从衣食住行,到科学研究,再到人类基因测序、医药研发、气候预测等,算力,正在深刻赋能各行各业。
以基因测序为例,人类的基因中,碱基对高达30亿个组合,从30亿个组合当中找出变异,这些运算背后都离不开高性能计算。
网宿科技子公司爱捷云作为领先的算力云服务商,现已深入基因测序领域,为行业客户提供海量、多态、稳定、灵活的算力服务。
爱捷云算力云基于海量CPU+GPU异构算力资源池、高性能存储及网络架构、弹性敏捷的云平台底座,在近一年来,成功支撑某基因测序平台完成数十个高通量基因测序任务。
爱捷云算力云高度匹配基因测序任务对算力、存力的密集计算、敏捷部署、自动扩容等需求,大幅提升基因测序效率的同时降低了基因测序的成本。
某基因测序公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用与推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和生物技术服务,拥有成熟的Illumina 的Miseq、Hiseq等测序平台,为广大客户提供RNA测序、DNA测序、16S多样性测序工作。
每个基因测序都是一个极其消耗计算资源的过程。举例来说,一个30倍测序深度的人类全基因组数据FASTQ文件大约是200G,中间运算过程中,还会变大至600G,整个重组计算过程大概需要20多个小时。
随着基因测序技术的普及,基因测序业务量也在逐年增长,需要庞大的计算、存储、网络等资源支撑。
不仅如此,在基因测序的每个阶段,对计算、存储、网络等资源也有着不同的差异化诉求,每进行一次完整的基因测序任务,都需要快速创建多种规格且不同算力类型的计算资源,这对算力云平台自动扩容、多任务并行、存储集群性能等都提出了极大的挑战。
对该公司而言,不管是直接购买物理机或者自建HPC集群,都面临高昂的成本,且传统、单一的物理算力集群及存储平台难以支撑基因测序任务的高效运行。
爱捷云依托自身强大的算力云平台,为该基因测序平台提供了CPU及GPU在内的多态异构算力、高性能对象存储及本地块存储、API全局智能调度解决方案,凭借着自定义算力实例规格、自动化部署及扩容、按量(秒级)计费等优势特性,高效承接基因测序业务不同分析阶段的算力、存力、运力需求,使得整体基因测序效率大幅提升,测序成本减少30%以上。
爱捷云基因测序解决方案架构图