专栏名称: 弗雷赛斯
Freescience由浙江大学医学院几个硕博士发起创建,旨在最广泛分享有价值的科研技能和知识;FreeScience的宗旨:“科学自由分享、人人平等,共求真理”。
目录
相关文章推荐
世界音乐  ·  “巴黎天空下,一匹成吉思汗的骏马” ·  3 天前  
北京大学百周年纪念讲堂  ·  本周日,在弦乐四重奏中感受“完全贝多芬” ·  6 天前  
民谣在路上  ·  11月民谣专场演出预告 | 冬天就应该听民谣! ·  6 天前  
51好读  ›  专栏  ›  弗雷赛斯

课题思路神器:扔一个“关键词”,出来一个课题!

弗雷赛斯  · 公众号  ·  · 2024-06-19 21:02

正文


查文献始终是科研人员头痛的一件事儿,一大堆英文文献,你可能看的泪流满面、抓耳挠腮。


某一天,导师扔给你一个研究对象,比如三阴性乳腺癌


1.让你尽快查下相关的信号通路基因,有哪些?


2.这些基因和信号通路最近几年的研究热度又如何?


3.然后据此设计个课题


你会怎么办?查文献?太慢!问师姐?人家要约会啊。


别急,国内知名科研工具箱平台科研者之家(HOME for Researchers)首页上有一个叫“课题思路助手”的神器可以轻松解决。


第一步:扔进你的关键词,中英文均可,比如就lu三阴性乳腺癌



一键查询,系统告诉从文献中查出与三阴性乳腺癌相关的基因有366个,信号通路29个



词云更直观的显示,相关基因中BRCA1和EGFR比较相关,信号通路和自噬,铁死亡等相关。其实这个时候你已经对这个疾病的研究方向有一定印象了。


咦,BRCA1可以理解,毕竟当年安吉丽娜朱莉切双乳就是因为BRCA1突变。但EGFR不是通常和肺癌有关么,带着这个疑问我们继续往下:


点击基因的词云,进入到具体详情,结果页标注了每个基因的结果数。最高影响因子28.25,总影响因子达到192.53,左侧可以对年份文本类型,影响因子进行筛选。



选择刚才疑问的EGFR,点进去可以看到具体文献里的内容,浏览一下,可以得出结论,原来EGFR因其可通过JAK/STAT3信号通路促进三阴性乳腺癌,所以可以成为潜在的治疗靶点。点击语料来源即可到文献原文,点击期刊名即可查看期刊具体详情。


通过时间轴的角度分析年度基因数目的变化,来鸟瞰其基因研究热度



从热图中可以观察某个基因在不同年份的热度,比如BRCA1和EGFR,STAT3都是近几年比较热的基因。


通过以上简单的分析,相信对三阴性乳腺癌的基因及其研究趋势,热点都有大致了解。



接下来看下和三阴性乳腺癌相关的信号通路,我们可以看到相关有铁死亡,焦亡,Wnt通路,mTOR通路,MAPK通路等点击右边的通路详情和参考文献可以直接连接到KEGG数据库的相关页面,非常方便。



比如点Wnt通路,进去后就可以看到具体文献内容。


总之,通过这个工具,我们可以高效率对某一个关键词,它可以是基因,可以是信号通路,也可以是某一个表型或病种,通过海量文献找到与其相关的基因和信号通路,或高效了解某一个陌生领域,或找基因、信号通路之间的相互关系。只要抓住基因和信号通路两条线,那课题就思路就不是难事。


比如我们通过检索发现,A功能可以由x基因高表达促进,同时A功能又可以由y通路的激活促进,那x和y大概率就是协同的,于是我们的课题就可以是x基因高表达激活y通路来促进A功能


摘要怎么写都想好了:

近年来,关于促进A功能的机制仍然不清,已知y通路是其关键通路,而x之前被发现可以促进A功能,但x是否通过y来促进及其具体促进机制尚不清楚,在这里,我们.....


Enjoy it!


工具地址:www.home-for-researchers.com

弗雷赛斯

-浙江大学硕博创建于2015年

查重润色 | 绘图 在线课程课题合作 SCI写作神器 期刊查询神器


让天下没有难做的科研--联系我们:[email protected]