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主页 :https://pumachallenge.com/index.html#/
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Grand Challenge 平台:https://puma.grand-challenge.org/
目标
赛道 1 – 具有三个实例类别的全景分割
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任务 1:肿瘤、间质、上皮、血管和坏死区域的组织语义分割。
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任务 2:三类细胞核检测;肿瘤细胞核,TILs(淋巴细胞和浆细胞),以及其他细胞(组织细胞、黑色素细胞、嗜中性粒细胞、间质细胞、上皮细胞、内皮细胞和凋亡细胞)。
赛道 2 – 具有十个实例类别的全景分割
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任务 1:肿瘤、间质、上皮、血管和坏死区域的组织语义分割。
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任务 2:所有类别的细胞核检测;肿瘤细胞核、淋巴细胞、浆细胞、组织细胞、黑色素细胞、嗜中性粒细胞、间质细胞、上皮细胞、内皮细胞和凋亡细胞。
数据集
该数据集包括 155 个原发性和 155 个转移性黑色素瘤的 H&E 染色 ROI(感兴趣区域),这些 ROI 是手动选择的,并以 40 倍放大倍率(0.22 µm/像素)进行扫描,分辨率为 1024 × 1024 像素。
对于这些 ROI,提供了组织和细胞核的标注,并提供了以 ROI 为中心的 5120 × 5120 像素的上下文 ROI。这些标注由医学专家创建,并由皮肤病理学家检查和校正。
训练数据集
总共有 103 个原发性黑色素瘤 ROI 和 103 个转移性黑色素瘤 ROI 已经公开发布。该公开数据集中包含 97,429 个细胞核,分布在 103 个原发性黑色素瘤 ROI 和 103 个转移性黑色素瘤 ROI 中。
初步测试集(10 个样本)
在挑战过程中,将提供 5 个原发性和 5 个转移性黑色素瘤 ROI 的初步测试集,用于模型验证。这些 ROI 含有 4,860 个细胞核,并用于比赛初期对模型进行测试。
最终测试集(94 个样本)
剩余的 47 个原发性和 47 个转移性黑色素瘤 ROI 作为独立的最终测试集,保留在 PUMA 挑战中使用。该数据集包含 45,406 个细胞核,并将仅用于最终评估阶段
数据集中细胞核的分布
数据集中组织类别区域的分布
时间线
日期
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阶段
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2024年10月10日
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挑战赛开始,训练数据开放
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2025年1月15日
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验证排行榜开放
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2025年1月25日
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测试阶段排行榜开放
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2025年3月1日
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测试阶段结束并宣布获胜者
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2025年4月15日
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发布挑战总结和获胜方案
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