第十一期 · 空间多组学研究策略及生信分析培训班2天线下上海和线上同步授课（SBC&生信技能树&上海市生物医药行业协会）

生信技能树 · 公众号 · · 2024-03-16 22:47

正文

下周的周四和周五（2024年3月21-22日），我们生信技能树团队受邀到上海张江高科的上海生物芯片有限公司，联合举办空间多组学研究策略及生信分析培训班（基础课程）。 欢迎新老朋友前往线上场地面对面沟通交流哈！

主办单位

上海生物芯片有限公司

（生物芯片上海国家工程研究中心）

生信技能树

上海市生物医药行业协会

培训时间

2024年3月21-22日

培训方式

- 线上（腾讯会议）-

培训课程直播

- 线下（ 限20人 ） -

上海市浦东新区李冰路151号1103会议室

课程亮点

强强联手，协会把关

由上海生物芯片有限公司（生物芯片上海国家工程研究中心），生信技能树与上海市生物医药行业协会共同主办，培训质量更有保障。特邀单细胞及空间分析领域资深老师、生信技能树创始人曾健明及其教学队伍，与SBC专业团队共同开设多维度课程，关键点逐个击破。

线下+线上

除线下培训外，同步开启线上直播网课，足不出户享有同等培训内容。提供课程回放，3个月内无限观看。选择更合适的学习形式，获得更好的学习效果！

研究策略+数据分析

从研究策略切入，延伸到数据分析，全链条加深对空间多组学研究的理解。

社群交流

设置讨论群，与科研伙伴交流探讨，资源共享，激发思维火花。

从零基础到入门进阶

课程设计从基础到入门进阶，并提供软件安装、课件资料，生信小白也能上手分析。

课程安排

基础课程 （适合零基础、入门水平的学员）

3月21日
时间	课程安排
09:20-09:30	开课致辞
09:30-10:30	单细胞测序及单细胞多组学研究策略及前沿进展 · 单细胞测序技术的发展 · 10x Genomic单细胞测序原理 · 样本准备注意事项及前沿应用介绍
10:30-11:30	空间转录组测序研究进展及注意事项 · 空间转录组技术进展 · 空间转录组测序平台介绍：10x Visium Cytassist，GeoMx DSP，CosMx SMI等 · 空间转录组测序样本准备注意事项 · 空间转录组应用介绍
11:30-13:00	午休
13:00-13:45	R语言基础（生信技能树授课） · 基本概念：向量、数组和矩阵、函数； · 数据导入、编辑、数据结构转换； · 文件图表生成、导出
13:45-14:30	R语言进阶（生信技能树授课） · 统计检验，差异基因计算
14:40-15:40	样本准备及注意事项 ·单细胞样本准备及常见问题，Demo实验 ·空间转录组样本准备及常见问题，Demo实验
15:40-16:40	ggplot2作图详解（生信技能树授课）柱状图、饼图、BOXPLOT、小提琴图、密度曲线图，散点图，差异基因可视化（火山图）等

3月22日
时间	课程安排
09:30-10:30	单细胞转录组数据分析介绍与上机实操 · 基于cell ranger 、Loupe
10:30-11:15	单细胞转录组数据多样本比较分析介绍与上机实操 · 基于Seurat包，原理简介及实操
11:15-11:45	单细胞RNA测序数据的聚类工具比较介绍
11:45-13:00	午休
13:00-14:20	空间转录组数据分析介绍与上机实操 · 基于space ranger 、Loupe
14:20-15:00	单细胞拟时序分析 · Monocle的原理算法介绍 · RNA速率原理介绍
15:10-16:20	GEO等公共数据库下载及数据挖掘和细胞注释（生信技能树曾健明老师授课） · 基于singleR和人工审查的单细胞亚群命名比较 · 从GEO等公共数据库下载单细胞数据集走降维聚类分群

课程费用

1、两天培训课程费用为 500元/人（含课程回放及课件资料） 。

2、两人以上（含两人）团体报名享 8折优惠 ；

3、报名参加 线下培训 产生的食宿交通费用等请自理。

报名及付款

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