专栏名称: 研之成理
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直播视频集锦 | GROMACS 基础与自由能计算专题课程​

研之成理  · 公众号  · 科研  · 2020-03-29 08:00

正文

以下是第一期GROMACS 基础与自由能计算专题课程视频集锦


内容介绍
一、主要方法概述,Gromacs简介,分子动力学模拟原理简介,力场文件生成,输入文件介绍,计算结果分析。
二、自由能微扰FEP方法,实例:水中甲烷溶解自由能的计算
三、热力学积分TI方法,实例:蛋白配体复合物的结合自由能
四、伞状采样US方法,实例:单个多肽从原丝纤维生长端的分离
五、MMPBSA方法,实例:蛋白配体复合物的结合自由能分解
六、更深入问题的建议参考资料

课后答疑
各种方法讲解的思路如下:
  • 基本原理思想
  • GROMACS中的计算流程
  • 相关文件及命令解释
    教程运行演示
    示例结果说明


主讲人: 裴老师 (天津大学,精通GROMACS、 Gaussian、 Multiwfn、 VMD/Mercury、 packmol/MS等计算程序。)
直播时间: 2020 年3月7日、9号、11号 19:30(一共 3 次课,每次 2 - 3h),可回看。
费用: 199元,可开票,开票另加10 %的税点
咨询/报名:请扫描下方二维码,加小编微信:







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