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有了这个数据库,妈妈再也不用担心我的毕业!

小张聊科研  · 公众号  · 科研  · 2018-02-03 17:31

正文

科研难做在于没有Idea,关于找Idea我们已经介绍过“顺手和反手”系列的两个数据库: 有了这个数据库,我反手就是一批课题! 有了这个数据库,我顺手又是一批课题! ,今天我们开始介绍“不用担心毕业”系列,今天是妈妈篇,如果以后还有别的,我们还会出爸爸篇、爷爷篇、奶奶篇、姥爷篇、姥姥篇……等等,如果数据库够多的话,七大姑八大姨可能都会有,大家不要急,慢慢来。


下面我们要说的数据库是m6AVar:http://m6avar.renlab.org/

这个数据库师兄在 RNA甲基化研究常用的数据库,我收藏了,你呢? 一文中提到过,大家知道RNA甲基化很火( 一个月发了十几篇10分以上的文章,这个方向的前景不可估量! ),所以今天就来带大家设计一些RNA m6A甲基化修饰有关的课题。


我们先看看可以设计什么样的课题:

一共有6点,包括了 SNP、剪切位点、RNA结合蛋白和miRNA ,所有内容还是比较宽的,涉及到的RNA类型也很多:

不仅有编码基因,还有lincRNA、miRNA、piRNA等等,其中疾病的类型不限于肿瘤,虽然我们下面用肿瘤来举例子。


首先,我们直接下载数据,有两个选择dbSNP和TCGA:

以TCGA为例,我们可以下载LUAD(肺腺癌)的数据:







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