你想做的chip启动子是怎么找到的？

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作者：凌风（转载请注：解螺旋·医生科研助手）

你知道启动子在哪里么?

LncRNA的研究炙手可热哇，表观遗传学机制方面你不得懂一点？

不管是高大上的chip还是荧光素酶报告基因，都少不了启动子的序列，那么问题来了，启动子区的序列你会查么？

图文解析来啦，这是小编最常用的方法啦，接地气，用神器----ucsc!

1.打开ucsc，小编一般都用hg19版本，在下图中搜索明星分子BCL-2（why？因为它出名哇！！）。

2. 接下来你就看到这一堆堆线条，不对啊，bcl-2这个基因怎么显示的这么勉强，那就zoom out吧！zoom out 是缩小，这怎么记住呢？你想啊，你站的远看到的就多啦，是不是就能看到它的全貌了？ 是不是就把眼前的缩小了呢？

3.站得远，看的清了，你就可以看到这个基因的全貌了，一般我们认为启动子很有可能是在TSS前2kb，或者TSS后1kb位置，所以我们就先看一下基因的转录方向，从起始不为前后各拉一段（敲黑板，划重点！）。拉多长，你可看到那个标尺？根据标尺大小适当的拉~

诺，就是像这样，大致拖个范围出来，就会弹出下面的框框，点zoom in 放大。

5.大致看一下，这个范围拉的还算合理，那我们就要取序列了，点“view”，再点“dna”，翻页再点“getDNA”就可以得到了！

6.有了序列，再把外显子部分序列标注出来，你就可以随心所欲的来挑选设计启动子区引物了~如果你不会查外显子序列，那你就再往下看看：

你不是搜索了BCL-2了么，在第2个图上面，你看到Refseq Gene了么？点它下面那条线，蓝色框框里面的：

再点框框里的

就看到它有几个外显子，序列是什么，中间隔着啥，都看到了：

你懂了么？这个是小编最常用的，倾情奉献，当然也有很多其他方法，见仁见智啦！