学徒在完成单细胞数据分析后,决定结合scRNA和bulk RNA进行分析,并进行了系统性的生物信息学学习,包括bulk RNA分析、单细胞分析和Linux数据上游分析等。
学徒顺利入住泊寓公寓,并在中山市中心的学习环境中进行系统性学习。她分享了自己弹性上下班和学习氛围的体会,以及能够在学习中得到大佬指点和及时解决问题的成长。
学徒通过系统性学习,更加系统地了解数据分析,并且逐渐了解数据结构,从自己的代码和报错文字中找到问题的根源。同时,她也分享了教学重点是教学而非代写文章的观点。
学徒培养需要预留线下时间接受培养,并提交简历、推荐信等申请材料。基本道德素养是参与学徒培养计划的重要要求之一。
很多小伙伴对我们的学徒培养模式来系统性线下学习生物信息学的过程很感兴趣,恰好最近的出师的学徒写了一个详细的感受和全过程的来龙去脉,应该是可以给大家一个比较清晰的介绍啦!
分界线:下面是学徒的原文
早在2023年的时候,我和曾老师约定写完论文后去做学徒。一直没确定学习内容,直到我完成了单细胞数据分析,发现无法发表。
决定结合scRNA和bulk RNA一起分析。此外,我的BCR和TCR分析也很不顺利。于是,在交完论文后,我毅然决然地去了中山。
下面就大家感兴趣的,报道、住宿以及重要的学习过程简要总结。
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一、对接
飞机到广州白云机场,在广州逛完,约的车去的中山——创富商务中心。
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因为性别女,所以与我对接的是,可爱漂亮又能干的大飞老师,当时去报道是带娃儿去的,娃娃很喜欢大飞给的鲜花饼,去公寓一路上都是自己拿着。
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二、住宿
因为最后要一个人在中山学习,所以在可爱的家玉同学的帮助下,我顺利入住泊寓。
公寓是没有被褥的,自己美团买一下就行,办公室在中山市中心,去商场买也就需要走三四百米的距离。
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三、学习内容
一切为了学习,开始学习前,根据我的需求和现有的学习情况制定学习计划,主要包括三部分:
(一)bulk RNA分析
跟着小洁老师的课系统的学习了芯片和转录组数据的分析。
然后利用自己感兴趣的胃癌数据进行实战训练。
(二)单细胞
我原本跟着生信技能树公众号、B站和Github等账号学习了单细胞的分析流程,完成了自己数据的简单分析
,这次系统的学习单细胞分析,加快了自己分析的速度。
(三)Linux数据上游分析
在进行公共数据挖掘时,常常遇到有的数据给的是Rawdata,需要自己跑Cellranger流程,我曾经自己在MAc上一顿瞎搞,最后没成功。
到了中山,跟着永杰老师一起学习使用服务器进行单细胞上游分析,轻松搞定!
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四、学习氛围和心得
上班时间虽然是早九晚七,但是根据自己需求,弹性上下班(和师弟师妹出去吃小烧烤),只要完成自己内容就好,同时每天及时的写学习汇报。学
习汇报既是让老师了解自己的学习进度,也能对自己的学习内容复盘,并作出合理的下一步计划。
这段时间的学习,让我更加系统的了解数据分析,并且能一对一及时的得到大佬的指点,我也曾想当然的写自己认为对的总结,发到群里,曾老师看到,或鼓励或指正,都很开心,能真正的学到东西,学习就是数据分析从原来自己认为对的,变成了真正合理的!
从原来遇到问题,网页搜半天发生了什么,为什么,怎么解决,到现在逐渐的了解数据结构,从自己的代码和报错文字中找到问题的根源,去解决问题,然后不会解决的再去网上找答案,也许这才是看不见的不见的成长!
五、小结
时间太快,还没来得及总结和深入学习,就回来准备毕业答辩事宜了,我的Linux转录组上游和文章的复现以及循环语句还都需要继续努力!!!有收获的学习旅程,值得信赖的生信技能树!!!
写在文末
我基本上
在任何公开场合宣传过我们的
生信技能树超级VIP入场券发放(人民币一万起)
,但是因为这个模式实在是太成功了,
仍然是一直被口口相传,师兄师姐推荐或者导师派自己的学生来我们这里也是一直源源不断。
之所以把自己10年生物信息学数据处理从业经验提炼出来,只希望可以帮助大家在一个月(或者更多)内学习到我一年的知识,
帮助大家在入门的时候少走弯路
, 后续生物信息学技能提高(比如发cns文章)并不在培训范围内。
另外:学徒培养并不包括具体的
课题项目咨询
,咨询费大部分情况下是超过我们这个生信技能树超级VIP入场券的1万元。
如果是科研数据处理关键问题咨询,电话沟通
30块钱一分钟
,首先需要发邮件给我沟通详细描述自己的疑问所在然后约时间沟通,邮件发送到 [email protected]
如果是