近日,American Journal of Human Genetics期刊发表了题为“10 Years Of GWAS Discovery: Biology, Function, And Translation”的最新文章。文章将视线锁定于全基因组关联性分析(GWAS),回顾了GWAS十周年来为科学界带来的改变,并对GWAS下个十年的发展及应用方向进行了展望。
不管世界各地的科学家对GWAS持何态度,不可否认的是,GWAS为人群及复杂性状遗传学、疾病生物学和新疗法转化带来了巨大突破。此前,测序中国曾刊登了题为“旋涡下的GWAS丨全基因组疾病研究价值几何?”的文章,深入探讨了大规模GWAS研究的科研价值,点击标题即可查看原文。
据悉,这篇文章共由七位研究人员撰写,由澳大利亚昆士兰大学分子生物学研究所的Peter Visscher教授领导。
Visscher写道:“全基因组关联性分析(GWAS)的实验设计应用至今已有10年,在这里我们回顾了GWAS在人群及复杂性状遗传学、疾病生物学和新疗法转化方面的成果。我们预测,在未来十年的相关研究中,GWAS将以数百万的数据为基础,基于大型全测序panel以及成千上万的全基因组测序数据样本,应用于阵列数据研究中。”
这不是第一个关于GWAS设计的综述。五年前,同一作者试图澄清对GWAS研究意义的一些误解。作者谈道:“实验设计现在已经得到了更多的接受,因为实验结果是强大而有说服力的。”
这篇综述指出,GWAS的结果已经揭示了数百个复杂的疾病性状。这些性状在不同的领域都存在差异,从常见的疾病到数量性状。这些结果也避免了研究结果可能产生的不明确性。
作者写道:“GWAS的一个明确结论是,对于几乎所有被研究过的复杂性状,许多基因位点都有助于找到遗传变异。换句话说,对于大多数关于性状和疾病的研究,基因组中的突变目标会显得很大,因此,许多基因的多态性导致了人群的遗传变异。这意味着,平均来说,个体变异解释的差异比例很小。”
综述中其他部分涵盖了一系列内容,包括GWAS衍生的遗传预测因子的效用、GWAS数据的公开性等。作者还重点回顾了三种成人期发作的疾病,包括2型糖尿病、自身免疫疾病和精神分裂症。这些疾病的遗传学研究在不断推动转化研究,从而更有效地预防和治疗疾病。
此外,作者对GWAS的未来发展进行了预测并提出意见。作者认为,随着研究规模越来越大,发现的新位点的影响往往更小,或者稀有变异的频率非常低,未来的GWAS将以全基因组测序(WGS)为基础。
作者写道:“未来,遗传变异全基因组研究将与与数百万个体的详细表型和组学数据相结合,成为人类遗传学领域的重大宝库。有些发现将完全出乎我们意料,还有些发现将揭开生物学机制的奥秘。”
参考文献:
10 Years of GWAS Discovery: Biology, Function, and Translation
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