如何对细胞系里的基因表达了如指掌？

如果我们要研究细胞实验的话，其中的基本测策略就是构建质粒转入转出。但是在这些过程之前我们也要看一下这个基因在细胞系里面的基本表达情况。

那么有没有一个数据库可以在我们不做实验的情况下提前预测一下呢？答案当然是有的呀。

Cancer Cell Line Encyclopedia（CCLE）就是可做到我们想要的事情，CCLE说白了就是做了不同组织的多个细胞系的表达谱芯片，这样我们就可以通过芯片观察这些细胞系的基因表达差异了。如图即为CCLE数据库包括的细胞系个数：

这个数据库使用起来也特别的简单。我们只需要

1. 登录网站（https://portals.broadinstitute.org/ccle/home）

   
   

2.搜索基因/细胞系即可(需要注册一个账号)：

我们搜索TP53基因，就可以各个细胞系在芯片中的表达情况了：

我们选择“DOWNLOAD”就可以下载这个基因在各个细胞系里面的表达情况了。我们用excel打开即可。打开之后，我们看到的结果中，细胞系的表示方式是“细胞系名称_组织”如图即为SW480细胞的表示方式和表达情况：

如果我们需要看某个组织的全部细胞系的表达情况的话，那就把所有的数据转置一下。搜索所有包含组织关键词的细胞系就行了。

同时除了看表达，我们还可以看到这个基因在各个细胞系中突变情况：

我们选择“Show Detailed Mutation Report”即可看到这个所有细胞系的关于TP53的突变情况。

好了，今天就策到这里，至于搜索细胞系出来的结果，大家可以去看看。我们做细胞系如果有数据库的支持好不好更加的有说服力呢，另外如果你没有细胞想要买细胞的话，那通过这个数据库。是不是可以买到自己想要的细胞系呢？