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[上海 6月20-21日]-涵盖免疫浸润和临床模型构建两大热点的培训班

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2020-06-13 16:30

正文

目前,从现有数据库挖掘数据进行分析是一个热门领域,生信数据挖掘是直接从现有的数据库挖掘数据进行分析,不用做实验就可以得到一篇生信文章所需要的数据,这个听起来就很有诱惑力。

小张聊科研“数据挖掘与科研绘图实操班”自开班以来,培训过的学员早已过千,收到了很多好评,很多学员反映这个课带领他们进入了生信分析的大门,并且也已经有学员上过我们的培训班之后发了文章,我们深感欣慰。


2020年,我们在以往课程成功经验的基础上,进行改版,此次依凡老师为大家准备了更高级、更热门的内容--免疫浸润和临床预测模型,这两个方向目前都是发文比较容易不需要实验验证分数容易突破三分的热点领域。

免疫浸润 -- 我们通过数据库(TCGA或者GEO)下载并整理的数据,通过免疫浸润分析可以得到目标组织内的免疫细胞成分以及与对照相比的变化。

临床预测模型-- 得到的差异基因,在没有实验验证的条件下, 用回归的方法构建模型,预测发病风险高低,真正使得差异基因体现临床价值,一篇文章就水到渠成了。



往期培训


部分图表



课程特点


内容丰富,一次学习获得两大热点分析技能

资深讲师,丰富的项目经验和授课经验;

理论+上机操作,数据挖掘轻松carry;

一次学习终生受用,享受课堂面对面教授;

课上实时与老师交流,有问题当场解决;

实例操作,让你快速掌握数据挖掘套路。

老师讲课深入浅出,思路清晰易懂,零基础可参加,带您进入生信分析大门;

 课程整体思路

1、从表型到分子

2、从分子到机制

3、从分子到临床



主讲人

依凡,小张聊科研团队的资深学术讲师,医生圈的生信达人,具有多年的编程和讲课经验,主讲“数据挖掘与科研绘图实操班”二十余场,深入浅出,广受学员喜爱。

依凡老师近十年从事生物信息学和医学相关研究,致力于医学大数据挖掘和软件开发。参与发表十余篇高分SCI文章,并参与“十二五”、“十三五”、863、973重大项目等多项国家级项目的数据分析工作。

 

适合人群

广大临床/科研工作者,研究生,尤其是零基础学员

 

授课信息

课程表:

第一天

8:00-9:00

报道,领取资料

9:00-12:00

数据挖掘介绍及R语言基础

数据挖掘与生物信息简介

R语言与数据挖掘

(R语言基本语法、函数、循环、包及实例练习

12:00-13:00  

午休

13:00-17:00

GEO实例练习(从表型到分子)

GEO简介与在线分析练习

(芯片基础原理,GEO的组成框架,GEO2R差异基因筛选,聚类热图)

GEO数据下载实例练习

(实际数据下载,网页抓取,FTP批量下载)

GEO数据处理

(Affymetrix, Agilent, Illumina三大芯片平台原始数据处理,差异表达分析)

17:00-17:30

学员提问及讨论

第二天  

9:00-12:00

表达谱数据挖掘(从分子到机制)

数据分析纵向剖析

(层次聚类,主成分分析,功能富集分析,分子网络构建)

数据分析深入拓展

(免疫浸润分析,高级可视化操作)

12:00-13:00

午休

13:00-17:00

临床模型构建实战(从分子到临床)

临床模型构建的统计学背景

(参数纳入,队列分组,常用模型等)

临床模型的构建与比较

(LASSO回归、SVM、KNN、RF机器学习模型,ROC曲线评估,Delong统计比较)

数据挖掘套路解读

(从文献实例出发,剖析生物信息数据挖掘套路,带你轻松发文)

实战演练

(分小组竞赛练习,30min重现一篇SCI文章的数据分析结果)

17:00-17:30

学员提问及讨论



注:

1、实际授课过程中,老师可能根据进度对课程进行微调

2、请学员自带电脑,mac或者windows系统的笔记本(请勿使用XP系统,推荐win10),老师用win10系统进行讲解。

3、本次课程以R语言为工具,贯穿整个课程。

 

时间:2020年6月20-21日(周六、周日)

地点:上海

 

注册费(可开发票):

6月12日前

6月13日至19日

现场缴费

3400

3600

3800

二人组团报名,每人可优惠100元

三人组团报名,每人可优惠200元

四人及以上组团报名,每人可优惠300元


办会员可以享八折优惠!详情咨询猫头鹰班长!

注:

1、本次学习班提供两天的午餐,其余食宿费用自理

2、本课程包含配套线上课程“实用数据挖掘”,与线下课程相辅相成,相互补充,作为课后复习的资料,此处为优惠价400元,包含在报名费里面,不需要网课的请与猫头鹰班长说明,可自行选择


报名请联系猫头鹰班长(微信号:xzlky2015-training),加微信时请注明“姓名+数据挖掘