域。这些区域仅占人类基因组的0.1%,在较长的基因组距离内相互关联,与转座子和亚端粒区域相关,在不同的人类种族中均保守,对围生环境敏感,并且与涉及广泛范围的基因相关 人类疾病和表型。一种组织中的CoRSIV甲基化可以预测其他组织中相关基因的表达。”

更多论文请看:

https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-019-1708-1 https://www.nature.com/articles/s41467-019-13339-3


这份工作做什么


所有项目都涉及针对大量基因组、表观遗传学和基因表达谱数据的创新分析方法(二代测序、RNAseq等)。成功的候选人将独立工作,并在数据分析,解释和可视化以及稿件起草工作中发挥领导作用。


需要什么样的人

  • 在计算机科学,生物信息学,计算生物学以及相关领域发表大量著作的新毕业博士

  • 有使用Python,R和/或Perl等语言进行编程的经验。

  • 有二代测序数据的高通量分析方面的经验,

  • 必须具有出色的英语口语和书面交流能力,并且能够在生物学家和程序员团队中工作。







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