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国自然马上提交了,你的实验设计严谨吗?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2025-03-10 08:00

正文

国自然很快就提交了。 在国自然项目中, 细胞实验 一般都是必选项,在功能和机制实验中通常都要涉及。但 越是“常规”实验,设计严谨就越难 ,下面就尽量详细说明要考虑的因素。

一、如何选择合适的细胞?

细胞的选择是设计要考虑的第一步,有了合适的细胞才能构建疾病模型,进而对我们关注的“基因”或者“药物”进行干预:比如对基因进行沉默、过表达操作,药物处理等等。但是, 没有说明为何选择某某细胞 ”是国自然项目中评审专家常常指出的设计漏洞

简单来说,根据细胞的获取方式一般我们分为这三类: A. 细胞系(或者永生化的细胞); B. 原代细胞;和 C. 分化诱导的细胞。

A. 细胞系(或者永生化的细胞)

—— 常用但不局限于肿瘤研究 国自然项目必备


细胞系(或永生化细胞)在肿瘤研究和非肿瘤研究中都常用,主要看细胞系的来源。肿瘤研究中不管是单独研究肿瘤细胞的增殖、转移、耐药等问题,还是与肿瘤微环境中的免疫细胞通讯等都是常用手段。需要注意的问题有几个:

A 1. 细胞系要与肿瘤分型对应

比如 肿瘤细胞系与病理分型要对应 ,肺腺癌 vs 肺鳞癌 vs 小细胞肺癌,所用细胞系不同( A549 H1299 等为肺腺癌细胞系, NCI-H520 为肺鳞癌细胞系,而 SHP-77 为小细胞肺癌细胞系); HepG2 细胞系为肝母细胞瘤细胞系,而研究原发性肝癌用 Huh7 Hep3B 以及 MHCC97H 等更为严谨。

再如 细胞系的遗传背景 也要考虑:同为肺腺癌细胞系, A549 H460 p53 野生型( WT ),而 H1299 p53 缺失、 H1975 HCC827 p53 R273H 突变( P53 的热点突变),如果恰巧研究选的是 H1975 HCC827 严格来说结论就只能限定在 p53 R273H 突变性肺腺癌,而非广义的肺腺癌 当然,要与临床问题对应需要有现成的细胞系可供选择, 如果实在没有就要考虑自建细胞系或者在已有细胞系上改造构建。

A 2. 细胞系要与临床问题对应

比如研究淋巴结转移、脑转移等问题时, 如果没有淋巴结转移、脑转移专门的细胞系,一般就会从现有细胞系 建立动 物模型从淋巴结组织、脑转移灶筛选构建 当然另外一个策略是从细胞系出发,关注转移灶大小和数量,但创新性略差;

再比如研究肿瘤耐药,虽然分为原发性和继发性耐药,大家关注更多的是继发性耐药, 因此一般从耐药细胞株的构建开始,虽然 筛选耐药细胞株比较耗时且长期培养会丢失耐药性

A 3. 细胞系与研究基因对应

先说一个常见的观点: 如果 A 基因在肿瘤高表达,在肿瘤细胞系就要做敲降 / 敲除;如果低表达,就要做过表达 这个观点是片面甚至是错误的,原因在于没有搞清楚两个问题:

Q1 A 基因高表达时 , 为什么要做 A 基因的沉默(







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