正文
棒棒糖图和哑铃图（滑珠散点图）作为柱形图的变形类图表，在论文中的出现频率也非常高。
Fig1 棒棒糖图（
Nature Communications
, 2021）
Fig2 滑珠散点图（
Nature Methods
, 2021）
上次给大家分享了R语言和OmicShare在线工具绘制棒棒糖图和哑铃图，具体方法和图表的介绍详见推文
《棒棒糖柱形图，给你打开新世界的大门》
。R语言可定制化的程度较高，不过需要编程基础；OS的点棒图工具更用法更简单，但个性化调整稍有限制。
但若觉得R语言绘制稍显困难，而OS点棒图又不太够自由，就需要使用其他的绘图工具了。今天就为大家分享如何用GraphPad Prism9绘制Fig1和Fig2这般的棒棒糖图和滑珠散点图，这次保证所有人都能轻轻松松学会！
打开GraphPad Prism，在起始页选择
XY
表格类型，Options中X选
Numbers
，Y选
Enter and plot a single Y value for each point
，随后点击Create创建，如下。
在左侧工作区的
Data Tables
将绘图所需数据复制进来，如下。这里需要注意，由于我们之前在XY的 Options中X选了Numbers，因此只能输入数字，如果自己的数据是分类变量，如基因名称等，使用
方法一
绘制，
最后需要导出矢量图在AI或别的绘图软件中修改X轴标签
。
在工作区
Graph
图表处点击与表格对应名称的Data1（未修改，默认），在图标类型中选择第一种（散点），点击OK，即可生成散点图（棒棒糖图雏形）。
棒棒糖图是啥？散点加一根线，因此还需要继续美化修改：双击绘图区，在
Appearance
面板中同时勾选
Show symbols
和
Show bars/spikes/droplines
，在
Show symbols
选项中调整“头部”散点的形状大小及颜色，在
Show bars/spikes/droplines
选项中调整“躯干”直线的颜色和粗细，如下图。
棒棒糖图的其中一个好处就是能够收窄柱子，相同的数据占用更少的空间，因此图表默认的宽度显然太宽。我们双击坐标轴区域，或者在上方工具栏的
Change
工具组中选择
Format Axes
，在
Width
处调整图表宽度；在
Frame style
处选择
Plain Frame
全框样式；在
Thickness of axes
处修改轴（外框）线条的粗细，如下图红框所示位置。
绘制效果如下，方法一就介绍到这里！
上述方法X轴只能是数值标签，而且不能将坐标轴翻转。但好处是可以任意调整柱子“躯干”的粗细。下面我们使用方法二，此方法可以把棒棒糖图
翻转坐标和使用变量标签
。
在起始页选择
Grouped
，Data table和Options选项都保持默认第一个，点击Create创建，如下。
将数据整理成横向，复制进Data table中，一个Group对应一个基因名，如下图。
点击左侧工作区Graphs处的Data2，在图表类型中选择Grouped—Summary data—横向或者纵向的柱形图样式（第一或第四个），点击OK，如下图。
默认生成的就是下图的单分组柱形图。柱形图不是我们的目标，于是继续双击绘图区进行下一步修改。
在
Appearance
面板中，先选择
Change All data sets
（对所有分组同时修改），在
style
的
Appearance
处选择
Scatter dot plot
，在
Symbols
处修改散点的大小形状颜色，这里和方法一相同，修改位置如下图。
现在图表间距太窄了，需要拉宽，还有就是只有点没有线咋办，这里我们可以投机一下。其实与方法一类似，双击坐标轴区域，或者在上方工具栏的
Change
工具组中选择
Format Axes
，在
Width
将图表加宽；在
Frame style
处选择
Plain Frame
全框样式；在
Major grid
处选择给X轴添加纵向网格线，并修改网格线的颜色、粗细、线形，如下。这样我们绘制出来的这种“棒棒糖图”又称之为
滑珠散点图
，本质是一样的。
如果数据是来自不同样本或分组，我们可以设定不同的颜色，如下。
方法二就介绍到这里！
此方法绘制滑珠散点图和方法二类似，但是用于两个分组间两两比较，如文首的案例Fig2。
选择是同样是选择Grouped，在Options选择第二个，数量填2，如下图。
