在女性健康领域,子宫内膜癌的发病率和死亡率呈上升趋势,严重威胁着广大女性的生命安全。寻找有效的治疗靶点和预后标志物一直是科研人员努力的方向。今天,给大家介绍一项关于子宫内膜癌的重要研究,该研究聚焦于
KIF11
基因,为子宫内膜癌的诊疗带来了新的曙光。该研究成果《
Identification and validation of the
important role of KIF11 in the development
and progression of endometrial cancer
》已发表于《
Journal of Translational Medicine
》。
下面跟小编一起来看看这篇文章的
主要内容和
思路吧:
一、
研究背景介绍
子宫内膜癌在全球女性癌症中占据着不容忽视的地位,近年来其发病率呈持续上升态势,已然成为女性健康的重大威胁。传统研究虽已揭示肥胖、生殖因素及遗传因素等与该疾病存在关联,但在分子层面的发病机制仍如一团迷雾,亟待进一步的探索与明晰。随着基因测序技术的飞速发展以及生物信息学的蓬勃兴起,为深入探究子宫内膜癌的基因奥秘开启了一扇新的大门。
二、
研究方法与结果
研究团队通过生物信息学分析、机器学习算法和实验验证,系统地研究了
KIF11
在
EC
中的表达及其生物学功能。研究主要分为以下几个步骤:
1.
差异表达基因(
DEGs
)筛选:通过分析
GEO
数据库中的
GSE17025
数据集,筛选出
877
个与
EC
相关的差异表达基因。
2.
功能富集分析:对这些基因进行
GO
和
KEGG
富集分析,发现它们主要参与细胞分裂、微管结合和细胞周期等生物学过程。
3.
蛋白质相互作用网络(
PPI
)分析:通过
PPI
网络分析,筛选出
25
个核心基因,并进一步通过
LASSO
回归和随机森林算法确定了
KIF11
为关键基因。
4.
临床数据分析:利用
TCGA
数据库的临床数据,验证了
KIF11
在
EC
中的高表达,并发现其与肿瘤分级、分期和低生存率显著相关。
5.
实验验证:通过体外实验,证实了
KIF11
敲低能够抑制
EC
细胞的增殖、迁移和侵袭,并诱导细胞周期阻滞和凋亡。
三、
文章图
图
1
:
GSE17025
数据集中
EC
患者与正常对照的
DEGs
图
2
:
DEGs
的
GO
和
KEGG
通路富集分析。
图
3
:
DEGs
之间的蛋白质
-
蛋白质相互作用(
PPIs
)及关键基因筛选。
图
4
:
通过两种机器学习方法筛选关键基因。
图
5
:
KIF11
表达水平与
EC
患者临床特征的相关性。
图
6
:临床样本中
KIF11
表达的验证。
图
7
:
KIF11
敲低对
EC
细胞增殖的影响。
图
8
:
KIF11
敲低对
EC
细胞迁移和侵袭的影响。
图
9
:
KIF11
敲低对
EC
细胞周期和凋亡的影响。
四、
总结
本研究亮点显著。创新性地综合运用生物信息学与机器学习方法,精准筛选出关键基因
KIF11
,并全面验证其在
EC
中的重要作用,为
EC
研究提供全新视角。多组学数据与临床样本及细胞实验紧密结合,有力证实了
KIF11
作为生物标志物和治疗靶点的潜力,研究结果具有重要的临床转化价值。
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