沃奇生物独家代理 TBtools 插件已有三年。
近日，向 TBtools 作者「CJ-陈程杰」老师汇报了三年的工作小结，并进行了简单讨论。
陈老师提及不仅插件要从源头优化，同时也要把教程做好。
为此，技术组几个小伙伴讨论后，决定对相关资源进行汇总，方便老师同学们了解。
目前已有众筹插件列表如下：
此外，我们还有一个基因家族分析课程专属插件，不公开授权。
Advanced HMMer Search
用于快速实现 HMMER 做相似性序列搜索的工具，主要用于基因家族。此插件提供了便捷操作：
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可提供 PFAM 编号，有插件自动下载并构建模式库，随后对序列直接进行搜索
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支持输出 模型文件.hmm，对序列进行搜索
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支持输入多序列比对结果 ，插件会自动构建模式库，随后对序列进行搜索
详细可见教程
https://mp.weixin.qq.com/s/bflil_pFhBw0Xx6pui-fOA
Newick Rename
稳健的进化树重命名工具很少，陈老师开发的 进化树重命名 插件往往可以有意想不到的好效果，极大降低数据分析工作量。详细可见教程
https://mp.weixin.qq.com/s/yQCyVIheiJDxqnZ2R3ByEw
Batch MEME Motif SeqLogo Viz
MEME 分析结果产生的 Motifs 往往需要可视化看看 每个 Motifs 大体是什么序列。如下：
不得不说，陈老师的这个可视化输出结果很漂亮！目前没有好用的工具可以完成。详细可见教程
https://mp.weixin.qq.com/s/JPSXyDzs9D4YjUgGh7UBhw
Genome Region Compare
进行细致的基因组区间序列相似性分析或者共线性分析，可以让我们更好地探索生物学问题。陈老师曾经众筹开发过这一插件，效果很好。我们公司已经在不少项目上应用。
具体可见教程
https://mp.weixin.qq.com/s/exlBXJBNB1wKTvWmjymjxQ
陈老师还录制了专门的视频介绍和使用教程，推荐学习
https://mp.weixin.qq.com/s/0wSh_dviSgDegCnpU_5lkg
BioPanGu
随着实验室组学数据和研究物种的增加与丰富，对应的数据管理往往会变得比较混乱，为此可以使用 BioPanGu 插件,，一站式管理实验室数据。
详细可见教程
https://mp.weixin.qq.com/s/S4GHGLEiih9ZmFKIdHYt7A
陈老师为这个插件录制了视频教程，老师们需要可以参考。
https://mp.weixin.qq.com/s/gWOoKRQ4ezHV7xq6XjwPQQ
RNAseq 系列插件
转录组数据自主分析，TBtools Pro 系列有 8 个插件，可以用于完成全面分析。结合插件商店的公开插件，如差异表达分析，基因共表达网络分析，几乎可以完成 转录组 数据分析所有内容。
推荐直接学习陈老师的教学视频
https://www.bilibili.com/video/BV1fL4y147mb
如果对文件教程感兴趣，可以了解下述教程，但看过视频则并不需要（来源：生信石头）
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SRA 数据查询与整理
：SRA XML to Table，见推文：挖掘SRA的辅助小工具（NCBI高通量测序数据收录库）
https://mp.weixin.qq.com/s/FnuSUqhpyKqm_HYpu6phnw
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SRA 数据链接获取
：SRA XML to Table 和 SRA Number to ENA Info. 前者已经包括了 NCBI 和 DDBJ 数据下载链接，后者主要作为补充，附加 ENA 下载链接（更为稳点）。详细见：《公开可获取~没有下载不到的测序原始数据！》
https://mp.weixin.qq.com/s/CS04e0QRjq0B-NZUfCpUAg
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Ascp GUI Wrapper
：个人实测，每天清晨通过 FTP 链接下载测序原始数据，速度可以达到 10Mb/s。但更多时候数据只有不到 300Kb/s。网络合适的情况下，可以使用 Aspera ，速度可以达到 30Mb/s。于是写了并公开释放了这个插件，详细见：插件 | 人人-点点点-光速下载 NCBI/ENA NGS原始数据
https://mp.weixin.qq.com/s/YYneVPb3V6Dq5WXiq2JYTQ
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SRAtoFastq
，sra 是 NCBI 定义的二代数据存储格式，文件大小比fastq.gz下，考虑网络带宽的情况下，下载 sra 数据更方便。下载后需要进行转换，于是有了插件，详细见：SRAtoFastq | 任何人都能自主分析测序原始数据
https://mp.weixin.qq.com/s/WC6Q1wr2M4CsdVZ2XYFjRA
