作者:shaosai 来源:MedSci原创
影像基因组学是近年来蓬勃发展的一门新兴学科,国内外大部分文献报道集中在近五年。它将影像学和遗传学结合起来,用以研究不同基因型的病变的差异。
非小细胞肺癌(NSCLC)患者RNA序列具有特异的基因表达特征,本研究旨在创建影像基因组学图将CT影像学表现和基因表达特征联系起来,从而评估癌基因组学图验证分子与根据预后意义进行的影像学分型的关系。
本研究共纳入了自2008年4月至2014年9月113例诊断为NSCLC患者,并对CT和肿瘤组织资料进行分析。
对于每一处肿瘤,以为胸部放射学医师记录87种语义图像特征,选择能够反映结节形态、边界、纹理、肿瘤周围组织关系和整个肺的影像学特征。然后将所有肿瘤组织中的RNA成分分离出,并利用RNA序列技术进行分析。
10种高度相关表达的基因簇被发现,并命名为转位基因。该基因在基因谱中得到验证,其与肿瘤的预后相关。随后,利用T检验和Spearman相关分析并经过多重检验验证得到影像基因组学图,将语义影像学特征和转位基因联系起来。
本研究结果为RNA序列分析结果为有10种转位基因控制着各种分子通路,包括表皮生长因子(EGF)通路。影像基因组学图包括了32种影像学特征与转位基因间的相关性,并有统计学意义。例如,结节密度模糊和边界与晚期细胞周期基因相关,与EGF通路相关的转位基因与磨玻璃影、不规则结节和边界模糊的结节具有相关性。
本研究表明,NSCLC影像基因组学分析影像学特征与转位基因间存在着多重相关性,该类基因代表在相应的分子通路,从而能够非侵入性的分析NSCLC的分子学特征。
原始出处:
Mu Zhou, Ann Leung, Sebastian Echegaray, et al.Non-Small Cell Lung Cancer Radiogenomics Map Identifies Relationships between Molecular and Imaging Phenotypes with Prognostic Implications.Radiology. 2017.DOI: 10.1148/radiol.2017161845
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