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让基因测序更快更准,网宿旗下爱捷云赋能基因行业发展

网宿科技  · 公众号  ·  · 2024-06-06 09:12

正文


从衣食住行,到科学研究,再到人类基因测序、医药研发、气候预测等,算力,正在深刻赋能各行各业。

 

以基因测序为例,人类的基因中,碱基对高达30亿个组合,从30亿个组合当中找出变异,这些运算背后都离不开高性能计算。

 

网宿科技子公司爱捷云作为领先的算力云服务商,现已深入基因测序领域,为行业客户提供海量、多态、稳定、灵活的算力服务。

 

爱捷云算力云基于海量CPU+GPU异构算力资源池高性能存储及网络架构弹性敏捷的云平台底座,在近一年来,成功支撑某基因测序平台完成数十个高通量基因测序任务

 

爱捷云算力云高度匹配基因测序任务对算力、存力的密集计算、敏捷部署、自动扩容等需求,大幅提升基因测序效率的同时降低了基因测序的成本。


 

某基因测序公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用与推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和生物技术服务,拥有成熟的Illumina 的Miseq、Hiseq等测序平台,为广大客户提供RNA测序、DNA测序、16S多样性测序工作。

 

每个基因测序都是一个极其消耗计算资源的过程。举例来说,一个30倍测序深度的人类全基因组数据FASTQ文件大约是200G,中间运算过程中,还会变大至600G,整个重组计算过程大概需要20多个小时

 

随着基因测序技术的普及,基因测序业务量也在逐年增长,需要庞大的计算、存储、网络等资源支撑

 

不仅如此,在基因测序的每个阶段,对计算、存储、网络等资源也有着不同的差异化诉求,每进行一次完整的基因测序任务,都需要快速创建多种规格且不同算力类型的计算资源,这对算力云平台自动扩容、多任务并行、存储集群性能等都提出了极大的挑战

 

对该公司而言,不管是直接购买物理机或者自建HPC集群,都面临高昂的成本,且传统、单一的物理算力集群及存储平台难以支撑基因测序任务的高效运行。


爱捷云依托自身强大的算力云平台,为该基因测序平台提供了CPU及GPU在内的多态异构算力高性能对象存储及本地块存储、API全局智能调度解决方案,凭借着自定义算力实例规格、自动化部署及扩容、按量(秒级)计费等优势特性,高效承接基因测序业务不同分析阶段的算力、存力、运力需求,使得整体基因测序效率大幅提升测序成本减少30%以上

 

爱捷云基因测序解决方案架构图



算力层面






爱捷云算力云以云服务器、容器、裸金属服务器三种形态提供CPU、GPU等算力资源,开放API/SDK接口,自动化按需调度算力资源,匹配不断波动的测序算力需求,创下了单任务数千台云主机稳定并发一周的记录。


同时,计费精度可精确至秒级,确保算力资源使用“滴水不漏”。



存力层面






爱捷云算力云同时提供分布式对象存储、文件存储、及块存储等多种数据存储方式。同时支持分布式缓存、RDMA、多副本/EC、数据冷热分层等技术,全面保障测序数据高带宽吞吐及低成本高可靠归档。

 

服务以来,爱捷云算力云助力该基因测序平台,承接了国内外数百项动物、微生物的重测序及溯源追踪工作。


爱捷云所提供的优质、多态、稳定的算力及存力资源,提高了数据处理和分析的速度,使得基因测序结果更快地生成和解读,从而为科学研究和医疗诊断提供更及时有效的支持。


在未来,爱捷云将持续关注基因测序领域,让更多的组织及个人享受到基因测序的便捷与价值。