国自然很快就提交了。
在国自然项目中,
细胞实验
一般都是必选项,在功能和机制实验中通常都要涉及。但
越是“常规”实验,设计严谨就越难
,下面就尽量详细说明要考虑的因素。
一、如何选择合适的细胞?
细胞的选择是设计要考虑的第一步,有了合适的细胞才能构建疾病模型,进而对我们关注的“基因”或者“药物”进行干预:比如对基因进行沉默、过表达操作,药物处理等等。但是,
“
没有说明为何选择某某细胞
”是国自然项目中评审专家常常指出的设计漏洞
。
简单来说,根据细胞的获取方式一般我们分为这三类:
A.
细胞系(或者永生化的细胞);
B.
原代细胞;和
C.
分化诱导的细胞。
——
常用但不局限于肿瘤研究
(
国自然项目必备
)
细胞系(或永生化细胞)在肿瘤研究和非肿瘤研究中都常用,主要看细胞系的来源。肿瘤研究中不管是单独研究肿瘤细胞的增殖、转移、耐药等问题,还是与肿瘤微环境中的免疫细胞通讯等都是常用手段。需要注意的问题有几个:
比如
肿瘤细胞系与病理分型要对应
,肺腺癌
vs
肺鳞癌
vs
小细胞肺癌,所用细胞系不同(
A549
、
H1299
等为肺腺癌细胞系,
NCI-H520
为肺鳞癌细胞系,而
SHP-77
为小细胞肺癌细胞系);
HepG2
细胞系为肝母细胞瘤细胞系,而研究原发性肝癌用
Huh7
、
Hep3B
以及
MHCC97H
等更为严谨。
再如
细胞系的遗传背景
也要考虑:同为肺腺癌细胞系,
A549
和
H460
为
p53
野生型(
WT
),而
H1299
为
p53
缺失、
H1975
和
HCC827
为
p53 R273H
突变(
P53
的热点突变),如果恰巧研究选的是
H1975
和
HCC827
,
严格来说结论就只能限定在
p53 R273H
突变性肺腺癌,而非广义的肺腺癌
。
当然,要与临床问题对应需要有现成的细胞系可供选择,
如果实在没有就要考虑自建细胞系或者在已有细胞系上改造构建。
A
2.
细胞系要与临床问题对应
比如研究淋巴结转移、脑转移等问题时,
如果没有淋巴结转移、脑转移专门的细胞系,一般就会从现有细胞系
建立动
物模型从淋巴结组织、脑转移灶筛选构建
;
当然另外一个策略是从细胞系出发,关注转移灶大小和数量,但创新性略差;
再比如研究肿瘤耐药,虽然分为原发性和继发性耐药,大家关注更多的是继发性耐药,
因此一般从耐药细胞株的构建开始,虽然
筛选耐药细胞株比较耗时且长期培养会丢失耐药性
。
A
3.
细胞系与研究基因对应
先说一个常见的观点:
如果
A
基因在肿瘤高表达,在肿瘤细胞系就要做敲降
/
敲除;如果低表达,就要做过表达
。
这个观点是片面甚至是错误的,原因在于没有搞清楚两个问题:
Q1
当
A
基因高表达时
,
为什么要做
A
基因的沉默(