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DeepSeek 联合 PubMed、Zotero 等四大工具出手了!研究生直呼:我论文有救了

生物学霸  · 公众号  · 生物  · 2025-02-22 17:38

正文


随着 Deepseek 的横空出世,其强大的信息检索、分析及整合能力,使得复杂的数据处理变得轻而易举。然而,单一工具的应用往往难以满足科研的多元化需求。为此,学霸君尝试探索了 Deepseek 与其他科研工具的深度融合,发现了一系列好用的「王炸组合」, 现在,就带大家详细了解和实操一下以下 四大「王炸组合」:

  • DeepSeek+PubMed

  • DeepSeek+Zotero

  • DeepSeek+Mermaid

  • DeepSeek+Kimi

它们分别能够在文献检索、文献阅读、科研绘图、PPT 制作等方面发挥作用,可为各位小伙伴提供一套事半功倍的研究利器,从而达到提升工作效率的目的!

图片来源:网络


DeepSeek+PubMed

图源:自制

DeepSeek 有时会推荐一些不存在的文献,给很多科研人员带来困扰。

为此,我们就想如果能够在 DeepSeek 的基础上结合 Pubmed,那么这个问题不就可以了迎刃而解了么?

一方面,可为科研人员提供更加深入、更加精准的文献分析和理解;另一方面,也能够解决 DeepSeek 偶尔会推荐不存在文献的问题。

接下来,学霸君就来为大家介绍一个「DeepSeek+ PubMed」的王炸工具 ——PubMed.pro!

首先,我们需要进入 PubMed.pro 网站(www.pubmed.pro),注册并进入主页面。

图片来源:PubMed.pro 官网

接下来,需要切换到学术 AI,直接输入问题, 然后再勾选右下角的「深度思考」,发送即可。

图片来源:PubMed.pro 官网

【指令】 针对蛋白质结构的最新研究进展,梳理 5-10 篇最新的文献。

同时,大家也可以根据自身的需要来对影响因子(IF)和文章发表时间进行设定。

图片来源:PubMed.pro 官网

图片来源:PubMed.pro 官网

为了验证检索的文献是否真实存在,我们随机选取了第 5 和第 10 篇文献在 PubMed 进行反向检索, 发现的确是真实存在的,这也很好地解决了 DeepSeek 推荐不存在文献的问题!

图片来源:PubMed.pro 官网

接下来再来试试它的初稿撰写功能。

指令: 帮我写一篇关于【阿尔茨海默病早期诊断标志物】的综述文章初稿,重点聚焦于【阿尔茨海默病特定治疗方法】方面。

图源: PubMed.pro 官网

总之,pubmed.pro 的优势是生成内容均有可靠依据,插入的参考文献真实有效,除此之外,大家也可以尝试利用它实现论文翻译、文本润色等等,篇幅有限学霸君就不在此一一演示。


DeepSeek+Zotero

图片来源:自制

开始之前, 需要先自行安装最新版本 Zotero 7.0 以及 GPT 插件 Awesome GPT。

其中,Zotero 安装地址为:

https://www.zotero.org/Zotero;Zotero

插件中心网址为:

https://zotero-chinese.com/plugins/Awesome。

此外,GPT 插件也可以直接进行下载,

其地址为:

https://github.com/MuiseDestiny/zotero-gpt#readme。

图片来源:Zotero 官网

图片来源:GitHub

图片来源:GitHub

下载好 GPT 插件之后(xpi 格式文件),就可以在 Zotero→ 工具 → 插件 →Install plugin From File→ 选择刚刚下载的 GPT.xpi, 即可进行安装,具体操作过程如下:

图片来源:Zotero

图片来源:Zotero

图片来源:Zotero

由于 Zotero 需要中转密钥,因此这里采用硅基流动(https://cloud.siliconflow.cn/i/YxET0Too)提供满血版 Deepseek 进行操作,按界面提示即可完成注册。

