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有奖直播|单细胞测序 + 时空组学的经典研究方案解析

生物学霸  · 公众号  · 生物  · 2024-10-26 17:30

正文

近日,华中农业大学在Nature Plants上发表研究成果 A spatial transcriptome map of the developing maize ear。研究利用时空组学技术 Stereo-seq 构建了首个玉米雌穗空间转录组图谱,最终共获得12 种细胞类型的转录组及其空间位置信息,发现两个对小花分生组织分化起到关键作用的基因。这项研究不仅为玉米雌穗的建成提供了新的基因发掘方法,也为植物发育研究提供了新的视角。


1

时空组学技术 Stereo-seq 被 Nature 评为年度技术,截至 2024 年 8 月,该技术在 NCS 等期刊上已发表文章80+ 篇

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Stereo-seq 技术可实现组织、细胞、亚细胞、分子「四尺度」同时进行空间转录组分析。通过时空芯片捕获组织中的 mRNA,并通过时空条形码还原回空间位置。

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在应用方面,Stereo-seq 技术可适用于人类、小鼠的多种组织器官以及斑马鱼、果蝇、蝾螈、拟南芥、大豆、水稻、洋葱、花生、玉米等物种。



根据自身实验需求,如何将空间组学技术引入研究方案设计并开展试验?又该如何更好的利用单细胞和空间组学技术,实现 1 + 1 > 2 的效果?


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植物原生质体提取困难且易引入基因表达偏差怎么办?冷冻切片制作困难怎么办?不同物种或组织实验条件难统一且缺乏可靠 marker 基因及数据库又该如何? 


Stereo-seq 技术通过获得单细胞分辨率空间转录组数据,助力发育和分化研究、共性机理或表型研究、解码植物与微生物相互作用等多种研究。



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内容策划:沈佳钰

内容审核:朱卿

题图来源:图虫创意