单细胞测序在植物研究中的应用

基迪奥生物 · 公众号 · · 2024-08-29 18:01

正文

单细胞测序是近年来组学研究的热门领域。与动物单细胞测序相比，植物单细胞测序无论是在样本前处理（悬液制备）还是在生物信息分析方面都存在诸多难点。

在与客户的深度合作过程中，基迪奥生物逐步克服了这些难点，基迪奥植物单细胞项目文章产出居国内首位，涉及多种禾本科模式作物、蔬菜、药用植物、果树、孢子植物等，基迪奥合作发表共 22篇，平均影响因子 9.7 。国内外收录的已发表植物单细胞转录组文章共 156篇，每7篇植物单细胞转录组中就有1篇是基迪奥合作发表。

本次基迪奥特别举办的植物单细胞线上沙龙，邀请了 3位合作客户，分享植物单细胞测序在各自课题研究中的应用经验，并分享发表学术论文的心得。主要议题包括：

（1）植物单细胞研究中遇到的难点以及解决方案；

（2）利用植物单细胞测序取得的传统组学无法获得的科学发现；

（3）单细胞测序对植物学研究领域的影响与未来发展趋势的展望。

本次研讨会将在基迪奥生物视频号直播，欢迎大家预约参与：

时间

2024年9月12日下午 14： 30-17： 00

嘉宾介绍

嘉宾一

案例文章：

中文题目：

单细胞转录组揭示光暗环境下花生幼苗叶片的差异表达基因图谱

发表期刊 ： Plant Biotechnology Journal （ IF: 13.8）

发表时间： 202402

该项目对光暗环境下花生幼苗叶片进行单细胞转录组测序。结合转录因子分析、细胞周期分析、拟时分析，发现了多种黑暗环境下抑制细胞分裂和扰乱细胞周期的关键转录因子。本研究提供了光暗环境下黄化花生幼苗和绿化花生幼苗的单细胞图谱，为在单细胞水平上阐明光诱导的叶片细胞发育提供坚实基础。

嘉宾二

案例文章：

中文题目：

10X转录组揭示转录因子PagMYB31正向调控杨树形成层活性负向调控杨树木质部发育

发表期刊： Plant Cell （ IF: 12）

发表时间： 202402

该研究利用单细胞转录组技术对杨树茎组织进行测序分析，并在白杨中发现了PagMYB31，一个在木材形成中起到关键作用的转录因子。研究显示，PagMYB31在木材形成的不同阶段具有相反的作用，既能促进木质部细胞的分裂，又能抑制木质部细胞的扩张和次生细胞壁的生物合成。此外，PagMYB31在维持木质部细胞的稳态方面也发挥着重要作用。综上所述，PagMYB31对于协调木材形成的不同发育阶段具有重要意义，并可能成为操纵木材形成不同发育阶段的潜在靶点。

嘉宾三

案例文章：

中文题 目：

单细胞转录组揭示豌豆茎发育和细胞类型特异性对缺硼反应

单细胞测序在植物研究中的应用

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