图片来源:硅基流动

接下来, 打开模型广场,选择对应模型即可进行提问, 这里我们选择 「deepseek-ai/DeepSeek-R1-Distill-Qwen-1.5B」这一免费模型。

图片来源:硅基流动

然后,点击左侧 API 密钥后,点击新建密钥,输入名称后即可获得密钥,鼠标点击后复制密钥。

图片来源:硅基流动

紧接着,我们再打开 Zotero→ 编辑 → 设置,按照如下进行设置,其中硅基流动 api 依照图上进行填写 https://api.siliconflow.cn,密钥填写刚才申请的即可。

图片来源:Zotero

图片来源:Zotero

配置成功后即可进行提问。通过快捷键「Ctrl+/」调出 GPT,然后便可进行提问, 例如总结文献主要内容、润色语言、文章翻译等。

图片来源:Zotero

咱就是说,学会借助工具读文献,提炼创新点,一天十几篇论文,一周精通一个领域不是梦呀。


DeepSeek+Mermaid

图片来源:自制

Mermaid 是一种轻量级的图表标记语言, 允许用户通过简单的文本语法定义各种类型的图表,包括流程图、序列图、甘特图等。

DeepSeek 作为一款强大的开源大语言模型,能够根据自然语言描述自动生成代码。 我们可以利用它来快速生成 Mermaid 语法,从而减少手动编写的工作量。

例如,我们需要绘制一个简单的审批流程图,可以向 DeepSeek 提供以下输入下述指令:

【指令】请生成一个 Mermaid 流程图语法,描述以下场景:

用户提交申请;

管理员审核申请;

如果审核通过,则进入下一步;

如果审核不通过,则返回用户修改。

图片来源:DeepSeek

然后,打开 draw.io 绘图工具(https://draw.io),点击菜单栏的 「+」→ 选择高级 →Mermaid。

图片来源:draw.io

然后将 DeepSeek 输出的代码复制、粘贴到文本框即可完成流程图绘制,然后大家再根据自己的需要进行图形与文字编辑即可,如下图所示。

图片来源:draw.io

图片来源:draw.io

通过 DeepSeek 和 Mermaid 的配合使用,我们可以快速生成结构化流程图,并借助工具如 draw.io 等绘图工具将其渲染为高质量的可视化图表。

这种方法不仅提高了效率,同时也降低了手动绘制流程图的复杂性。 需要注意的是,我们在向 DeepSeek 发出指令的时候,一定要提示其返回 Mermaid 格式哟!


DeepSeek+Kimi

图片来源:自制

除此之外,DeepSeek 还可以接入 Kimi 用于制作 PPT。我们在文献汇报的过程中,首先需要阅读大量文献,然后再一点一点地去做 PPT,这个过程往往需要花费大量的时间。

现在,我们只需要将 DeepSeek、Kimi 进行联合,就可以快速实现这个目的。

例如,我们制作一个文献阅读汇报 PPT,可以向 DeepSeek 提供以下输入下述指令:

【指令】 请阅读以上文献,写一份关于冷冻电镜技术研究状态预览的 PPT。总结冷冻电镜技术的研究目的,研究现状与壁垒,未来研究方向。请用 Markdown 的形式输出 PPT 的内容。

图片来源:DeepSeek

紧接着,DeepSeek 便会给出思考和 Markdown 格式代码,其思考过程也非常值得我们学习!

图片来源:DeepSeek

接下来,我们需要将 DeepSeek 给出的 Markdown 格式代码,复制并粘贴到 Kimi(https://kimi.moonshot.cn/)。

首先,我们点击左侧的 Kimi+,选择 PPT 助手;

图片来源:Kimi

图片来源:Kimi

然后,我们在对话框中输入刚才复制的 Markdown 格式代码,点击右下角的发送即。

需要注意的是,我们在向 DeepSeek 发出指令的时候,一定要提示其返回 Markdown 格式哟!

图片来源:Kimi

等待 Kimi 回复结束,点击下方的一键生成 PPT 即可。







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