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这本国产期刊去年获首个影响因子,网药方向友好!河南大学这篇“药食同源”研究,网药+代谢组学双剑合璧,干湿结合拿下5分+!

生信图书馆  · 公众号  ·  · 2025-02-05 19:00

正文

哈喽各位朋友,开工大吉!新年新气象,馆长祝大家2025年文章多多发,事业学业步步高!

今天先给大家推荐一本网药友好期刊—— Journal of Future Foods ,该刊于2023年12月19日被ESCI收录, 2024年获得首个影响因子5.2 ,审稿较快(1-3个月),且对网药方向的文章友好,今天馆长就带大家看一篇来自河南大学的药食同源研究。

思路创新: 研究聚焦药食同源植物酸枣,结合网药和代谢组学,探究了酸枣仁治疗失眠的具体的作用靶点和分子机制。

干湿结合: 本研究采用动物实验与生信分析学相结合的方式,增强了研究结果的可信度。

目前,药食同源的风口已经打开,想先人一步拿到文章,可以找馆长来帮忙,无论拼手速(生信服务器),还是拼思路拼创新,对于专业团队来说都不在话下,欢迎随时来询~

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题目:应用网络药理学和代谢组学方法探讨酸枣精治疗失眠的有效成分及其作用机制

研究背景

失眠是一种常见的睡眠障碍疾病。传统中药酸枣仁(ZSS)在治疗失眠方面显示出良好的疗效,且副作用较小。本研究通过动物实验评估枣仁提取物(ZSSE)的镇静和催眠作用,并用代谢组学和网络药理学技术分析其潜在的活性成分和相关机制。


研究思路


本研究通过动物实验对ZSSE的镇静催眠作用进行了评价。此外,利用 网络药理学辅助LC-Ms/Ms分析研究ZSSE治疗失眠的潜在有效成分、候选靶点和机制。

研究结果


ZSSE对小鼠睡眠的影响


首先确定巴比妥钠的剂量阈值,150 mg/kg为阈下剂量,250 mg/kg为阈上剂量。

在直接催眠实验中,无论是高剂量(HD)、中剂量(MD)还是低剂量(LD)的ZSSE,均未使小鼠在60分钟内表现出直接的睡眠反应。

研究进一步测试了ZSSE与巴比妥酸钠(150 mg/kg)联合使用时的催眠效果。结果显示:高剂量ZSSE显示出一定的协同催眠作用,但效果有限。

与BC(空白对照)组相比,ZSSE处理组对所有小鼠的睡眠潜伏期的改善无显著差异,而PC(阳性对照)组可缩短小鼠的睡眠潜伏期。



ZSSE催眠机制的代谢组学和网络药理学研究


ZSSE的有效成分分析


通过LC-MS/MS技术鉴定ZSSE的成分包括200种。


ZSSE的潜在靶点识别


使用TCMSP数据库和Swiss靶标预测网站获取ZSSE生物活性成分对应的靶标,并使用UniProt数据库收集这些靶标的基因名称。获得369个与“失眠”相关的活性潜在靶点,通过检索和整合GeneCards、OMIM、PharmGkb、Therapeutic targets database (TTD)和DrugBank数据库获得1036个基因。将ZSSE生物活性化合物与1036个靶基因相关的369个靶点与“失眠”进行映射,得到116个共有靶基因。



活性成分与失眠靶点之间的调控网络


将ZSSE交叉靶点对应的101个活性成分和116个失眠相关靶点导入Cytoscape软件,构建“活性成分-疾病靶点”调控网络。



PPI网络和核心靶点筛选


将ZSSE治疗失眠的相关靶点导入STRING数据库,构建PPI网络。使用CytoNCA分析核心网络的拓扑结构。筛选到4个核心节点:AKT1、CAT、PTGS2和HMOX1。



GO与KEGG富集分析


对116个靶点进行GO富集分析。结果表明,ZSSE的相关靶点富集于1922个GO项,87条信号通路。表明,ZSSE对失眠的治疗作用可以通过多种途径实现。


ZSSE治疗失眠的可能信号通路


本研究采用KEGG Mapper工具获得ZSSE治疗失眠的信号通路图。ZSSE通过类固醇激素生物合成、神经活性配体-受体相互作用、HIF-1信号通路、钙信号通路、多巴胺能突触、cAMP信号通路、胆碱能突触等信号通路参与失眠的治疗。



文章小结







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